More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2612 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2612  major facilitator transporter  100 
 
 		 407 aa  766    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1978  major facilitator transporter  98.03 
 
 		 407 aa  749    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2588  major facilitator transporter  98.03 
 
 		 407 aa  749    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.229839  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2636  major facilitator transporter  92.63 
 
 		 408 aa  595  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5919  major facilitator transporter  88.21 
 
 		 403 aa  591  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0709  major facilitator transporter  82.31 
 
 		 399 aa  520  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0373482  normal  0.416775 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0341  major facilitator family transporter  71.08 
 
 		 403 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1044  major facilitator family transporter  71.35 
 
 		 403 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0088  major facilitator family transporter  71.08 
 
 		 403 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0882  major facilitator family transporter  67.24 
 
 		 403 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158047  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0885  major facilitator family transporter  71.08 
 
 		 403 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.106194  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2475  major facilitator family transporter  71.08 
 
 		 403 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0640  major facilitator family transporter  71.08 
 
 		 403 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3035  major facilitator transporter  62.83 
 
 		 390 aa  381  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3749  major facilitator superfamily MFS_1  60.1 
 
 		 394 aa  378  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.630877  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35870  major facilitator family transporter  60.21 
 
 		 408 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0848172  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3563  major facilitator superfamily MFS_1  60.05 
 
 		 394 aa  361  1e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4445  major facilitator transporter  54.17 
 
 		 417 aa  347  3e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.306618 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3692  general substrate transporter  57.47 
 
 		 430 aa  346  5e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6824  major facilitator transporter  57.1 
 
 		 398 aa  344  2e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1816  major facilitator transporter  58.97 
 
 		 405 aa  343  4e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3068  major facilitator family transporter  54.52 
 
 		 375 aa  323  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.547079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2926  major facilitator transporter  53.97 
 
 		 401 aa  323  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0235269  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17740  MFS transporter  53.81 
 
 		 412 aa  321  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3303  major facilitator transporter  49.5 
 
 		 396 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33690  arabinose efflux permease family protein  49.74 
 
 		 399 aa  300  3e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1998  major facilitator transporter  50 
 
 		 396 aa  296  6e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.580365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3138  major facilitator transporter  48.37 
 
 		 400 aa  292  8e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2027  major facilitator transporter  50.99 
 
 		 425 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.145333 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23550  arabinose efflux permease family protein  47.19 
 
 		 416 aa  289  6e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.655191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2392  major facilitator family transporter  47.74 
 
 		 400 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0403  major facilitator superfamily MFS_1  53.01 
 
 		 394 aa  277  3e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00475007  normal  0.145448 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2946  major facilitator family transporter  57.94 
 
 		 390 aa  276  5e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34710  major facilitator transporter  57.67 
 
 		 417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00447265  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20320  arabinose efflux permease family protein  40.87 
 
 		 397 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352301  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3751  major facilitator superfamily MFS_1  44.25 
 
 		 410 aa  263  4.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24090  arabinose efflux permease family protein  46.08 
 
 		 447 aa  258  2e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2719  major facilitator superfamily MFS_1  41.86 
 
 		 399 aa  243  3.9999999999999997e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0908  major facilitator superfamily MFS_1  32.44 
 
 		 383 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.260847  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0932  major facilitator transporter  33.75 
 
 		 426 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  34 
 
 		 406 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1023  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 		 432 aa  138  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1024  major facilitator superfamily MFS_1  36.96 
 
 		 410 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.204165  normal  0.764355 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  35.67 
 
 		 390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1113  major facilitator superfamily MFS_1  29.43 
 
 		 383 aa  136  5e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000378306  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 404 aa  136  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  30.03 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 401 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19440  arabinose efflux permease family protein  32.89 
 
 		 421 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.864683  normal  0.0256457 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  28.18 
 
 		 396 aa  124  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1932  sugar efflux transporter  28.03 
 
 		 388 aa  124  4e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17258  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5156  major facilitator family transporter  30 
 
 		 414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 		 412 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  30.08 
 
 		 451 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  30.08 
 
 		 451 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  30.08 
 
 		 451 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  29.82 
 
 		 451 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  29.82 
 
 		 451 aa  120  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4727  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 390 aa  119  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1267  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  31.07 
 
 		 402 aa  119  7e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5128  major facilitator family transporter  29.72 
 
 		 390 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  29.88 
 
 		 394 aa  119  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4885  major facilitator family transporter  29.44 
 
 		 390 aa  119  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00139132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5260  major facilitator family transporter  29.44 
 
 		 414 aa  119  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00289219  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  35.39 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  33.06 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 401 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 399 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4742  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00912769  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  28.29 
 
 		 394 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6467  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 403 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.070181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5167  major facilitator family transporter  29.81 
 
 		 390 aa  116  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2475  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 402 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0085  major facilitator family transporter  30.19 
 
 		 390 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6308  sugar efflux transporter  30.47 
 
 		 394 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260956  normal  0.44314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  32.66 
 
 		 407 aa  116  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5160  major facilitator family transporter  32.66 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1499  sugar efflux transporter  26.86 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671324  normal  0.520287 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  33.7 
 
 		 400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  32.79 
 
 		 389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 400 aa  113  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 398 aa  113  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 408 aa  113  5e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  29.61 
 
 		 399 aa  113  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4844  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 431 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10192  integral membrane protein  32.55 
 
 		 413 aa  112  9e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  31.23 
 
 		 402 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0839  sugar efflux transporter  28.49 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  34.06 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  30.28 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 389 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  32.4 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>