More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0508 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3857  major facilitator transporter  88.56 
 
 		 411 aa  677    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3801  major facilitator superfamily MFS_1  88.32 
 
 		 411 aa  676    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0508  major facilitator transporter  100 
 
 		 403 aa  792    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3523  major facilitator transporter  99.75 
 
 		 403 aa  791    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0467  major facilitator transporter  89.8 
 
 		 407 aa  677    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0161213  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3983  major facilitator transporter  89.8 
 
 		 407 aa  677    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0508  major facilitator transporter  97.53 
 
 		 405 aa  732    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4768  major facilitator transporter  56.06 
 
 		 414 aa  378  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4169  major facilitator superfamily MFS_1  53.45 
 
 		 412 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2506  major facilitator transporter  46.75 
 
 		 401 aa  341  1e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3090  major facilitator transporter  45.97 
 
 		 401 aa  331  2e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.052943 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1527  major facilitator transporter  47.45 
 
 		 399 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0834146  normal  0.849966 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2453  major facilitator superfamily MFS_1  45.68 
 
 		 414 aa  311  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.21371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16360  major facilitator family transporter  44.59 
 
 		 409 aa  308  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4434  major facilitator transporter  55.81 
 
 		 408 aa  305  9.000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  44.27 
 
 		 411 aa  304  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  46.87 
 
 		 407 aa  300  4e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  44.06 
 
 		 414 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1098  major facilitator superfamily MFS_1  44.68 
 
 		 408 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150369  normal  0.279355 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01764  MFS transporter  44.56 
 
 		 403 aa  291  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315697  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4007  major facilitator superfamily MFS_1  44.76 
 
 		 419 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  46.83 
 
 		 425 aa  288  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0949  major facilitator superfamily MFS_1  44.5 
 
 		 405 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3368  major facilitator family transporter  43.23 
 
 		 394 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00535921  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2390  major facilitator transporter  42.97 
 
 		 394 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2577  major facilitator transporter  43.34 
 
 		 394 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.346803  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3866  major facilitator transporter  42.46 
 
 		 407 aa  280  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  45.17 
 
 		 403 aa  271  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4025  MFS superfamily transporter transmembrane protein  43.19 
 
 		 382 aa  271  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859193  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  44.6 
 
 		 403 aa  270  4e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3560  major facilitator transporter  43.58 
 
 		 411 aa  266  4e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  41.91 
 
 		 409 aa  264  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1399  MFS permease  44.01 
 
 		 360 aa  263  4.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2572  major facilitator transporter  45.26 
 
 		 395 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1764  major facilitator superfamily MFS_1  42.52 
 
 		 420 aa  259  4e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03315  MFS permease  41.09 
 
 		 367 aa  257  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  41.62 
 
 		 416 aa  256  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3547  major facilitator superfamily MFS_1  41.75 
 
 		 399 aa  252  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0153034  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3229  major facilitator transporter  41.38 
 
 		 405 aa  251  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3643  major facilitator transporter  42.42 
 
 		 398 aa  249  6e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314134  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  42.31 
 
 		 422 aa  245  9.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  39.36 
 
 		 402 aa  243  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1483  major facilitator transporter  38.74 
 
 		 403 aa  242  9e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  36.86 
 
 		 430 aa  239  9e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13230  arabinose efflux permease family protein  38.96 
 
 		 423 aa  237  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1030  major facilitator superfamily MFS_1  43.86 
 
 		 411 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1109  major facilitator superfamily transporter  43.57 
 
 		 411 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1569  major facilitator superfamily MFS_1  38.3 
 
 		 408 aa  233  6e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.405148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2225  major facilitator superfamily MFS_1  41.35 
 
 		 392 aa  225  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  35.96 
 
 		 392 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03150  arabinose efflux permease family protein  43.38 
 
 		 405 aa  222  8e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  38.2 
 
 		 400 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0186  major facilitator transporter  34.82 
 
 		 388 aa  216  7e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840876  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4926  major facilitator superfamily MFS_1  42.2 
 
 		 409 aa  210  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  38.24 
 
 		 391 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  37 
 
 		 392 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 391 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  37.89 
 
 		 392 aa  206  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  37.46 
 
 		 390 aa  206  7e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  37.96 
 
 		 391 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  36.54 
 
 		 388 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  34.88 
 
 		 391 aa  203  3e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 388 aa  203  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  35.16 
 
 		 391 aa  203  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  36.27 
 
 		 405 aa  202  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  39.57 
 
 		 395 aa  202  9e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  35.39 
 
 		 391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14540  arabinose efflux permease family protein  40.3 
 
 		 440 aa  200  3e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  33.08 
 
 		 393 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  35.39 
 
 		 391 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.62 
 
 		 388 aa  200  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  36.6 
 
 		 390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  36.6 
 
 		 390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 		 397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  36.6 
 
 		 390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  36.6 
 
 		 390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  35.85 
 
 		 388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  36.6 
 
 		 390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  36.6 
 
 		 390 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  35.58 
 
 		 388 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  36.31 
 
 		 390 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  34.85 
 
 		 416 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  34.85 
 
 		 391 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  34.76 
 
 		 389 aa  194  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 407 aa  194  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 		 399 aa  193  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  34.28 
 
 		 406 aa  193  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  36.31 
 
 		 393 aa  193  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2636  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 		 397 aa  192  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695943 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08020  arabinose efflux permease family protein  36.6 
 
 		 471 aa  192  8e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.923974  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  35.11 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 400 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3051  major facilitator transporter  34.69 
 
 		 404 aa  191  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  34.84 
 
 		 395 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  37.4 
 
 		 390 aa  190  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 		 391 aa  189  7e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  34.34 
 
 		 391 aa  189  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  36.63 
 
 		 393 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.985188 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  33.97 
 
 		 408 aa  188  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  33.51 
 
 		 388 aa  188  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>