More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9235 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9235  major facilitator family transporter  100 
 
 		 408 aa  774    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  61.28 
 
 		 393 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  50.25 
 
 		 392 aa  372  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  51.71 
 
 		 391 aa  363  4e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  53.41 
 
 		 392 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  53.07 
 
 		 388 aa  358  6e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  52.63 
 
 		 390 aa  356  5e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  51.58 
 
 		 390 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  51.75 
 
 		 391 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  51.58 
 
 		 390 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  51.05 
 
 		 391 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  50.13 
 
 		 391 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  51.32 
 
 		 390 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  51.32 
 
 		 390 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  51.32 
 
 		 390 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  51.32 
 
 		 390 aa  352  5e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  52.23 
 
 		 388 aa  352  7e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  51.32 
 
 		 390 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  50.4 
 
 		 416 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  50.4 
 
 		 391 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  51.65 
 
 		 406 aa  340  2.9999999999999998e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  50.67 
 
 		 391 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  54.22 
 
 		 407 aa  335  5.999999999999999e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  52.09 
 
 		 397 aa  334  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  45.03 
 
 		 393 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3132  major facilitator transporter  49.22 
 
 		 389 aa  326  6e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  50 
 
 		 389 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  52.65 
 
 		 406 aa  325  8.000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  51.82 
 
 		 405 aa  325  9e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  51.69 
 
 		 388 aa  322  5e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  51.69 
 
 		 388 aa  322  6e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  49.74 
 
 		 389 aa  322  8e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  49.74 
 
 		 389 aa  322  8e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  49.47 
 
 		 389 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  53.42 
 
 		 407 aa  315  9.999999999999999e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  49.06 
 
 		 385 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  48.67 
 
 		 388 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  49.2 
 
 		 388 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  48.44 
 
 		 388 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  46.25 
 
 		 430 aa  310  4e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  48.18 
 
 		 388 aa  308  8e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3223  major facilitator transporter  51.32 
 
 		 389 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3209  major facilitator family transporter  51.05 
 
 		 389 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3170  inner membrane transport protein YdhP  51.05 
 
 		 389 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0159821  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  48.79 
 
 		 412 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  49.3 
 
 		 387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  50.14 
 
 		 389 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  50.26 
 
 		 389 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2052  major facilitator family transporter  50.79 
 
 		 389 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00152251  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2693  major facilitator family transporter  50.79 
 
 		 389 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1917  major facilitator family transporter  50.79 
 
 		 389 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214346  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0861  major facilitator family transporter  50.79 
 
 		 389 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  49.86 
 
 		 406 aa  301  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1400  major facilitator family transporter  50.79 
 
 		 389 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0801718  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  45.09 
 
 		 408 aa  300  3e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  49.43 
 
 		 386 aa  296  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  49.43 
 
 		 386 aa  296  3e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  49.43 
 
 		 386 aa  296  3e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  47.95 
 
 		 385 aa  291  1e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  43.73 
 
 		 396 aa  288  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  48.17 
 
 		 384 aa  288  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  40.78 
 
 		 415 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  40.78 
 
 		 404 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  40.78 
 
 		 404 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  41.04 
 
 		 404 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  40.78 
 
 		 415 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  45.45 
 
 		 388 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  40.78 
 
 		 404 aa  281  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  41.04 
 
 		 404 aa  281  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  43.28 
 
 		 399 aa  280  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 409 aa  280  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2530  major facilitator transporter  44.17 
 
 		 408 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  45.89 
 
 		 378 aa  280  4e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4052  major facilitator transporter  49.58 
 
 		 388 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0787542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  43.04 
 
 		 391 aa  278  1e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4357  major facilitator family transporter  49.3 
 
 		 388 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  43.12 
 
 		 402 aa  276  3e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2473  major facilitator superfamily MFS_1  47.7 
 
 		 400 aa  276  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.852555  normal  0.95033 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  42.53 
 
 		 386 aa  276  4e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  44.58 
 
 		 388 aa  276  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1483  major facilitator transporter  43.8 
 
 		 403 aa  276  6e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  43.26 
 
 		 404 aa  276  7e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  44.99 
 
 		 391 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  42.05 
 
 		 391 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  39.74 
 
 		 404 aa  275  9e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  44.99 
 
 		 391 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  42.31 
 
 		 391 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  45.56 
 
 		 395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  42.05 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  42.31 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  42.05 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  41.04 
 
 		 394 aa  273  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  39.48 
 
 		 404 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  39.48 
 
 		 404 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  39.48 
 
 		 404 aa  273  3e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  39.48 
 
 		 404 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  47.29 
 
 		 391 aa  273  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  39.48 
 
 		 404 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  47.01 
 
 		 391 aa  271  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  47.85 
 
 		 390 aa  271  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>