More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2473 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
400 aa  749    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  48.99 
 
 
392 aa  343  4e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  48.21 
 
 
392 aa  333  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 
388 aa  330  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  49.43 
 
 
388 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  50.13 
 
 
430 aa  328  9e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  50.99 
 
 
403 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  46.49 
 
 
391 aa  327  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  49.57 
 
 
390 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  49.29 
 
 
390 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  49.29 
 
 
390 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  49.29 
 
 
390 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  49.29 
 
 
390 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  49.29 
 
 
390 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  53.27 
 
 
393 aa  323  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  51.51 
 
 
414 aa  323  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  49.57 
 
 
391 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  49 
 
 
390 aa  323  4e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  50.29 
 
 
390 aa  323  5e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  47.09 
 
 
391 aa  322  7e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  49.57 
 
 
416 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  49.57 
 
 
391 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  46.56 
 
 
391 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3132  major facilitator transporter  45.74 
 
 
389 aa  317  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  49.56 
 
 
391 aa  315  8e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  49.07 
 
 
402 aa  313  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4025  MFS superfamily transporter transmembrane protein  51.05 
 
 
382 aa  311  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859193  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  49.86 
 
 
403 aa  311  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  50.85 
 
 
405 aa  310  4e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  52.88 
 
 
425 aa  308  8e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  47.26 
 
 
397 aa  307  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  44.59 
 
 
389 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  44.59 
 
 
389 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  44.33 
 
 
389 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  46.35 
 
 
407 aa  304  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1483  major facilitator transporter  46.15 
 
 
403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  44.85 
 
 
389 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  42.78 
 
 
393 aa  303  5.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  52.42 
 
 
407 aa  302  5.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  46.53 
 
 
406 aa  301  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  50.53 
 
 
416 aa  297  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  44.09 
 
 
412 aa  295  8e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1764  major facilitator superfamily MFS_1  51.47 
 
 
420 aa  295  8e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  48.46 
 
 
406 aa  294  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1399  MFS permease  48.18 
 
 
360 aa  293  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  47.29 
 
 
389 aa  293  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3547  major facilitator superfamily MFS_1  47.34 
 
 
399 aa  293  4e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0153034  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  45.8 
 
 
391 aa  292  6e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  45.8 
 
 
391 aa  291  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3866  major facilitator transporter  45.38 
 
 
407 aa  290  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3560  major facilitator transporter  46.52 
 
 
411 aa  290  3e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16360  major facilitator family transporter  46.85 
 
 
409 aa  288  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4007  major facilitator superfamily MFS_1  49.32 
 
 
419 aa  283  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  45.31 
 
 
391 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1098  major facilitator superfamily MFS_1  46.27 
 
 
408 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150369  normal  0.279355 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4768  major facilitator transporter  46.9 
 
 
414 aa  282  7.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3229  major facilitator transporter  46.43 
 
 
405 aa  282  7.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  43.85 
 
 
395 aa  282  9e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  44.61 
 
 
385 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  44.62 
 
 
388 aa  280  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  44.99 
 
 
391 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  44.99 
 
 
391 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3170  inner membrane transport protein YdhP  46.72 
 
 
389 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0159821  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3209  major facilitator family transporter  46.72 
 
 
389 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  40 
 
 
408 aa  277  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  44.99 
 
 
391 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1917  major facilitator family transporter  46.44 
 
 
389 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214346  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2052  major facilitator family transporter  46.44 
 
 
389 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00152251  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2693  major facilitator family transporter  46.44 
 
 
389 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0861  major facilitator family transporter  46.44 
 
 
389 aa  277  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  49.58 
 
 
405 aa  276  4e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3223  major facilitator transporter  46.72 
 
 
389 aa  276  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  46.61 
 
 
388 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3368  major facilitator family transporter  45.88 
 
 
394 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00535921  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  44.09 
 
 
389 aa  275  8e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  46.61 
 
 
388 aa  275  8e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  47.4 
 
 
407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  45.89 
 
 
409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  44.86 
 
 
422 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1030  major facilitator superfamily MFS_1  51.14 
 
 
411 aa  273  3e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13230  arabinose efflux permease family protein  43.25 
 
 
423 aa  273  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2577  major facilitator transporter  45.38 
 
 
394 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.346803  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  45.38 
 
 
385 aa  274  3e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  39.6 
 
 
399 aa  273  4.0000000000000004e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2390  major facilitator transporter  45.6 
 
 
394 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3596  major facilitator superfamily MFS_1  45 
 
 
391 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.357847 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1400  major facilitator family transporter  46.15 
 
 
389 aa  273  6e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0801718  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  43.13 
 
 
388 aa  272  7e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0186  major facilitator transporter  39.41 
 
 
388 aa  272  7e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840876  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1109  major facilitator superfamily transporter  50.85 
 
 
411 aa  272  8.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  40.6 
 
 
386 aa  271  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01764  MFS transporter  44.62 
 
 
403 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315697  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  48 
 
 
389 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 
388 aa  269  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1527  major facilitator transporter  44.39 
 
 
399 aa  267  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0834146  normal  0.849966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0949  major facilitator superfamily MFS_1  45.36 
 
 
405 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  44.99 
 
 
400 aa  266  4e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  44.51 
 
 
384 aa  266  5e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  44.66 
 
 
387 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  47.67 
 
 
392 aa  265  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>