More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3492 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
416 aa  785    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4007  major facilitator superfamily MFS_1  82.55 
 
 
419 aa  559  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  78.15 
 
 
425 aa  550  1e-155  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1109  major facilitator superfamily transporter  76.72 
 
 
411 aa  519  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1030  major facilitator superfamily MFS_1  80.58 
 
 
411 aa  511  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  68.43 
 
 
414 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4025  MFS superfamily transporter transmembrane protein  72.22 
 
 
382 aa  483  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859193  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  61.6 
 
 
407 aa  422  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3866  major facilitator transporter  60.45 
 
 
407 aa  418  1e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1098  major facilitator superfamily MFS_1  60.32 
 
 
408 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150369  normal  0.279355 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1527  major facilitator transporter  57.26 
 
 
399 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0834146  normal  0.849966 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16360  major facilitator family transporter  56.99 
 
 
409 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  52.66 
 
 
411 aa  365  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0949  major facilitator superfamily MFS_1  58.06 
 
 
405 aa  364  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3229  major facilitator transporter  55.79 
 
 
405 aa  363  4e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  56.88 
 
 
403 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1399  MFS permease  57.94 
 
 
360 aa  361  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  56.88 
 
 
403 aa  353  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01764  MFS transporter  52.26 
 
 
403 aa  354  2e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315697  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4768  major facilitator transporter  57.3 
 
 
414 aa  348  8e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3368  major facilitator family transporter  51.06 
 
 
394 aa  345  7e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00535921  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2390  major facilitator transporter  50.39 
 
 
394 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2577  major facilitator transporter  50.39 
 
 
394 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.346803  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2453  major facilitator superfamily MFS_1  48.02 
 
 
414 aa  339  5e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.21371  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4169  major facilitator superfamily MFS_1  57.41 
 
 
412 aa  332  8e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2572  major facilitator transporter  53.42 
 
 
395 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  47.85 
 
 
402 aa  326  5e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  52.43 
 
 
409 aa  325  7e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1764  major facilitator superfamily MFS_1  51.44 
 
 
420 aa  321  1.9999999999999998e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1483  major facilitator transporter  47.38 
 
 
403 aa  313  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3560  major facilitator transporter  51.44 
 
 
411 aa  312  5.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13230  arabinose efflux permease family protein  48.8 
 
 
423 aa  302  6.000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4434  major facilitator transporter  57.26 
 
 
408 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3547  major facilitator superfamily MFS_1  51.6 
 
 
399 aa  299  6e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0153034  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  50.81 
 
 
405 aa  297  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4926  major facilitator superfamily MFS_1  55.59 
 
 
409 aa  293  6e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  48.85 
 
 
422 aa  290  4e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  50.14 
 
 
393 aa  287  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  50.27 
 
 
400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  45.14 
 
 
430 aa  283  4.0000000000000003e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  44.96 
 
 
392 aa  280  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  47.13 
 
 
392 aa  279  5e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  47.74 
 
 
390 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03315  MFS permease  44.2 
 
 
367 aa  276  5e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  47.46 
 
 
390 aa  275  9e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  47.46 
 
 
390 aa  275  9e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  47.46 
 
 
390 aa  275  9e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  47.46 
 
 
390 aa  275  9e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  45.03 
 
 
391 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  47.46 
 
 
390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  47.18 
 
 
390 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  46.33 
 
 
388 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  45.76 
 
 
388 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  45.36 
 
 
391 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  47.63 
 
 
397 aa  270  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  44.42 
 
 
391 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  47.61 
 
 
390 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  45.08 
 
 
391 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  42.18 
 
 
408 aa  268  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  44.16 
 
 
416 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2225  major facilitator superfamily MFS_1  48.32 
 
 
392 aa  265  8.999999999999999e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  44.81 
 
 
391 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  40.87 
 
 
399 aa  263  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 
386 aa  261  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  45.9 
 
 
391 aa  260  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  44.7 
 
 
407 aa  259  8e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  46.22 
 
 
392 aa  259  9e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  45.93 
 
 
406 aa  258  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  47.18 
 
 
385 aa  258  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0508  major facilitator transporter  41.52 
 
 
403 aa  257  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0508  major facilitator transporter  42.02 
 
 
405 aa  257  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3523  major facilitator transporter  41.27 
 
 
403 aa  256  5e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  44 
 
 
389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3643  major facilitator transporter  49.46 
 
 
398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314134  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  46.48 
 
 
406 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  44 
 
 
389 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  44 
 
 
389 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2636  major facilitator superfamily MFS_1  39.84 
 
 
397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.695943 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0467  major facilitator transporter  42.39 
 
 
407 aa  253  6e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0161213  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3983  major facilitator transporter  42.39 
 
 
407 aa  253  6e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  44.96 
 
 
385 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  45.16 
 
 
384 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0186  major facilitator transporter  38.28 
 
 
388 aa  251  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840876  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3801  major facilitator superfamily MFS_1  43.54 
 
 
411 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  46.15 
 
 
405 aa  252  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  43.19 
 
 
389 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3857  major facilitator transporter  43.54 
 
 
411 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  46.7 
 
 
391 aa  249  6e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  49 
 
 
389 aa  248  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  42.21 
 
 
389 aa  247  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  41.78 
 
 
388 aa  247  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  44.74 
 
 
388 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  41.78 
 
 
412 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  44.74 
 
 
388 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  46.2 
 
 
389 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  46.13 
 
 
391 aa  246  6e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  45.15 
 
 
407 aa  245  9e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  41.91 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1400  major facilitator family transporter  47.74 
 
 
389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0801718  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  44.94 
 
 
390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>