More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_23780 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_23780  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 394 aa  741    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5751  major facilitator superfamily MFS_1  62.8 
 
 		 395 aa  415  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.912985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5394  major facilitator transporter  56.61 
 
 		 396 aa  331  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0326407  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7927  major facilitator transporter  41.06 
 
 		 409 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.437479  normal  0.239391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0384  major facilitator superfamily MFS_1  40.4 
 
 		 411 aa  217  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2530  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 408 aa  203  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  34.17 
 
 		 392 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  37.02 
 
 		 390 aa  194  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  37.71 
 
 		 390 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  37.18 
 
 		 390 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  37.18 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  37.18 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  37.18 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  37.18 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  36.01 
 
 		 391 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  37.18 
 
 		 390 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  36.41 
 
 		 406 aa  189  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  36.01 
 
 		 391 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  36.01 
 
 		 416 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  35.82 
 
 		 391 aa  188  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  36.24 
 
 		 407 aa  187  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  35.57 
 
 		 391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 391 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4500  major facilitator superfamily transporter  32.9 
 
 		 405 aa  182  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 406 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  35.62 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  35.08 
 
 		 389 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  35.08 
 
 		 389 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 392 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  34.78 
 
 		 391 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0795  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 403 aa  179  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 389 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 388 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  36.78 
 
 		 406 aa  178  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 388 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 		 407 aa  176  8e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  34.63 
 
 		 389 aa  176  9e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0958  major facilitator superfamily transporter  32.04 
 
 		 399 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.596734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1341  major facilitator superfamily MFS_1  37.97 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.590301  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  33.62 
 
 		 385 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  35.03 
 
 		 405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  35.54 
 
 		 389 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 408 aa  173  5e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  36.26 
 
 		 430 aa  173  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  36.74 
 
 		 397 aa  172  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  37.25 
 
 		 393 aa  172  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24770  arabinose efflux permease family protein  34.4 
 
 		 419 aa  171  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.131097  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  36.68 
 
 		 405 aa  169  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  33.07 
 
 		 388 aa  168  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  36.77 
 
 		 396 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  34.17 
 
 		 391 aa  166  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  35.38 
 
 		 384 aa  166  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  36.17 
 
 		 409 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  36.93 
 
 		 403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02795  Major facilitator superfamily MFS_1  36.19 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2502  major facilitator transporter  37.39 
 
 		 382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405786  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5596  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 380 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  35.8 
 
 		 403 aa  163  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2052  major facilitator family transporter  33.7 
 
 		 389 aa  163  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00152251  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1917  major facilitator family transporter  33.7 
 
 		 389 aa  163  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214346  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0861  major facilitator family transporter  33.7 
 
 		 389 aa  163  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2693  major facilitator family transporter  33.7 
 
 		 389 aa  163  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 391 aa  162  7e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3237  transporter of the MFS superfamily  28.53 
 
 		 380 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.402069  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  31.89 
 
 		 391 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0914  MFS transporter  30.9 
 
 		 395 aa  160  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1400  major facilitator family transporter  34.64 
 
 		 389 aa  160  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0801718  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  31.89 
 
 		 391 aa  160  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9235  major facilitator family transporter  35.16 
 
 		 408 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3170  inner membrane transport protein YdhP  33.15 
 
 		 389 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0159821  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3209  major facilitator family transporter  33.15 
 
 		 389 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  31.89 
 
 		 391 aa  159  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3223  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 389 aa  159  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 378 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  31.63 
 
 		 391 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  33.43 
 
 		 391 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  35.03 
 
 		 404 aa  158  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 388 aa  158  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04270  arabinose efflux permease family protein  37.14 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  38.29 
 
 		 388 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  38.29 
 
 		 388 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  36.9 
 
 		 401 aa  157  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  34.59 
 
 		 392 aa  156  5.0000000000000005e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  33.61 
 
 		 387 aa  156  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1706  major facilitator transporter  38.08 
 
 		 394 aa  155  8e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.21366 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  33.9 
 
 		 385 aa  155  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  31.72 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  31.72 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  30.98 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  31.06 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  31.72 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0668  MFS transporter  29.58 
 
 		 387 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  32.5 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  31.72 
 
 		 404 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  31.72 
 
 		 404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  31.25 
 
 		 404 aa  153  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  30.79 
 
 		 415 aa  153  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  30.79 
 
 		 404 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 415 aa  152  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  35.41 
 
 		 390 aa  152  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>