More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1399 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1399  MFS permease  100 
 
 		 360 aa  701    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1098  major facilitator superfamily MFS_1  70 
 
 		 408 aa  463  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150369  normal  0.279355 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0949  major facilitator superfamily MFS_1  68.72 
 
 		 405 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  60.63 
 
 		 425 aa  385  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  60.83 
 
 		 407 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3866  major facilitator transporter  55.83 
 
 		 407 aa  373  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4007  major facilitator superfamily MFS_1  58.5 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  57.94 
 
 		 416 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  54.9 
 
 		 414 aa  363  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4025  MFS superfamily transporter transmembrane protein  54.6 
 
 		 382 aa  351  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859193  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  52.84 
 
 		 411 aa  347  1e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16360  major facilitator family transporter  51.94 
 
 		 409 aa  336  2.9999999999999997e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1030  major facilitator superfamily MFS_1  57.94 
 
 		 411 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1109  major facilitator superfamily transporter  57.66 
 
 		 411 aa  334  1e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1483  major facilitator transporter  51.12 
 
 		 403 aa  327  3e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01764  MFS transporter  51.12 
 
 		 403 aa  325  8.000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315697  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  50.14 
 
 		 402 aa  324  1e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4768  major facilitator transporter  50 
 
 		 414 aa  324  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1527  major facilitator transporter  51.53 
 
 		 399 aa  323  3e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0834146  normal  0.849966 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  52.8 
 
 		 403 aa  319  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  52.21 
 
 		 403 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3547  major facilitator superfamily MFS_1  50.7 
 
 		 399 aa  308  8e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0153034  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2453  major facilitator superfamily MFS_1  47.06 
 
 		 414 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.21371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  51.81 
 
 		 409 aa  306  2.0000000000000002e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3229  major facilitator transporter  50.7 
 
 		 405 aa  306  3e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3368  major facilitator family transporter  49 
 
 		 394 aa  295  8e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00535921  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2390  major facilitator transporter  49 
 
 		 394 aa  295  9e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2577  major facilitator transporter  49.29 
 
 		 394 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.346803  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3560  major facilitator transporter  46.8 
 
 		 411 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  48.18 
 
 		 400 aa  280  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4169  major facilitator superfamily MFS_1  49.16 
 
 		 412 aa  277  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1764  major facilitator superfamily MFS_1  48.75 
 
 		 420 aa  275  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  43.01 
 
 		 392 aa  272  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0508  major facilitator transporter  43.49 
 
 		 405 aa  272  7e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4434  major facilitator transporter  51.53 
 
 		 408 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  43.65 
 
 		 430 aa  270  4e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0508  major facilitator transporter  43.45 
 
 		 403 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3523  major facilitator transporter  43.18 
 
 		 403 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3801  major facilitator superfamily MFS_1  43.61 
 
 		 411 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2572  major facilitator transporter  48.18 
 
 		 395 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  45.21 
 
 		 406 aa  266  5.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0467  major facilitator transporter  43.61 
 
 		 407 aa  265  7e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0161213  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3983  major facilitator transporter  43.61 
 
 		 407 aa  265  7e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13230  arabinose efflux permease family protein  43.3 
 
 		 423 aa  265  8e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3857  major facilitator transporter  43.33 
 
 		 411 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03315  MFS permease  41.37 
 
 		 367 aa  262  6e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  45.71 
 
 		 422 aa  261  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  42.6 
 
 		 392 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 388 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  42.07 
 
 		 390 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  41.77 
 
 		 390 aa  255  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  41.77 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  41.77 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  41.77 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  41.77 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  41.77 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 391 aa  252  7e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4926  major facilitator superfamily MFS_1  47.91 
 
 		 409 aa  252  8.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  41.77 
 
 		 390 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  43.29 
 
 		 407 aa  251  1e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 391 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  41.95 
 
 		 388 aa  250  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  39.66 
 
 		 391 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 391 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 391 aa  248  9e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  39.39 
 
 		 416 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  45.45 
 
 		 407 aa  248  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  42.04 
 
 		 400 aa  246  4e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  45.35 
 
 		 389 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  37.29 
 
 		 386 aa  245  8e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  43.96 
 
 		 405 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  42.74 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  39.11 
 
 		 389 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  40.84 
 
 		 391 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  40.54 
 
 		 391 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  40.81 
 
 		 391 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0186  major facilitator transporter  36.94 
 
 		 388 aa  237  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840876  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  40.84 
 
 		 391 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  41.74 
 
 		 386 aa  236  6e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  39.06 
 
 		 393 aa  236  7e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  39.43 
 
 		 395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  42.77 
 
 		 405 aa  233  5e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  44.31 
 
 		 406 aa  233  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  37.67 
 
 		 399 aa  233  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  41.44 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  39.31 
 
 		 388 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  39.02 
 
 		 388 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  43.09 
 
 		 397 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  35.1 
 
 		 408 aa  229  4e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3132  major facilitator transporter  40.4 
 
 		 389 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  39.94 
 
 		 385 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3051  major facilitator transporter  40.17 
 
 		 404 aa  227  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  38.55 
 
 		 389 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  38.55 
 
 		 389 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2225  major facilitator superfamily MFS_1  43.75 
 
 		 392 aa  226  4e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1569  major facilitator superfamily MFS_1  40.4 
 
 		 408 aa  226  6e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.405148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  38.78 
 
 		 389 aa  225  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  39.83 
 
 		 388 aa  225  9e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  38.79 
 
 		 395 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  38.27 
 
 		 389 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>