More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2577 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3368  major facilitator family transporter  97.72 
 
 		 394 aa  726    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00535921  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2577  major facilitator transporter  100 
 
 		 394 aa  771    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.346803  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2390  major facilitator transporter  96.95 
 
 		 394 aa  720    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2572  major facilitator transporter  89.37 
 
 		 395 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16360  major facilitator family transporter  62.95 
 
 		 409 aa  473  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1527  major facilitator transporter  63.22 
 
 		 399 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0834146  normal  0.849966 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  61.52 
 
 		 411 aa  433  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01764  MFS transporter  59.54 
 
 		 403 aa  418  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315697  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2453  major facilitator superfamily MFS_1  56.95 
 
 		 414 aa  412  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.21371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  54.42 
 
 		 407 aa  366  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  50.93 
 
 		 414 aa  363  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3866  major facilitator transporter  51.85 
 
 		 407 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4025  MFS superfamily transporter transmembrane protein  53.3 
 
 		 382 aa  354  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859193  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  54.45 
 
 		 425 aa  352  7e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  51.07 
 
 		 416 aa  346  5e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3229  major facilitator transporter  49.6 
 
 		 405 aa  338  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4007  major facilitator superfamily MFS_1  48.83 
 
 		 419 aa  337  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1098  major facilitator superfamily MFS_1  48.2 
 
 		 408 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150369  normal  0.279355 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4768  major facilitator transporter  50.68 
 
 		 414 aa  325  6e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0949  major facilitator superfamily MFS_1  48.2 
 
 		 405 aa  323  4e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  48 
 
 		 403 aa  308  9e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1109  major facilitator superfamily transporter  51.52 
 
 		 411 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1030  major facilitator superfamily MFS_1  51.8 
 
 		 411 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  49.43 
 
 		 403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1399  MFS permease  49.29 
 
 		 360 aa  301  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1483  major facilitator transporter  42.56 
 
 		 403 aa  296  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0508  major facilitator transporter  43.34 
 
 		 403 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3523  major facilitator transporter  43.08 
 
 		 403 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0508  major facilitator transporter  43.34 
 
 		 405 aa  285  8e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  46.28 
 
 		 409 aa  283  4.0000000000000003e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  42.78 
 
 		 402 aa  283  5.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1764  major facilitator superfamily MFS_1  47.63 
 
 		 420 aa  280  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4169  major facilitator superfamily MFS_1  48.12 
 
 		 412 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0467  major facilitator transporter  43.63 
 
 		 407 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0161213  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3857  major facilitator transporter  43.63 
 
 		 411 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3983  major facilitator transporter  43.63 
 
 		 407 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3801  major facilitator superfamily MFS_1  43.63 
 
 		 411 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3560  major facilitator transporter  43.62 
 
 		 411 aa  269  8e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3547  major facilitator superfamily MFS_1  45.55 
 
 		 399 aa  267  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0153034  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4434  major facilitator transporter  48.01 
 
 		 408 aa  264  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  42.44 
 
 		 392 aa  264  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13230  arabinose efflux permease family protein  41.85 
 
 		 423 aa  261  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  45.21 
 
 		 400 aa  260  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03315  MFS permease  43.25 
 
 		 367 aa  259  4e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  43.27 
 
 		 390 aa  258  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3643  major facilitator transporter  47.46 
 
 		 398 aa  257  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314134  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  43.14 
 
 		 392 aa  257  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  43.27 
 
 		 390 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  43.27 
 
 		 390 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  43.68 
 
 		 390 aa  257  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  43.27 
 
 		 390 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  43.27 
 
 		 390 aa  257  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  43.27 
 
 		 390 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  42.98 
 
 		 390 aa  255  9e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  43.39 
 
 		 388 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  43.84 
 
 		 422 aa  253  6e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  40.42 
 
 		 388 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  42.24 
 
 		 388 aa  249  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  41.6 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 391 aa  248  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0186  major facilitator transporter  38.42 
 
 		 388 aa  248  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840876  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  40.16 
 
 		 391 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  42.06 
 
 		 406 aa  248  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  39.63 
 
 		 391 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  40.16 
 
 		 391 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  39.63 
 
 		 391 aa  245  8e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  42.31 
 
 		 391 aa  245  8e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  44 
 
 		 406 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  41.69 
 
 		 392 aa  242  7e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  39.36 
 
 		 391 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  39.36 
 
 		 416 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  43.38 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3596  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 391 aa  240  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.357847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  37.77 
 
 		 399 aa  239  5.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2225  major facilitator superfamily MFS_1  42.46 
 
 		 392 aa  238  1e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 408 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2506  major facilitator transporter  36.48 
 
 		 401 aa  238  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  41.71 
 
 		 388 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  41.64 
 
 		 430 aa  238  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  41.04 
 
 		 386 aa  236  6e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  41.08 
 
 		 407 aa  235  8e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  40.4 
 
 		 391 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  42.54 
 
 		 405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  38 
 
 		 386 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  41.14 
 
 		 388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 386 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  40.71 
 
 		 391 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 386 aa  233  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 386 aa  233  3e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  40.4 
 
 		 391 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  42 
 
 		 384 aa  233  5e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  40.38 
 
 		 395 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4926  major facilitator superfamily MFS_1  46.01 
 
 		 409 aa  232  9e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  40.11 
 
 		 391 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1569  major facilitator superfamily MFS_1  38.74 
 
 		 408 aa  231  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.405148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3051  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 404 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  42.18 
 
 		 387 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  40.94 
 
 		 385 aa  229  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3090  major facilitator transporter  35.36 
 
 		 401 aa  229  6e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.052943 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  38.28 
 
 		 395 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>