More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0949 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0949  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 405 aa  791    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1098  major facilitator superfamily MFS_1  94.53 
 
 		 408 aa  704    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150369  normal  0.279355 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1399  MFS permease  68.72 
 
 		 360 aa  461  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2119  major facilitator transporter  62.83 
 
 		 407 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.590316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  55.81 
 
 		 414 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3866  major facilitator transporter  56.85 
 
 		 407 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4007  major facilitator superfamily MFS_1  59.59 
 
 		 419 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  52.32 
 
 		 411 aa  386  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  60.22 
 
 		 425 aa  388  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4025  MFS superfamily transporter transmembrane protein  57.99 
 
 		 382 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859193  normal  0.923305 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  58.06 
 
 		 416 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16360  major facilitator family transporter  53.02 
 
 		 409 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4768  major facilitator transporter  53.37 
 
 		 414 aa  359  6e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  55.12 
 
 		 403 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  54.85 
 
 		 403 aa  356  5e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01764  MFS transporter  52.25 
 
 		 403 aa  347  2e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315697  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1109  major facilitator superfamily transporter  56.27 
 
 		 411 aa  345  1e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3229  major facilitator transporter  53.05 
 
 		 405 aa  344  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1030  major facilitator superfamily MFS_1  58.02 
 
 		 411 aa  343  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1527  major facilitator transporter  50.41 
 
 		 399 aa  338  7e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0834146  normal  0.849966 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3368  major facilitator family transporter  48.2 
 
 		 394 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00535921  normal  0.0620649 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4169  major facilitator superfamily MFS_1  53.79 
 
 		 412 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2390  major facilitator transporter  48.2 
 
 		 394 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1483  major facilitator transporter  48.08 
 
 		 403 aa  334  1e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2577  major facilitator transporter  48.2 
 
 		 394 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.346803  normal  0.505288 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  47.4 
 
 		 402 aa  330  2e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2453  major facilitator superfamily MFS_1  47.48 
 
 		 414 aa  330  4e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.21371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  49.23 
 
 		 409 aa  318  1e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3547  major facilitator superfamily MFS_1  51.6 
 
 		 399 aa  318  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0153034  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2572  major facilitator transporter  47.56 
 
 		 395 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3560  major facilitator transporter  49.46 
 
 		 411 aa  310  4e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4434  major facilitator transporter  54.79 
 
 		 408 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1764  major facilitator superfamily MFS_1  49.26 
 
 		 420 aa  308  1.0000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0508  major facilitator transporter  44.27 
 
 		 405 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3983  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 407 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0467  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 407 aa  300  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0161213  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  45.77 
 
 		 430 aa  300  3e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3801  major facilitator superfamily MFS_1  46.15 
 
 		 411 aa  300  3e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0888448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3857  major facilitator transporter  45.89 
 
 		 411 aa  299  6e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0508  major facilitator transporter  44.86 
 
 		 403 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3523  major facilitator transporter  44.59 
 
 		 403 aa  293  3e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13230  arabinose efflux permease family protein  46.52 
 
 		 423 aa  290  2e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  47 
 
 		 422 aa  286  7e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  41.76 
 
 		 392 aa  280  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  46.9 
 
 		 393 aa  270  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  43.92 
 
 		 406 aa  270  4e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03315  MFS permease  39.44 
 
 		 367 aa  270  5e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  44.35 
 
 		 390 aa  269  5e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  43.77 
 
 		 390 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  43.77 
 
 		 390 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  43.77 
 
 		 390 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  43.77 
 
 		 390 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  43.77 
 
 		 390 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  43.77 
 
 		 390 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  42.21 
 
 		 392 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  43.77 
 
 		 390 aa  266  7e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2506  major facilitator transporter  38.93 
 
 		 401 aa  263  3e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3090  major facilitator transporter  39.47 
 
 		 401 aa  263  4e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.052943 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  43.46 
 
 		 407 aa  263  4.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  41.33 
 
 		 391 aa  262  6e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4926  major facilitator superfamily MFS_1  50.81 
 
 		 409 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.738852  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  41.01 
 
 		 391 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  38.68 
 
 		 408 aa  261  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  44.86 
 
 		 400 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  41.78 
 
 		 405 aa  260  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  41.29 
 
 		 391 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  41.02 
 
 		 391 aa  260  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  45.56 
 
 		 406 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  41.91 
 
 		 388 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  42.2 
 
 		 388 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  39.7 
 
 		 416 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  41.02 
 
 		 391 aa  256  7e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  42.98 
 
 		 400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  44.04 
 
 		 407 aa  254  3e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  44 
 
 		 391 aa  249  9e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  40.6 
 
 		 399 aa  247  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0186  major facilitator transporter  38.8 
 
 		 388 aa  245  8e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840876  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  41.16 
 
 		 397 aa  245  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2225  major facilitator superfamily MFS_1  44.41 
 
 		 392 aa  245  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  39.95 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  43.14 
 
 		 391 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08020  arabinose efflux permease family protein  42.82 
 
 		 471 aa  244  3e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.923974  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  43.43 
 
 		 391 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  37.93 
 
 		 393 aa  243  5e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  40.86 
 
 		 391 aa  242  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3132  major facilitator transporter  41.21 
 
 		 389 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  38.59 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  39.3 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  39.3 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01627  putative transport protein (MFS family)  40.21 
 
 		 389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1983  major facilitator superfamily MFS_1  40.21 
 
 		 389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  44.16 
 
 		 405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1870  major facilitator transporter  40.21 
 
 		 389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1972  major facilitator transporter  40.21 
 
 		 389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01617  hypothetical protein  40.21 
 
 		 389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1736  major facilitator transporter  40.21 
 
 		 389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000269291  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  38.08 
 
 		 386 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1541  major facilitator transporter  40.21 
 
 		 389 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.114044 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  43.71 
 
 		 389 aa  239  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1341  major facilitator superfamily MFS_1  41.25 
 
 		 400 aa  239  5e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>