More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0286 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0286  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
400 aa  744    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  82.41 
 
 
400 aa  623  1e-177  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1153  putative transmembrane efflux transmembrane protein  83 
 
 
400 aa  578  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.351745 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  82.66 
 
 
401 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5034  major facilitator transporter  75.19 
 
 
403 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  70.73 
 
 
404 aa  509  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  68.5 
 
 
400 aa  508  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  68 
 
 
400 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  68.25 
 
 
400 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  68 
 
 
400 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  69.05 
 
 
400 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  68 
 
 
400 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  68 
 
 
400 aa  501  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  71.43 
 
 
398 aa  502  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  67.75 
 
 
400 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  71.69 
 
 
397 aa  496  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  67.89 
 
 
391 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  67.62 
 
 
391 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  67.36 
 
 
391 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  67.62 
 
 
391 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  67.62 
 
 
391 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  67.01 
 
 
391 aa  481  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0700  major facilitator superfamily transporter  63.92 
 
 
394 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  61.64 
 
 
409 aa  414  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  60.1 
 
 
396 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02795  Major facilitator superfamily MFS_1  68.79 
 
 
317 aa  387  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  50.91 
 
 
404 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  50.91 
 
 
404 aa  373  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  50.91 
 
 
404 aa  373  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  50.91 
 
 
404 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  50.91 
 
 
404 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  50.91 
 
 
404 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  50.65 
 
 
404 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  50.39 
 
 
404 aa  368  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  50.39 
 
 
404 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  50.26 
 
 
415 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  50.26 
 
 
415 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  50.13 
 
 
404 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  50.39 
 
 
404 aa  366  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  50.65 
 
 
394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  51.67 
 
 
391 aa  326  5e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  51.26 
 
 
391 aa  326  5e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  52.13 
 
 
397 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  50.78 
 
 
391 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  50.78 
 
 
391 aa  315  7e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  51.52 
 
 
392 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  50.25 
 
 
388 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  53.8 
 
 
405 aa  311  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  50.26 
 
 
391 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  52.33 
 
 
390 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  50 
 
 
416 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  52.05 
 
 
390 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  52.05 
 
 
390 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  52.05 
 
 
390 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  52.05 
 
 
390 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  52.05 
 
 
390 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  53.24 
 
 
390 aa  307  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  51.78 
 
 
390 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  50.66 
 
 
391 aa  306  6e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  50.41 
 
 
388 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35900  chloramphenicol resistance protein  46.95 
 
 
392 aa  289  5.0000000000000004e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  47.03 
 
 
389 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  46.51 
 
 
389 aa  286  7e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  46.77 
 
 
389 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  46.77 
 
 
389 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  47.67 
 
 
389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  51.59 
 
 
392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0377  arabinose efflux permease  44.8 
 
 
391 aa  273  5.000000000000001e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000232651  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  47.47 
 
 
406 aa  266  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1277  major facilitator transporter  46.81 
 
 
407 aa  263  3e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  48.85 
 
 
393 aa  262  8e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  43.23 
 
 
408 aa  261  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  44.72 
 
 
388 aa  259  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3209  major facilitator family transporter  48.36 
 
 
389 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3170  inner membrane transport protein YdhP  48.36 
 
 
389 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0159821  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20840  multidrug/chloramphenicol efflux transporter, major facilitator superfamily MFS_1  45.48 
 
 
403 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.290056  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3223  major facilitator transporter  48.36 
 
 
389 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  45.72 
 
 
385 aa  256  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2052  major facilitator family transporter  48.09 
 
 
389 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00152251  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2693  major facilitator family transporter  48.09 
 
 
389 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0861  major facilitator family transporter  48.09 
 
 
389 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1917  major facilitator family transporter  48.09 
 
 
389 aa  256  5e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214346  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  44.92 
 
 
388 aa  256  6e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1400  major facilitator family transporter  49.18 
 
 
389 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0801718  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  45.97 
 
 
389 aa  254  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  45.19 
 
 
388 aa  254  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  47.53 
 
 
388 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  45.36 
 
 
388 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  47.25 
 
 
388 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  46.83 
 
 
391 aa  250  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  40.83 
 
 
393 aa  249  5e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  42.57 
 
 
392 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  46.18 
 
 
406 aa  244  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  44.67 
 
 
388 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3132  major facilitator transporter  41.88 
 
 
389 aa  244  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  43.98 
 
 
378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  44.85 
 
 
395 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  45.56 
 
 
400 aa  244  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  44.03 
 
 
412 aa  244  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  42.67 
 
 
395 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.933916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>