More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_3229 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_3229  major facilitator transporter  100 
 
 
405 aa  796    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  54.52 
 
 
414 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  55.78 
 
 
407 aa  377  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4025  MFS superfamily transporter transmembrane protein  54.95 
 
 
382 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859193  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  55.79 
 
 
416 aa  364  1e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  56.95 
 
 
425 aa  365  1e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16360  major facilitator family transporter  53.39 
 
 
409 aa  362  5.0000000000000005e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4007  major facilitator superfamily MFS_1  54.71 
 
 
419 aa  356  2.9999999999999997e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1098  major facilitator superfamily MFS_1  52.91 
 
 
408 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150369  normal  0.279355 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3866  major facilitator transporter  50.53 
 
 
407 aa  338  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3368  major facilitator family transporter  49.6 
 
 
394 aa  332  5e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00535921  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01764  MFS transporter  49.12 
 
 
403 aa  332  6e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315697  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  51.83 
 
 
403 aa  332  6e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0949  major facilitator superfamily MFS_1  53.05 
 
 
405 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1527  major facilitator transporter  51.88 
 
 
399 aa  330  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0834146  normal  0.849966 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2390  major facilitator transporter  49.33 
 
 
394 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1109  major facilitator superfamily transporter  55.05 
 
 
411 aa  330  3e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  50.41 
 
 
411 aa  329  4e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2577  major facilitator transporter  49.6 
 
 
394 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.346803  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1030  major facilitator superfamily MFS_1  55.05 
 
 
411 aa  329  6e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2453  major facilitator superfamily MFS_1  47.2 
 
 
414 aa  318  1e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.21371  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  48.68 
 
 
403 aa  312  6.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2572  major facilitator transporter  50.13 
 
 
395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  43.61 
 
 
402 aa  303  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1399  MFS permease  50.7 
 
 
360 aa  303  4.0000000000000003e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  46.43 
 
 
409 aa  300  3e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1483  major facilitator transporter  42.5 
 
 
403 aa  297  2e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4768  major facilitator transporter  48.11 
 
 
414 aa  290  3e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1764  major facilitator superfamily MFS_1  48.2 
 
 
420 aa  288  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3560  major facilitator transporter  43.4 
 
 
411 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4169  major facilitator superfamily MFS_1  47.5 
 
 
412 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3547  major facilitator superfamily MFS_1  46.4 
 
 
399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0153034  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  45.71 
 
 
400 aa  262  6.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  40.1 
 
 
392 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0508  major facilitator transporter  39.89 
 
 
405 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0508  major facilitator transporter  39.63 
 
 
403 aa  253  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4434  major facilitator transporter  50.26 
 
 
408 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3523  major facilitator transporter  39.36 
 
 
403 aa  252  7e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3801  major facilitator superfamily MFS_1  41.6 
 
 
411 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3983  major facilitator transporter  41.6 
 
 
407 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0467  major facilitator transporter  41.6 
 
 
407 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0161213  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3857  major facilitator transporter  41.34 
 
 
411 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4926  major facilitator superfamily MFS_1  47.55 
 
 
409 aa  251  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  41.04 
 
 
405 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  41.21 
 
 
397 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  40.51 
 
 
430 aa  246  4e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13230  arabinose efflux permease family protein  39.28 
 
 
423 aa  239  5e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.56 
 
 
388 aa  239  8e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  39.73 
 
 
400 aa  235  9e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  37.44 
 
 
395 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  37.44 
 
 
395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3051  major facilitator transporter  37.63 
 
 
404 aa  233  5e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  40.95 
 
 
422 aa  232  9e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  39 
 
 
386 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  38.67 
 
 
393 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.985188 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  38.67 
 
 
392 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3643  major facilitator transporter  44.57 
 
 
398 aa  228  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314134  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  33.42 
 
 
408 aa  227  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  41.85 
 
 
389 aa  227  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  40.48 
 
 
406 aa  226  4e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  36.6 
 
 
399 aa  225  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0186  major facilitator transporter  34.3 
 
 
388 aa  225  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840876  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03315  MFS permease  40.78 
 
 
367 aa  224  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1569  major facilitator superfamily MFS_1  38.76 
 
 
408 aa  223  6e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.405148  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  43.06 
 
 
405 aa  223  6e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  39.11 
 
 
391 aa  222  9e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  38.14 
 
 
391 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  38.66 
 
 
406 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  41.88 
 
 
406 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  36.91 
 
 
389 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  36.91 
 
 
389 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  37.88 
 
 
390 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  38.1 
 
 
391 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  38.4 
 
 
407 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  36.13 
 
 
389 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  37.68 
 
 
392 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  36.39 
 
 
389 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2206  major facilitator superfamily MFS_1  39.43 
 
 
391 aa  216  4e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  38.22 
 
 
390 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  36.46 
 
 
395 aa  216  7e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  37.57 
 
 
389 aa  215  9e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  37.89 
 
 
393 aa  215  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  37.54 
 
 
390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  37.54 
 
 
390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  35.06 
 
 
393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  35.14 
 
 
391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  37.54 
 
 
390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  37.54 
 
 
390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  37.93 
 
 
388 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  37.64 
 
 
388 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  38.48 
 
 
385 aa  213  3.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  37.57 
 
 
390 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  37.54 
 
 
390 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  34.2 
 
 
388 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  37.18 
 
 
391 aa  212  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  37.46 
 
 
391 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  37.25 
 
 
390 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  37.43 
 
 
389 aa  212  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  36.22 
 
 
404 aa  211  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  36.69 
 
 
385 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>