More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_35900 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_35900  chloramphenicol resistance protein  100 
 
 
392 aa  751    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  55.59 
 
 
409 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  54.15 
 
 
396 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  46.68 
 
 
404 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  45.62 
 
 
404 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  46.68 
 
 
404 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  45.62 
 
 
415 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  46.17 
 
 
404 aa  336  5e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  45.62 
 
 
404 aa  335  7e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  45.62 
 
 
415 aa  335  1e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  45.36 
 
 
404 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  45.36 
 
 
404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  45.36 
 
 
404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  45.36 
 
 
404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  45.36 
 
 
404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  45.36 
 
 
404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  46.42 
 
 
394 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  45.77 
 
 
400 aa  318  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  47.89 
 
 
398 aa  318  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  46.83 
 
 
400 aa  318  1e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  47.99 
 
 
404 aa  316  4e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  47.2 
 
 
397 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  44.68 
 
 
391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  44.68 
 
 
391 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  44.41 
 
 
391 aa  302  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  44.41 
 
 
391 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  44.41 
 
 
391 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  43.77 
 
 
391 aa  295  9e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  44.71 
 
 
400 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  44.71 
 
 
400 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1153  putative transmembrane efflux transmembrane protein  47.06 
 
 
400 aa  282  9e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.351745 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  44.71 
 
 
400 aa  281  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  46.28 
 
 
401 aa  280  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  44.97 
 
 
400 aa  280  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  44.71 
 
 
400 aa  279  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  44.18 
 
 
400 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  44.18 
 
 
400 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5034  major facilitator transporter  47.07 
 
 
403 aa  276  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  41.43 
 
 
392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  42.48 
 
 
391 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0700  major facilitator superfamily transporter  43.39 
 
 
394 aa  271  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  42.52 
 
 
388 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  42.66 
 
 
388 aa  268  1e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  41.95 
 
 
391 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  40.96 
 
 
408 aa  265  8e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  43.5 
 
 
390 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  41.98 
 
 
391 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  43.5 
 
 
390 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  43.5 
 
 
390 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  43.5 
 
 
390 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  43.5 
 
 
390 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  43.5 
 
 
390 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0286  major facilitator superfamily transporter  46.93 
 
 
400 aa  261  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  40.96 
 
 
391 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  43.5 
 
 
390 aa  260  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  43.22 
 
 
390 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0377  arabinose efflux permease  40.65 
 
 
391 aa  259  5.0000000000000005e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000232651  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  42.55 
 
 
391 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  41.19 
 
 
416 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  41.49 
 
 
397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  40.43 
 
 
391 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  41.05 
 
 
389 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  40.05 
 
 
393 aa  249  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  41.49 
 
 
405 aa  247  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  41.43 
 
 
388 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  37.4 
 
 
392 aa  241  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02795  Major facilitator superfamily MFS_1  45.77 
 
 
317 aa  239  5e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  39.79 
 
 
389 aa  239  9e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  39.79 
 
 
389 aa  239  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  41.14 
 
 
388 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  40.52 
 
 
386 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  39.52 
 
 
389 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  40.8 
 
 
384 aa  237  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  40.52 
 
 
386 aa  238  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  40.52 
 
 
386 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  39.61 
 
 
388 aa  236  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  40.37 
 
 
388 aa  235  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  39.01 
 
 
389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  39.14 
 
 
385 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  39.61 
 
 
388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  40.11 
 
 
388 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  41.43 
 
 
385 aa  231  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  39.79 
 
 
412 aa  230  4e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  38.29 
 
 
387 aa  229  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  40.05 
 
 
389 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1917  major facilitator family transporter  40.16 
 
 
389 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214346  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2052  major facilitator family transporter  40.16 
 
 
389 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00152251  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0861  major facilitator family transporter  40.16 
 
 
389 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2693  major facilitator family transporter  40.16 
 
 
389 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1400  major facilitator family transporter  40.32 
 
 
389 aa  226  8e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0801718  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3223  major facilitator transporter  39.89 
 
 
389 aa  225  9e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3209  major facilitator family transporter  39.89 
 
 
389 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3170  inner membrane transport protein YdhP  39.89 
 
 
389 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0159821  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  40.71 
 
 
378 aa  223  6e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9235  major facilitator family transporter  39.08 
 
 
408 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  35.79 
 
 
406 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  38.31 
 
 
406 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  38.79 
 
 
403 aa  217  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  37.6 
 
 
395 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  39.27 
 
 
406 aa  216  4e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>