More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3090 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2506  major facilitator transporter  93.02 
 
 		 401 aa  724    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3090  major facilitator transporter  100 
 
 		 401 aa  795    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.052943 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3983  major facilitator transporter  47.37 
 
 		 407 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3857  major facilitator transporter  47.37 
 
 		 411 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0467  major facilitator transporter  47.37 
 
 		 407 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0161213  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0508  major facilitator transporter  46.17 
 
 		 405 aa  323  3e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3801  major facilitator superfamily MFS_1  47.37 
 
 		 411 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0508  major facilitator transporter  46.09 
 
 		 403 aa  319  5e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3523  major facilitator transporter  45.82 
 
 		 403 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4768  major facilitator transporter  40.11 
 
 		 414 aa  276  6e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1098  major facilitator superfamily MFS_1  38.21 
 
 		 408 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150369  normal  0.279355 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4169  major facilitator superfamily MFS_1  38.99 
 
 		 412 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16360  major facilitator family transporter  39.79 
 
 		 409 aa  256  5e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0949  major facilitator superfamily MFS_1  38.44 
 
 		 405 aa  255  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2453  major facilitator superfamily MFS_1  37.94 
 
 		 414 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.21371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  36.69 
 
 		 411 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1527  major facilitator transporter  38.34 
 
 		 399 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0834146  normal  0.849966 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01764  MFS transporter  36.48 
 
 		 403 aa  246  6.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315697  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  36.06 
 
 		 414 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03315  MFS permease  38.29 
 
 		 367 aa  239  5e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  39.2 
 
 		 407 aa  236  7e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  37.63 
 
 		 425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4434  major facilitator transporter  39.74 
 
 		 408 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2390  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 394 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  37.74 
 
 		 416 aa  229  6e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3368  major facilitator family transporter  35.79 
 
 		 394 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00535921  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3866  major facilitator transporter  35.11 
 
 		 407 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  39.71 
 
 		 403 aa  227  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2577  major facilitator transporter  35.36 
 
 		 394 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.346803  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  38.04 
 
 		 403 aa  225  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1399  MFS permease  37.53 
 
 		 360 aa  223  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4025  MFS superfamily transporter transmembrane protein  34.22 
 
 		 382 aa  219  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859193  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4007  major facilitator superfamily MFS_1  36.59 
 
 		 419 aa  217  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2572  major facilitator transporter  38.59 
 
 		 395 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1109  major facilitator superfamily transporter  37.29 
 
 		 411 aa  206  8e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  36.11 
 
 		 402 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1483  major facilitator transporter  35.85 
 
 		 403 aa  204  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13230  arabinose efflux permease family protein  35.29 
 
 		 423 aa  204  3e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3643  major facilitator transporter  35.69 
 
 		 398 aa  204  3e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0314134  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.16 
 
 		 388 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1030  major facilitator superfamily MFS_1  37.29 
 
 		 411 aa  203  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  34.68 
 
 		 405 aa  202  6e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 		 388 aa  202  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  35.96 
 
 		 422 aa  201  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3547  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 		 399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0153034  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 		 386 aa  201  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 391 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0186  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 388 aa  199  5e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840876  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 391 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 392 aa  199  7e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 391 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  33.14 
 
 		 388 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 391 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  34.01 
 
 		 390 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  34.01 
 
 		 390 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  34.01 
 
 		 390 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  34.01 
 
 		 390 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  33.62 
 
 		 390 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 416 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 391 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 390 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  34.39 
 
 		 430 aa  195  9e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  33.72 
 
 		 390 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 390 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  33.69 
 
 		 400 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  32.53 
 
 		 409 aa  193  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03150  arabinose efflux permease family protein  34.99 
 
 		 405 aa  193  5e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2636  major facilitator superfamily MFS_1  34.78 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695943 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  34.39 
 
 		 395 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 406 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  33.53 
 
 		 391 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  34.28 
 
 		 406 aa  190  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  33.53 
 
 		 391 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2225  major facilitator superfamily MFS_1  36.51 
 
 		 392 aa  189  8e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 391 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1764  major facilitator superfamily MFS_1  35.65 
 
 		 420 aa  189  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1569  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 408 aa  188  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.405148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 391 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3560  major facilitator transporter  34.25 
 
 		 411 aa  188  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 		 399 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3051  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 404 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 391 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 		 385 aa  187  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  31.76 
 
 		 395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 395 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3229  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 405 aa  182  8.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  33.62 
 
 		 390 aa  182  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  32.2 
 
 		 400 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 389 aa  179  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 407 aa  179  7e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1134  major facilitator transporter  37.92 
 
 		 408 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 389 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4398  major facilitator transporter  38.29 
 
 		 401 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1146  major facilitator transporter  37.29 
 
 		 401 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668538  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0774  major facilitator transporter  37.55 
 
 		 401 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1227  major facilitator transporter  37.55 
 
 		 401 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.309225 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1255  major facilitator transporter  37.55 
 
 		 401 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2696  major facilitator superfamily MFS_1  38.65 
 
 		 400 aa  176  9e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 384 aa  176  9e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1790  major facilitator transporter  36.43 
 
 		 388 aa  175  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0297909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>