More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3643 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3643  major facilitator transporter  100 
 
 		 398 aa  745    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314134  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03315  MFS permease  51.87 
 
 		 367 aa  328  9e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  45.62 
 
 		 411 aa  300  3e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4768  major facilitator transporter  50.28 
 
 		 414 aa  295  7e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  48.37 
 
 		 414 aa  292  7e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  49.74 
 
 		 425 aa  291  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01764  MFS transporter  48.96 
 
 		 403 aa  278  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315697  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16360  major facilitator family transporter  47.15 
 
 		 409 aa  275  8e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  47.04 
 
 		 416 aa  275  9e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4025  MFS superfamily transporter transmembrane protein  47.03 
 
 		 382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859193  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3368  major facilitator family transporter  47.4 
 
 		 394 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00535921  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  48.64 
 
 		 403 aa  273  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2577  major facilitator transporter  47.28 
 
 		 394 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.346803  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2390  major facilitator transporter  47.12 
 
 		 394 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2453  major facilitator superfamily MFS_1  45.9 
 
 		 414 aa  270  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.21371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03150  arabinose efflux permease family protein  53.65 
 
 		 405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4007  major facilitator superfamily MFS_1  45.82 
 
 		 419 aa  269  5.9999999999999995e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0508  major facilitator transporter  41.94 
 
 		 405 aa  268  8e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  46.83 
 
 		 403 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  44.73 
 
 		 409 aa  268  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4169  major facilitator superfamily MFS_1  50.53 
 
 		 412 aa  268  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  46.49 
 
 		 407 aa  267  2.9999999999999995e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3560  major facilitator transporter  46.17 
 
 		 411 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0508  major facilitator transporter  41.73 
 
 		 403 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3523  major facilitator transporter  41.46 
 
 		 403 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1764  major facilitator superfamily MFS_1  46.11 
 
 		 420 aa  265  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3801  major facilitator superfamily MFS_1  42.13 
 
 		 411 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0467  major facilitator transporter  42.13 
 
 		 407 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0161213  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3983  major facilitator transporter  42.13 
 
 		 407 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3866  major facilitator transporter  44.85 
 
 		 407 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3857  major facilitator transporter  42.13 
 
 		 411 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4434  major facilitator transporter  51.54 
 
 		 408 aa  256  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1527  major facilitator transporter  46.4 
 
 		 399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0834146  normal  0.849966 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1098  major facilitator superfamily MFS_1  41.88 
 
 		 408 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150369  normal  0.279355 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0949  major facilitator superfamily MFS_1  43.12 
 
 		 405 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  42.13 
 
 		 402 aa  248  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1030  major facilitator superfamily MFS_1  48.08 
 
 		 411 aa  248  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3229  major facilitator transporter  43.26 
 
 		 405 aa  244  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1109  major facilitator superfamily transporter  47.53 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2572  major facilitator transporter  45.65 
 
 		 395 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3547  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 		 399 aa  239  6.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0153034  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4926  major facilitator superfamily MFS_1  48.7 
 
 		 409 aa  237  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1483  major facilitator transporter  40.46 
 
 		 403 aa  236  5.0000000000000005e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  44.94 
 
 		 422 aa  229  9e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2506  major facilitator transporter  34.61 
 
 		 401 aa  225  9e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13230  arabinose efflux permease family protein  41.69 
 
 		 423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1399  MFS permease  40.97 
 
 		 360 aa  220  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3090  major facilitator transporter  35.03 
 
 		 401 aa  216  5e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.052943 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2225  major facilitator superfamily MFS_1  43.12 
 
 		 392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  38.07 
 
 		 392 aa  210  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1569  major facilitator superfamily MFS_1  38.82 
 
 		 408 aa  209  6e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.405148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  40.64 
 
 		 430 aa  208  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  40.21 
 
 		 400 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  38.64 
 
 		 386 aa  204  3e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0186  major facilitator transporter  34.05 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840876  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  38.6 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  37.57 
 
 		 391 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  43.77 
 
 		 389 aa  199  9e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2636  major facilitator superfamily MFS_1  35.4 
 
 		 397 aa  196  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695943 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  37.18 
 
 		 385 aa  196  6e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.94 
 
 		 388 aa  195  9e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  38.14 
 
 		 391 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 391 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 392 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  36.6 
 
 		 391 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 416 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  38.14 
 
 		 391 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  38.58 
 
 		 391 aa  192  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  36.08 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  37.67 
 
 		 391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  38.32 
 
 		 391 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  35.88 
 
 		 391 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  37.64 
 
 		 390 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08020  arabinose efflux permease family protein  39.48 
 
 		 471 aa  188  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.923974  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 408 aa  189  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  37.04 
 
 		 390 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  38.55 
 
 		 386 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  38.29 
 
 		 406 aa  188  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  40.22 
 
 		 405 aa  187  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  38.25 
 
 		 400 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2254  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 390 aa  187  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.364288  normal  0.844618 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  36.75 
 
 		 390 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  36.75 
 
 		 390 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  36.75 
 
 		 390 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  39 
 
 		 405 aa  187  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  36.75 
 
 		 390 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  36.75 
 
 		 390 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  36.75 
 
 		 390 aa  186  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 		 388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3596  major facilitator superfamily MFS_1  39.05 
 
 		 391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.357847 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  35.08 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  37.77 
 
 		 390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  35.19 
 
 		 395 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  35.19 
 
 		 395 aa  183  6e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2307  major facilitator superfamily MFS_1  38.85 
 
 		 400 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17268  hitchhiker  0.00000016872 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 406 aa  182  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  35.94 
 
 		 391 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  36.99 
 
 		 407 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>