More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3209 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2052  major facilitator family transporter  99.49 
 
 
389 aa  737    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00152251  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3223  major facilitator transporter  99.49 
 
 
389 aa  737    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1400  major facilitator family transporter  96.4 
 
 
389 aa  636    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0801718  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3170  inner membrane transport protein YdhP  100 
 
 
389 aa  740    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0159821  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2693  major facilitator family transporter  99.49 
 
 
389 aa  737    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3209  major facilitator family transporter  100 
 
 
389 aa  740    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1917  major facilitator family transporter  99.49 
 
 
389 aa  737    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214346  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0861  major facilitator family transporter  99.49 
 
 
389 aa  737    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  85.45 
 
 
389 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  85.71 
 
 
389 aa  597  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  85.45 
 
 
389 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  85.45 
 
 
389 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  86.75 
 
 
389 aa  578  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  80.49 
 
 
388 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  80.76 
 
 
388 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  77.72 
 
 
385 aa  523  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  62.72 
 
 
390 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  64.92 
 
 
389 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  62.47 
 
 
390 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  62.47 
 
 
390 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  62.47 
 
 
390 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  62.47 
 
 
390 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  62.21 
 
 
390 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  62.21 
 
 
390 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  61.44 
 
 
390 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  63.23 
 
 
388 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  63.69 
 
 
388 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  62.7 
 
 
392 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  59.23 
 
 
391 aa  433  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  60.32 
 
 
391 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  59.58 
 
 
391 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  59.79 
 
 
391 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  59.79 
 
 
391 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  59.79 
 
 
416 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  56.73 
 
 
408 aa  416  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  59.68 
 
 
391 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  61.14 
 
 
412 aa  410  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  61.69 
 
 
391 aa  391  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  61.41 
 
 
391 aa  389  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  56.56 
 
 
388 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  58.82 
 
 
388 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  58.24 
 
 
385 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  58.82 
 
 
388 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  55.78 
 
 
388 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  57.26 
 
 
391 aa  383  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  58.82 
 
 
387 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3596  major facilitator superfamily MFS_1  60.6 
 
 
391 aa  375  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.357847 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  52.71 
 
 
392 aa  372  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  55.22 
 
 
397 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  59.54 
 
 
386 aa  364  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  59.54 
 
 
386 aa  364  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  59.54 
 
 
386 aa  364  1e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  57.14 
 
 
384 aa  363  2e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  52.33 
 
 
388 aa  358  8e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  53.96 
 
 
405 aa  354  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4357  major facilitator family transporter  58.82 
 
 
388 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  51.69 
 
 
395 aa  348  1e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4052  major facilitator transporter  58.82 
 
 
388 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0787542  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  55.24 
 
 
393 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2502  major facilitator transporter  57.49 
 
 
382 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405786  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  49.74 
 
 
409 aa  331  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  50.98 
 
 
378 aa  328  1.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  52.01 
 
 
391 aa  325  6e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  48.9 
 
 
391 aa  324  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  52.01 
 
 
391 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  45.45 
 
 
393 aa  324  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  51.72 
 
 
391 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  52.21 
 
 
390 aa  320  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1201  major facilitator transporter  49.13 
 
 
383 aa  318  1e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.915784  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  50.28 
 
 
406 aa  317  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  49.3 
 
 
400 aa  312  5.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  51.66 
 
 
392 aa  312  6.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  49.09 
 
 
406 aa  311  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  47.56 
 
 
396 aa  310  4e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  48.2 
 
 
400 aa  309  5e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  45.36 
 
 
388 aa  309  6.999999999999999e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9235  major facilitator family transporter  51.06 
 
 
408 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  48.45 
 
 
407 aa  307  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  45.8 
 
 
395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  45.53 
 
 
395 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  46.63 
 
 
391 aa  305  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  46.37 
 
 
391 aa  305  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  46.63 
 
 
391 aa  305  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  47.04 
 
 
400 aa  305  8.000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  46.37 
 
 
391 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  46.37 
 
 
391 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  46.02 
 
 
391 aa  300  3e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  45.63 
 
 
393 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.985188 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  47.37 
 
 
397 aa  299  5e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  49.29 
 
 
389 aa  298  8e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  50.42 
 
 
406 aa  297  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  42.78 
 
 
404 aa  295  1e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3132  major facilitator transporter  46.19 
 
 
389 aa  294  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1870  major facilitator transporter  46.97 
 
 
389 aa  293  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971933  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1983  major facilitator superfamily MFS_1  46.97 
 
 
389 aa  293  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1736  major facilitator transporter  46.97 
 
 
389 aa  293  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000269291  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2530  major facilitator transporter  45.3 
 
 
408 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  47.16 
 
 
400 aa  294  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1972  major facilitator transporter  46.97 
 
 
389 aa  293  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01617  hypothetical protein  46.97 
 
 
389 aa  293  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>