More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06496 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0668  MFS transporter  85.9 
 
 		 387 aa  635    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0914  MFS transporter  81.52 
 
 		 395 aa  639    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06496  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  773    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  43.58 
 
 		 392 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1817  major facilitator transporter  40.72 
 
 		 406 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000443507  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  42.46 
 
 		 388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  41.9 
 
 		 388 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  42.2 
 
 		 388 aa  272  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  42.74 
 
 		 390 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  42.2 
 
 		 388 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  42.46 
 
 		 390 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  42.46 
 
 		 390 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  42.46 
 
 		 390 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  42.46 
 
 		 390 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  42.46 
 
 		 390 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  42.46 
 
 		 390 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  44.54 
 
 		 397 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  43.02 
 
 		 390 aa  268  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0829  major facilitator transporter  40.36 
 
 		 407 aa  267  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260896  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  44.6 
 
 		 388 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  39.74 
 
 		 391 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  41.46 
 
 		 406 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  44.32 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  39.74 
 
 		 391 aa  262  8e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 405 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  41.48 
 
 		 393 aa  260  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  39.05 
 
 		 391 aa  259  6e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  39.68 
 
 		 391 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  38.64 
 
 		 416 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  39.15 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  38.27 
 
 		 395 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.57 
 
 		 388 aa  253  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  38.27 
 
 		 395 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  36.64 
 
 		 392 aa  251  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  43.45 
 
 		 387 aa  250  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  41.6 
 
 		 400 aa  250  4e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  39.94 
 
 		 391 aa  249  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  43.06 
 
 		 378 aa  248  9e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  40.23 
 
 		 386 aa  248  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  41.3 
 
 		 396 aa  246  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  39.56 
 
 		 408 aa  244  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  37.93 
 
 		 393 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.985188 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1146  major facilitator transporter  41.3 
 
 		 401 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668538  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  41.81 
 
 		 407 aa  243  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1134  major facilitator transporter  41.3 
 
 		 408 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2061  major facilitator transporter  42.55 
 
 		 401 aa  243  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  39.43 
 
 		 392 aa  243  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  43.18 
 
 		 386 aa  240  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  43.18 
 
 		 386 aa  240  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  43.18 
 
 		 386 aa  240  2.9999999999999997e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0774  major facilitator transporter  40.99 
 
 		 401 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1255  major facilitator transporter  40.99 
 
 		 401 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1227  major facilitator transporter  40.99 
 
 		 401 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.309225 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4398  major facilitator transporter  40.68 
 
 		 401 aa  239  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2696  major facilitator superfamily MFS_1  39.56 
 
 		 400 aa  239  9e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  37.31 
 
 		 391 aa  239  9e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  37.56 
 
 		 391 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  41.08 
 
 		 406 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  37.31 
 
 		 391 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2254  major facilitator transporter  38.22 
 
 		 390 aa  237  3e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.364288  normal  0.844618 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  37.05 
 
 		 391 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2307  major facilitator superfamily MFS_1  39.56 
 
 		 400 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17268  hitchhiker  0.00000016872 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  36.5 
 
 		 393 aa  237  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  37.14 
 
 		 391 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  37.79 
 
 		 400 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3051  major facilitator transporter  36.51 
 
 		 404 aa  233  5e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  40.88 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  41.16 
 
 		 389 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  41.23 
 
 		 384 aa  229  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2206  major facilitator superfamily MFS_1  36.68 
 
 		 391 aa  229  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  38.15 
 
 		 385 aa  229  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2369  transporter, major facilitator family  38.85 
 
 		 389 aa  229  6e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000585363  normal  0.236969 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 412 aa  229  7e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  38.26 
 
 		 391 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  40.27 
 
 		 389 aa  229  8e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2461  major facilitator superfamily MFS_1  38.48 
 
 		 386 aa  229  8e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0545  major facilitator superfamily MFS_1  37.15 
 
 		 399 aa  228  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161827 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  41.57 
 
 		 389 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01627  putative transport protein (MFS family)  38.58 
 
 		 389 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1983  major facilitator superfamily MFS_1  38.58 
 
 		 389 aa  228  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  38.26 
 
 		 391 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  35.66 
 
 		 388 aa  228  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1870  major facilitator transporter  38.58 
 
 		 389 aa  228  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971933  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 400 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1972  major facilitator transporter  38.58 
 
 		 389 aa  228  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01617  hypothetical protein  38.58 
 
 		 389 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 400 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1736  major facilitator transporter  38.58 
 
 		 389 aa  228  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000269291  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1541  major facilitator transporter  38.58 
 
 		 389 aa  228  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.114044 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  40.33 
 
 		 389 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05030  arabinose efflux permease family protein  40.06 
 
 		 430 aa  226  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  40.33 
 
 		 389 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2530  major facilitator transporter  36.26 
 
 		 408 aa  225  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  37.09 
 
 		 391 aa  225  8e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 400 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  38.44 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  39.32 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  37.98 
 
 		 395 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  38.73 
 
 		 391 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  39.89 
 
 		 391 aa  223  4e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0196377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>