More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3692 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3692  general substrate transporter  100 
 
 		 430 aa  822    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3035  major facilitator transporter  63.68 
 
 		 390 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35870  major facilitator family transporter  64.21 
 
 		 408 aa  413  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0848172  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3563  major facilitator superfamily MFS_1  61.04 
 
 		 394 aa  402  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3749  major facilitator superfamily MFS_1  60.79 
 
 		 394 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.630877  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1816  major facilitator transporter  63.85 
 
 		 405 aa  395  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17740  MFS transporter  58.96 
 
 		 412 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4445  major facilitator transporter  54.62 
 
 		 417 aa  375  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.306618 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3068  major facilitator family transporter  54.52 
 
 		 375 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.547079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2926  major facilitator transporter  55.59 
 
 		 401 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0235269  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6824  major facilitator transporter  57.99 
 
 		 398 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5919  major facilitator transporter  57.54 
 
 		 403 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0882  major facilitator family transporter  57.07 
 
 		 403 aa  352  8e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158047  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1044  major facilitator family transporter  56.79 
 
 		 403 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0341  major facilitator family transporter  56.52 
 
 		 403 aa  348  9e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0088  major facilitator family transporter  56.52 
 
 		 403 aa  348  9e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0885  major facilitator family transporter  56.52 
 
 		 403 aa  348  9e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.106194  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0640  major facilitator family transporter  56.52 
 
 		 403 aa  348  9e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286289  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2475  major facilitator family transporter  56.52 
 
 		 403 aa  348  9e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3138  major facilitator transporter  49.33 
 
 		 400 aa  337  2.9999999999999997e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2027  major facilitator transporter  51.76 
 
 		 425 aa  331  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.145333 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2612  major facilitator transporter  57.47 
 
 		 407 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0709  major facilitator transporter  58.01 
 
 		 399 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0373482  normal  0.416775 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1978  major facilitator transporter  57.22 
 
 		 407 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2588  major facilitator transporter  57.22 
 
 		 407 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.229839  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3303  major facilitator transporter  50.64 
 
 		 396 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2636  major facilitator transporter  57.63 
 
 		 408 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33690  arabinose efflux permease family protein  45.45 
 
 		 399 aa  293  5e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1998  major facilitator transporter  51.8 
 
 		 396 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.580365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3751  major facilitator superfamily MFS_1  46.11 
 
 		 410 aa  290  4e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0403  major facilitator superfamily MFS_1  54.73 
 
 		 394 aa  289  7e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00475007  normal  0.145448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2392  major facilitator family transporter  51.45 
 
 		 400 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23550  arabinose efflux permease family protein  45.27 
 
 		 416 aa  284  2.0000000000000002e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.655191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34710  major facilitator transporter  54.23 
 
 		 417 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00447265  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2946  major facilitator family transporter  57.06 
 
 		 390 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20320  arabinose efflux permease family protein  39.94 
 
 		 397 aa  256  7e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352301  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24090  arabinose efflux permease family protein  43.81 
 
 		 447 aa  246  6.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2719  major facilitator superfamily MFS_1  39.24 
 
 		 399 aa  232  8.000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0908  major facilitator superfamily MFS_1  35.03 
 
 		 383 aa  209  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.260847  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0932  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 426 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1113  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 		 383 aa  162  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000378306  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  33.95 
 
 		 404 aa  147  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1023  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 432 aa  140  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1024  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 		 410 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.204165  normal  0.764355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  31.44 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  28.46 
 
 		 396 aa  133  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 407 aa  133  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  32.46 
 
 		 390 aa  132  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 		 412 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 418 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0999  major facilitator family transporter  29.94 
 
 		 407 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196023  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  28.41 
 
 		 396 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 401 aa  123  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3167  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 414 aa  123  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.508842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6513  sugar efflux transporter  28.03 
 
 		 451 aa  123  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5225  sugar efflux transporter  28.69 
 
 		 397 aa  123  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000397206  normal  0.170795 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5582  sugar efflux transporter  28.93 
 
 		 410 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  30.62 
 
 		 405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 		 735 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10750  sugar efflux transporter  26.78 
 
 		 396 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0707  sugar efflux transporter  30.57 
 
 		 394 aa  120  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  28.7 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6308  sugar efflux transporter  28.41 
 
 		 394 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260956  normal  0.44314 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  27.22 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  27.22 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  27.22 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  26.94 
 
 		 451 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 412 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 		 403 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  27.22 
 
 		 394 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  26.94 
 
 		 451 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  27.86 
 
 		 394 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 		 403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10192  integral membrane protein  29.94 
 
 		 413 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19440  arabinose efflux permease family protein  31.98 
 
 		 421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.864683  normal  0.0256457 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6103  sugar efflux transporter  28.69 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.542417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1316  sugar efflux transporter  28.69 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  31.44 
 
 		 410 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4094  major facilitator superfamily MFS_1  29.68 
 
 		 422 aa  113  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  29.75 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 		 404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5955  sugar efflux transporter  28.29 
 
 		 417 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0541401 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4885  major facilitator family transporter  28.31 
 
 		 390 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00139132  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1932  sugar efflux transporter  26.44 
 
 		 388 aa  111  3e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17258  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7381  permease  30.68 
 
 		 402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0862221  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5260  major facilitator family transporter  28.31 
 
 		 414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00289219  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4742  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 394 aa  110  5e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00912769  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  30.48 
 
 		 397 aa  110  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5128  major facilitator family transporter  28.31 
 
 		 390 aa  110  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4727  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 390 aa  110  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1267  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  29.34 
 
 		 404 aa  110  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5167  major facilitator family transporter  28.46 
 
 		 390 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 411 aa  110  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  31.06 
 
 		 400 aa  109  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  30.31 
 
 		 395 aa  109  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1377  transporter, putative  29.17 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>