More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1341 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1341  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 400 aa  742    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  50.85 
 
 		 405 aa  301  2e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  48.11 
 
 		 392 aa  297  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  49.48 
 
 		 405 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  46.5 
 
 		 430 aa  290  4e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  50.42 
 
 		 406 aa  289  6e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  48.18 
 
 		 392 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  47.73 
 
 		 393 aa  284  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  44.53 
 
 		 406 aa  284  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  42.89 
 
 		 399 aa  283  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  47.51 
 
 		 388 aa  283  5.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  49.58 
 
 		 400 aa  282  9e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  46.35 
 
 		 391 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  48.31 
 
 		 397 aa  279  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  45.18 
 
 		 407 aa  278  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  47.42 
 
 		 407 aa  277  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  41.92 
 
 		 386 aa  276  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  48.61 
 
 		 390 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  48.61 
 
 		 390 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  48.61 
 
 		 390 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  48.61 
 
 		 390 aa  276  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  48.61 
 
 		 390 aa  275  7e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  48.61 
 
 		 390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  42.74 
 
 		 408 aa  275  1.0000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  46.87 
 
 		 395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  46.02 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  48.33 
 
 		 390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0186  major facilitator transporter  39.85 
 
 		 388 aa  273  4.0000000000000004e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.840876  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  46.87 
 
 		 395 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  47.92 
 
 		 390 aa  272  7e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  47.25 
 
 		 391 aa  272  9e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  46.11 
 
 		 388 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  46.98 
 
 		 391 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  50.42 
 
 		 389 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  40.62 
 
 		 393 aa  270  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  47.95 
 
 		 391 aa  270  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  45.83 
 
 		 388 aa  270  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  46.28 
 
 		 389 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  46.98 
 
 		 391 aa  269  7e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  46.98 
 
 		 416 aa  269  8e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  47.44 
 
 		 391 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  45.57 
 
 		 395 aa  268  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 386 aa  267  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13230  arabinose efflux permease family protein  43.59 
 
 		 423 aa  268  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  47.31 
 
 		 391 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  45.1 
 
 		 391 aa  265  1e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3051  major facilitator transporter  46.63 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  47.74 
 
 		 391 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  43.38 
 
 		 403 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  43.01 
 
 		 402 aa  261  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  42.45 
 
 		 388 aa  259  7e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2307  major facilitator superfamily MFS_1  48.26 
 
 		 400 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17268  hitchhiker  0.00000016872 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  46.7 
 
 		 393 aa  257  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.985188 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  43.63 
 
 		 414 aa  256  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  46.03 
 
 		 409 aa  255  7e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  41.56 
 
 		 389 aa  255  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  42.42 
 
 		 388 aa  255  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  41.56 
 
 		 389 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4398  major facilitator transporter  48.03 
 
 		 401 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  41.56 
 
 		 389 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1483  major facilitator transporter  41.15 
 
 		 403 aa  255  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  41.56 
 
 		 389 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  42.42 
 
 		 388 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1227  major facilitator transporter  49.07 
 
 		 401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.309225 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  44.86 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0774  major facilitator transporter  49.07 
 
 		 401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1255  major facilitator transporter  49.07 
 
 		 401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2696  major facilitator superfamily MFS_1  48.38 
 
 		 400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1146  major facilitator transporter  48.92 
 
 		 401 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668538  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2636  major facilitator superfamily MFS_1  39.47 
 
 		 397 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1201  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 383 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.915784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1134  major facilitator transporter  48.62 
 
 		 408 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  43.35 
 
 		 385 aa  249  5e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  42.57 
 
 		 389 aa  249  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2061  major facilitator transporter  48.01 
 
 		 401 aa  249  7e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1098  major facilitator superfamily MFS_1  41.01 
 
 		 408 aa  249  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.150369  normal  0.279355 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3492  major facilitator superfamily transporter  44.22 
 
 		 416 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193328  normal  0.492454 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  46.29 
 
 		 400 aa  247  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  40.66 
 
 		 396 aa  246  6e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  44.94 
 
 		 391 aa  245  8e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1790  major facilitator transporter  46.02 
 
 		 388 aa  244  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0297909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  45 
 
 		 386 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  45 
 
 		 386 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  45 
 
 		 386 aa  245  9.999999999999999e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  43.02 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  45.23 
 
 		 425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  45.19 
 
 		 392 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  42.82 
 
 		 388 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9235  major facilitator family transporter  46.72 
 
 		 408 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  42.12 
 
 		 409 aa  243  5e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  42.63 
 
 		 412 aa  243  6e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  42.82 
 
 		 388 aa  242  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  43.09 
 
 		 406 aa  242  7.999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0949  major facilitator superfamily MFS_1  41.25 
 
 		 405 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4007  major facilitator superfamily MFS_1  43.83 
 
 		 419 aa  242  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1917  major facilitator family transporter  45.89 
 
 		 389 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214346  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  48.08 
 
 		 390 aa  241  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2052  major facilitator family transporter  45.89 
 
 		 389 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00152251  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0861  major facilitator family transporter  45.89 
 
 		 389 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2693  major facilitator family transporter  45.89 
 
 		 389 aa  242  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>