More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2718 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  100 
 
 
409 aa  773    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  79.59 
 
 
396 aa  565  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  57.77 
 
 
404 aa  435  1e-121  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  57.4 
 
 
404 aa  431  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  56.88 
 
 
404 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  56.88 
 
 
404 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  56.88 
 
 
404 aa  429  1e-119  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  57.14 
 
 
404 aa  430  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  56.88 
 
 
404 aa  429  1e-119  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  56.36 
 
 
404 aa  428  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  56.88 
 
 
404 aa  429  1e-119  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  56.36 
 
 
404 aa  428  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  57.14 
 
 
404 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  56.36 
 
 
415 aa  428  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  56.36 
 
 
415 aa  427  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  60.1 
 
 
400 aa  425  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  57.14 
 
 
394 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  58.35 
 
 
400 aa  414  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  58.88 
 
 
398 aa  414  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  59.13 
 
 
397 aa  403  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  57.47 
 
 
391 aa  398  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  56.96 
 
 
391 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  61.76 
 
 
401 aa  398  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  60.48 
 
 
404 aa  396  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  56.96 
 
 
391 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  56.96 
 
 
391 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  58.03 
 
 
400 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  56.7 
 
 
391 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  56.19 
 
 
391 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  56.99 
 
 
400 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  56.99 
 
 
400 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  57.51 
 
 
400 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  56.99 
 
 
400 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1153  putative transmembrane efflux transmembrane protein  60.1 
 
 
400 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.351745 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  56.62 
 
 
400 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  56.62 
 
 
400 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5034  major facilitator transporter  60.05 
 
 
403 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35900  chloramphenicol resistance protein  55.59 
 
 
392 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0286  major facilitator superfamily transporter  61.98 
 
 
400 aa  372  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0700  major facilitator superfamily transporter  55.38 
 
 
394 aa  361  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02795  Major facilitator superfamily MFS_1  59.6 
 
 
317 aa  336  5e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  53.59 
 
 
390 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  53.59 
 
 
390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  53.59 
 
 
390 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  53.59 
 
 
390 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  53.59 
 
 
390 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  53.31 
 
 
390 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  53.59 
 
 
390 aa  326  5e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  52.21 
 
 
392 aa  325  7e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  50.13 
 
 
391 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  50.26 
 
 
391 aa  319  7e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  52.76 
 
 
390 aa  318  9e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  50.39 
 
 
391 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  50.26 
 
 
388 aa  317  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  50.13 
 
 
405 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  49.72 
 
 
388 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  49.48 
 
 
391 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  49.61 
 
 
389 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  49.87 
 
 
389 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  49.87 
 
 
389 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  49.87 
 
 
389 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  49.35 
 
 
397 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  48.83 
 
 
416 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  48.83 
 
 
391 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  51.16 
 
 
391 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  49.87 
 
 
389 aa  294  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  44.67 
 
 
392 aa  292  9e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0377  arabinose efflux permease  45.87 
 
 
391 aa  290  4e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000232651  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1400  major facilitator family transporter  49.87 
 
 
389 aa  288  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0801718  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  47.34 
 
 
385 aa  287  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3223  major facilitator transporter  49.74 
 
 
389 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3170  inner membrane transport protein YdhP  49.74 
 
 
389 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0159821  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3209  major facilitator family transporter  49.74 
 
 
389 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  50 
 
 
393 aa  286  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2052  major facilitator family transporter  49.48 
 
 
389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00152251  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2693  major facilitator family transporter  49.48 
 
 
389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1917  major facilitator family transporter  49.48 
 
 
389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214346  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0861  major facilitator family transporter  49.48 
 
 
389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  47.01 
 
 
385 aa  279  5e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  44.25 
 
 
406 aa  279  6e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  47.01 
 
 
389 aa  276  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  47.26 
 
 
392 aa  276  5e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  43.59 
 
 
407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  47.9 
 
 
406 aa  273  3e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  47.49 
 
 
407 aa  274  3e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  46.3 
 
 
388 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  42.05 
 
 
408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  46.03 
 
 
388 aa  270  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  48.18 
 
 
386 aa  270  5e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  48.18 
 
 
386 aa  270  5e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  48.18 
 
 
386 aa  270  5e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  44.97 
 
 
378 aa  269  5.9999999999999995e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  44.57 
 
 
406 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  43.14 
 
 
395 aa  268  1e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  45.45 
 
 
391 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  44.27 
 
 
388 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  45.03 
 
 
388 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  39.75 
 
 
393 aa  265  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  46.13 
 
 
391 aa  264  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  45.58 
 
 
391 aa  263  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0196377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>