More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02795 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02795  Major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 317 aa  614  1e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  77.18 
 
 		 400 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  77.52 
 
 		 397 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  74.5 
 
 		 398 aa  412  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  72.15 
 
 		 400 aa  402  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  71.48 
 
 		 401 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5034  major facilitator transporter  75.17 
 
 		 403 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  67.11 
 
 		 391 aa  397  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1153  putative transmembrane efflux transmembrane protein  68.79 
 
 		 400 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.351745 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  67.11 
 
 		 391 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  67.45 
 
 		 391 aa  388  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  67.45 
 
 		 391 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  67.45 
 
 		 391 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  67.45 
 
 		 391 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  69.37 
 
 		 404 aa  378  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  66.78 
 
 		 400 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  66.78 
 
 		 400 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  66.78 
 
 		 400 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0700  major facilitator superfamily transporter  65.1 
 
 		 394 aa  376  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  64.43 
 
 		 400 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  66.11 
 
 		 400 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  64.09 
 
 		 400 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  65.77 
 
 		 400 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0286  major facilitator superfamily transporter  68.79 
 
 		 400 aa  367  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  59.6 
 
 		 409 aa  336  3.9999999999999995e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  57.24 
 
 		 396 aa  326  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  55.93 
 
 		 404 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  55.93 
 
 		 404 aa  317  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  55.93 
 
 		 404 aa  317  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  55.93 
 
 		 404 aa  317  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  55.93 
 
 		 404 aa  317  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  55.93 
 
 		 404 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  54.92 
 
 		 404 aa  315  5e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  54.92 
 
 		 404 aa  315  8e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  54.24 
 
 		 404 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  53.9 
 
 		 394 aa  310  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  54.24 
 
 		 415 aa  310  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  54.24 
 
 		 415 aa  311  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  54.24 
 
 		 404 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  54.24 
 
 		 404 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  52.53 
 
 		 392 aa  288  6e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  52.35 
 
 		 388 aa  286  5e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  52.53 
 
 		 390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  52.53 
 
 		 390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  52.53 
 
 		 390 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  52.53 
 
 		 390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  52.53 
 
 		 390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  51.67 
 
 		 390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  53.54 
 
 		 397 aa  283  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  52.01 
 
 		 388 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  52.19 
 
 		 390 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  51.85 
 
 		 391 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  52.19 
 
 		 391 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  52.35 
 
 		 390 aa  281  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  51.33 
 
 		 391 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  51.52 
 
 		 391 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  51.85 
 
 		 391 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  51.18 
 
 		 416 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  51.18 
 
 		 391 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  50.17 
 
 		 405 aa  268  8.999999999999999e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  47.14 
 
 		 406 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  45.85 
 
 		 392 aa  248  7e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  47.32 
 
 		 388 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  47.18 
 
 		 393 aa  247  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  46.64 
 
 		 392 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  47.32 
 
 		 388 aa  245  8e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0377  arabinose efflux permease  47.89 
 
 		 391 aa  242  7.999999999999999e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000232651  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  44.9 
 
 		 388 aa  236  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  45.33 
 
 		 389 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  45.61 
 
 		 385 aa  235  6e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  45.33 
 
 		 389 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  45.33 
 
 		 389 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  45 
 
 		 389 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3223  major facilitator transporter  46.64 
 
 		 389 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3170  inner membrane transport protein YdhP  46.49 
 
 		 389 aa  232  6e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0159821  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3209  major facilitator family transporter  46.49 
 
 		 389 aa  232  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1400  major facilitator family transporter  46.15 
 
 		 389 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0801718  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  44.33 
 
 		 389 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  43.05 
 
 		 388 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2052  major facilitator family transporter  46.31 
 
 		 389 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00152251  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2693  major facilitator family transporter  46.31 
 
 		 389 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1917  major facilitator family transporter  46.31 
 
 		 389 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214346  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  47.35 
 
 		 406 aa  230  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0861  major facilitator family transporter  46.31 
 
 		 389 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2502  major facilitator transporter  44.85 
 
 		 382 aa  228  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405786  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  44.97 
 
 		 388 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  47.91 
 
 		 389 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  44.97 
 
 		 388 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  46.8 
 
 		 384 aa  226  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  43.14 
 
 		 393 aa  226  6e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  47.39 
 
 		 407 aa  225  6e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35900  chloramphenicol resistance protein  45.77 
 
 		 392 aa  225  7e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  47.55 
 
 		 387 aa  225  9e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  41.84 
 
 		 395 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1146  major facilitator transporter  45.02 
 
 		 401 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668538  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1134  major facilitator transporter  45.02 
 
 		 408 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  41.9 
 
 		 386 aa  224  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  41.84 
 
 		 395 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2369  transporter, major facilitator family  41.02 
 
 		 389 aa  223  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000585363  normal  0.236969 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  40.94 
 
 		 405 aa  223  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>