More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0700 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0700  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
394 aa  759    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  65.96 
 
 
404 aa  483  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  64.51 
 
 
400 aa  473  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  66.93 
 
 
401 aa  464  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  60.94 
 
 
391 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  60.94 
 
 
391 aa  458  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  63.31 
 
 
400 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  60.16 
 
 
391 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  60.68 
 
 
391 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  62.69 
 
 
400 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  61.93 
 
 
400 aa  456  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  62.95 
 
 
400 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  62.69 
 
 
400 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  60.42 
 
 
391 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  62.69 
 
 
400 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5034  major facilitator transporter  67.19 
 
 
403 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  62.31 
 
 
398 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  62.18 
 
 
400 aa  449  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0421  arabinose efflux permease  62.18 
 
 
400 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1153  putative transmembrane efflux transmembrane protein  63.9 
 
 
400 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.351745 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  60.21 
 
 
391 aa  438  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  60.31 
 
 
397 aa  430  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0286  major facilitator superfamily transporter  64.23 
 
 
400 aa  422  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  55.38 
 
 
409 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02795  Major facilitator superfamily MFS_1  65.1 
 
 
317 aa  375  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  52.34 
 
 
404 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  52.34 
 
 
404 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  52.08 
 
 
415 aa  369  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  52.34 
 
 
404 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  52.34 
 
 
404 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  52.34 
 
 
404 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  52.08 
 
 
404 aa  369  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  51.82 
 
 
415 aa  367  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  54.38 
 
 
396 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  52.08 
 
 
404 aa  368  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  51.82 
 
 
404 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  51.82 
 
 
404 aa  368  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  51.56 
 
 
404 aa  364  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  51.82 
 
 
394 aa  364  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  50.91 
 
 
404 aa  364  1e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  50.84 
 
 
392 aa  318  7e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  49.86 
 
 
388 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  49.58 
 
 
388 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  47.07 
 
 
391 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  50.42 
 
 
390 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  47.56 
 
 
391 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  47.66 
 
 
391 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  49.72 
 
 
390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  48.18 
 
 
391 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0377  arabinose efflux permease  45.85 
 
 
391 aa  303  5.000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000232651  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  49.44 
 
 
390 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  49.44 
 
 
390 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  49.44 
 
 
390 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  49.44 
 
 
390 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  47.92 
 
 
416 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  49.16 
 
 
390 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  47.92 
 
 
391 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  49.16 
 
 
390 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  48.88 
 
 
405 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  49.42 
 
 
391 aa  290  3e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  44.96 
 
 
397 aa  289  5.0000000000000004e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35900  chloramphenicol resistance protein  43.39 
 
 
392 aa  271  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  43.78 
 
 
389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1277  major facilitator transporter  44.94 
 
 
407 aa  268  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  43.52 
 
 
389 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  43.52 
 
 
389 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  42.82 
 
 
389 aa  266  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  42.3 
 
 
408 aa  261  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20840  multidrug/chloramphenicol efflux transporter, major facilitator superfamily MFS_1  43.26 
 
 
403 aa  260  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.290056  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1377  transporter, putative  38.8 
 
 
399 aa  258  1e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  45.95 
 
 
392 aa  258  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  41.25 
 
 
388 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  42.56 
 
 
389 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  42.82 
 
 
388 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  41.91 
 
 
385 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  44.72 
 
 
388 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  44.44 
 
 
388 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  41.57 
 
 
392 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  44.54 
 
 
389 aa  250  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1256  transporter, putative  38.25 
 
 
399 aa  249  6e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  43.47 
 
 
400 aa  249  9e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0485  putative transporter  37.98 
 
 
399 aa  248  2e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.425547  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  41.99 
 
 
388 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3223  major facilitator transporter  43.78 
 
 
389 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  42.25 
 
 
395 aa  246  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  43.17 
 
 
406 aa  246  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  44.82 
 
 
388 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3209  major facilitator family transporter  43.52 
 
 
389 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3170  inner membrane transport protein YdhP  43.52 
 
 
389 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0159821  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  42.98 
 
 
387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  38.86 
 
 
388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  41.87 
 
 
406 aa  243  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2052  major facilitator family transporter  43.26 
 
 
389 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00152251  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1917  major facilitator family transporter  43.26 
 
 
389 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2693  major facilitator family transporter  43.26 
 
 
389 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  43.24 
 
 
407 aa  243  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0861  major facilitator family transporter  43.26 
 
 
389 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  42.82 
 
 
391 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  44.54 
 
 
388 aa  243  5e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  45.03 
 
 
393 aa  241  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>