More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_08020 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_08020  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 471 aa  888    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.923974  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  47.44 
 
 		 403 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  44.67 
 
 		 403 aa  265  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  44.31 
 
 		 409 aa  263  6.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1764  major facilitator superfamily MFS_1  44.39 
 
 		 420 aa  259  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3866  major facilitator transporter  42.51 
 
 		 407 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  42.34 
 
 		 402 aa  253  6e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01764  MFS transporter  43.8 
 
 		 403 aa  251  3e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315697  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  41.98 
 
 		 422 aa  244  3e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  42.78 
 
 		 407 aa  243  5e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1483  major facilitator transporter  41.03 
 
 		 403 aa  243  5e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3547  major facilitator superfamily MFS_1  44.12 
 
 		 399 aa  243  7.999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0153034  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  41.97 
 
 		 414 aa  237  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1098  major facilitator superfamily MFS_1  41.08 
 
 		 408 aa  237  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150369  normal  0.279355 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3560  major facilitator transporter  45.48 
 
 		 411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  36.09 
 
 		 399 aa  231  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4007  major facilitator superfamily MFS_1  42.54 
 
 		 419 aa  232  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2225  major facilitator superfamily MFS_1  45.38 
 
 		 392 aa  231  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4169  major facilitator superfamily MFS_1  45.07 
 
 		 412 aa  232  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0949  major facilitator superfamily MFS_1  42.42 
 
 		 405 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  42.72 
 
 		 425 aa  231  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  43.72 
 
 		 416 aa  230  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13230  arabinose efflux permease family protein  43.27 
 
 		 423 aa  229  8e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16360  major facilitator family transporter  41.77 
 
 		 409 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  36.95 
 
 		 430 aa  227  3e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  41.47 
 
 		 411 aa  225  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  43.33 
 
 		 405 aa  219  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1399  MFS permease  39.95 
 
 		 360 aa  218  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1109  major facilitator superfamily transporter  42.19 
 
 		 411 aa  217  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4025  MFS superfamily transporter transmembrane protein  42.86 
 
 		 382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859193  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2453  major facilitator superfamily MFS_1  36.61 
 
 		 414 aa  216  7e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.21371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0186  major facilitator transporter  34.41 
 
 		 388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840876  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1569  major facilitator superfamily MFS_1  40.46 
 
 		 408 aa  214  2.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.405148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1030  major facilitator superfamily MFS_1  43.59 
 
 		 411 aa  213  7e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  36.81 
 
 		 386 aa  213  7.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3229  major facilitator transporter  39.29 
 
 		 405 aa  209  7e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  41.69 
 
 		 406 aa  208  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  41.92 
 
 		 400 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  39.21 
 
 		 406 aa  208  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2636  major facilitator superfamily MFS_1  37.07 
 
 		 397 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695943 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4768  major facilitator transporter  40.89 
 
 		 414 aa  206  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4926  major facilitator superfamily MFS_1  48 
 
 		 409 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  38.11 
 
 		 407 aa  205  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2577  major facilitator transporter  39.61 
 
 		 394 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.346803  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14540  arabinose efflux permease family protein  40.99 
 
 		 440 aa  203  4e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  40.11 
 
 		 388 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3368  major facilitator family transporter  40.63 
 
 		 394 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00535921  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  39.94 
 
 		 384 aa  202  8e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2390  major facilitator transporter  39.01 
 
 		 394 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  38.42 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  39.56 
 
 		 388 aa  200  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  38.1 
 
 		 393 aa  200  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1527  major facilitator transporter  40 
 
 		 399 aa  199  7e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0834146  normal  0.849966 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  37.22 
 
 		 392 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  42.11 
 
 		 390 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  38.44 
 
 		 388 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  38.84 
 
 		 391 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  38.74 
 
 		 391 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  38.74 
 
 		 391 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4434  major facilitator transporter  45.75 
 
 		 408 aa  195  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  38.79 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  38.79 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  38.79 
 
 		 386 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  37.96 
 
 		 395 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 400 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  37.96 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 408 aa  190  5.999999999999999e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  39.33 
 
 		 386 aa  189  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2206  major facilitator superfamily MFS_1  38.5 
 
 		 391 aa  187  4e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  36.78 
 
 		 387 aa  186  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  37.43 
 
 		 393 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.985188 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 391 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  36.49 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  37.54 
 
 		 390 aa  184  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  36.93 
 
 		 391 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  35.19 
 
 		 388 aa  183  7e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0508  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 405 aa  183  7e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03315  MFS permease  35.2 
 
 		 367 aa  182  8.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  36.47 
 
 		 389 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  36.21 
 
 		 388 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  39.18 
 
 		 407 aa  182  9.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0508  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 403 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4398  major facilitator transporter  38.74 
 
 		 401 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2530  major facilitator transporter  36.63 
 
 		 408 aa  182  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3523  major facilitator transporter  36.93 
 
 		 403 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2572  major facilitator transporter  41.78 
 
 		 395 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  35.85 
 
 		 390 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3132  major facilitator transporter  35.62 
 
 		 389 aa  180  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  35.85 
 
 		 390 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  35.85 
 
 		 390 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  35.85 
 
 		 390 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  35.85 
 
 		 390 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3596  major facilitator superfamily MFS_1  38.54 
 
 		 391 aa  179  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.357847 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  34.66 
 
 		 391 aa  179  9e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  35.85 
 
 		 390 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1790  major facilitator transporter  38.67 
 
 		 388 aa  178  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0297909 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  35.39 
 
 		 388 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  35.85 
 
 		 390 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  36.62 
 
 		 391 aa  178  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  40.87 
 
 		 389 aa  178  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>