More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1023 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1023  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
432 aa  823    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0932  major facilitator transporter  71.21 
 
 
426 aa  527  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1024  major facilitator superfamily MFS_1  38.11 
 
 
410 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.204165  normal  0.764355 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4445  major facilitator transporter  31.77 
 
 
417 aa  168  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.306618 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1816  major facilitator transporter  36.53 
 
 
405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35870  major facilitator family transporter  33.04 
 
 
408 aa  166  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0848172  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3563  major facilitator superfamily MFS_1  34.28 
 
 
394 aa  159  8e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6824  major facilitator transporter  33.51 
 
 
398 aa  158  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  30.36 
 
 
396 aa  158  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3068  major facilitator family transporter  31.08 
 
 
375 aa  156  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.547079  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3035  major facilitator transporter  34.85 
 
 
390 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13751  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0908  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 
383 aa  155  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.260847  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17740  MFS transporter  37.23 
 
 
412 aa  155  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2926  major facilitator transporter  30.54 
 
 
401 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0235269  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3749  major facilitator superfamily MFS_1  33.12 
 
 
394 aa  150  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.630877  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33690  arabinose efflux permease family protein  33.6 
 
 
399 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2719  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 
399 aa  143  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20320  arabinose efflux permease family protein  30.56 
 
 
397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352301  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23550  arabinose efflux permease family protein  32.75 
 
 
416 aa  139  7.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.655191  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3692  general substrate transporter  31.07 
 
 
430 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 
404 aa  137  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 
402 aa  136  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  31.32 
 
 
403 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2612  major facilitator transporter  34.01 
 
 
407 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  32.86 
 
 
402 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 
403 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  32.82 
 
 
379 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  31.74 
 
 
401 aa  134  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  31.53 
 
 
401 aa  134  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2563  major facilitator transporter  32.18 
 
 
403 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0839  sugar efflux transporter  28.18 
 
 
399 aa  132  9e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3303  major facilitator transporter  31.99 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  32.34 
 
 
402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1978  major facilitator transporter  33.72 
 
 
407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2588  major facilitator transporter  33.72 
 
 
407 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.229839  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  32.51 
 
 
403 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24090  arabinose efflux permease family protein  31.83 
 
 
447 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3194  sugar efflux transporter  29.67 
 
 
419 aa  131  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0707  sugar efflux transporter  30.06 
 
 
394 aa  131  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3138  major facilitator transporter  29.65 
 
 
400 aa  130  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  32.87 
 
 
404 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0150  major facilitator transporter  33.05 
 
 
400 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0159  major facilitator transporter  33.05 
 
 
400 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234917  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  30.52 
 
 
396 aa  130  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2027  major facilitator transporter  31.97 
 
 
425 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.145333 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 
407 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0882  major facilitator family transporter  32.21 
 
 
403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158047  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0341  major facilitator family transporter  32.21 
 
 
403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0088  major facilitator family transporter  32.21 
 
 
403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2475  major facilitator family transporter  32.21 
 
 
403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1044  major facilitator family transporter  32.21 
 
 
403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0885  major facilitator family transporter  32.21 
 
 
403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.106194  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3841  sugar efflux transporter  27.59 
 
 
398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820491 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0709  major facilitator transporter  36.59 
 
 
399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0373482  normal  0.416775 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0640  major facilitator family transporter  32.21 
 
 
403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286289  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  31.12 
 
 
399 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1998  major facilitator transporter  32.63 
 
 
396 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.580365  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  30.42 
 
 
400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2636  major facilitator transporter  36.04 
 
 
408 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0868  sugar efflux transporter  27.13 
 
 
399 aa  127  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.202356  normal  0.905992 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1113  major facilitator superfamily MFS_1  27.36 
 
 
383 aa  127  6e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000378306  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5919  major facilitator transporter  35.41 
 
 
403 aa  126  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1627  sugar efflux transporter  28.91 
 
 
396 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10192  integral membrane protein  31.53 
 
 
413 aa  126  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1694  sugar efflux transporter  29.47 
 
 
396 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0396225  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1648  sugar efflux transporter  29.47 
 
 
396 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1813  sugar efflux transporter  29.47 
 
 
396 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2000  sugar efflux transporter  29 
 
 
398 aa  124  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  29.88 
 
 
397 aa  124  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  34.63 
 
 
402 aa  124  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1635  sugar efflux transporter  29.47 
 
 
396 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.626484  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 
411 aa  124  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  30.42 
 
 
406 aa  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  29.29 
 
 
398 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  30.03 
 
 
402 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3960  major facilitator transporter  30.46 
 
 
400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  28.54 
 
 
400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0207  putative transporter transmembrane protein  31.27 
 
 
408 aa  121  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10750  sugar efflux transporter  29.45 
 
 
396 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3560  major facilitator transporter  30.46 
 
 
400 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10110  putative transporter  32.53 
 
 
394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000108859  normal  0.939917 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2647  major facilitator family transporter  31.4 
 
 
408 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1945  major facilitator transporter  30.17 
 
 
401 aa  120  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0403  major facilitator superfamily MFS_1  33.21 
 
 
394 aa  120  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00475007  normal  0.145448 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  32.32 
 
 
397 aa  120  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2152  major facilitator transporter  31.4 
 
 
408 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3751  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 
410 aa  119  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  28.82 
 
 
408 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 
412 aa  119  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  27.09 
 
 
404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  31.77 
 
 
388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3182  major facilitator transporter  31.81 
 
 
413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0140  major facilitator transporter  32.48 
 
 
400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  29.91 
 
 
400 aa  118  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5629  major facilitator transporter  32.04 
 
 
404 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208414  normal  0.0407096 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  32.2 
 
 
391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  32.2 
 
 
391 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01617  hypothetical protein  32.29 
 
 
389 aa  116  6e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1736  major facilitator transporter  32.29 
 
 
389 aa  116  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000269291  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3594  major facilitator transporter  30.05 
 
 
393 aa  116  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.273434  normal  0.575034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>