More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0709 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_0709  major facilitator transporter  100 
 
 
399 aa  747    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0373482  normal  0.416775 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5919  major facilitator transporter  83.13 
 
 
403 aa  550  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1978  major facilitator transporter  82.31 
 
 
407 aa  534  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2588  major facilitator transporter  82.31 
 
 
407 aa  534  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.229839  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2612  major facilitator transporter  82.31 
 
 
407 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2636  major facilitator transporter  84.28 
 
 
408 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0088  major facilitator family transporter  69.83 
 
 
403 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0341  major facilitator family transporter  69.83 
 
 
403 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0885  major facilitator family transporter  69.83 
 
 
403 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.106194  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0640  major facilitator family transporter  69.83 
 
 
403 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286289  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2475  major facilitator family transporter  69.83 
 
 
403 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1044  major facilitator family transporter  69.58 
 
 
403 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0882  major facilitator family transporter  69.58 
 
 
403 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158047  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3749  major facilitator superfamily MFS_1  60 
 
 
394 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.630877  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3035  major facilitator transporter  61.62 
 
 
390 aa  371  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13751  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35870  major facilitator family transporter  60.26 
 
 
408 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0848172  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3563  major facilitator superfamily MFS_1  59.08 
 
 
394 aa  360  2e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3692  general substrate transporter  58.01 
 
 
430 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4445  major facilitator transporter  54.43 
 
 
417 aa  351  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.306618 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1816  major facilitator transporter  60.42 
 
 
405 aa  349  5e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6824  major facilitator transporter  58.97 
 
 
398 aa  345  6e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3303  major facilitator transporter  51.51 
 
 
396 aa  325  6e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3068  major facilitator family transporter  51.89 
 
 
375 aa  323  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.547079  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17740  MFS transporter  55.95 
 
 
412 aa  317  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2926  major facilitator transporter  51.08 
 
 
401 aa  316  4e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0235269  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1998  major facilitator transporter  49.75 
 
 
396 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.580365  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33690  arabinose efflux permease family protein  48.61 
 
 
399 aa  298  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2392  major facilitator family transporter  48.99 
 
 
400 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110299  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2027  major facilitator transporter  51.77 
 
 
425 aa  286  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.145333 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3138  major facilitator transporter  47.81 
 
 
400 aa  285  8e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0403  major facilitator superfamily MFS_1  53.49 
 
 
394 aa  279  6e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00475007  normal  0.145448 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3751  major facilitator superfamily MFS_1  46.15 
 
 
410 aa  277  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23550  arabinose efflux permease family protein  45.48 
 
 
416 aa  266  5.999999999999999e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.655191  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2946  major facilitator family transporter  56.14 
 
 
390 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34710  major facilitator transporter  55.87 
 
 
417 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00447265  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20320  arabinose efflux permease family protein  40.99 
 
 
397 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352301  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24090  arabinose efflux permease family protein  45.77 
 
 
447 aa  246  4e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2719  major facilitator superfamily MFS_1  40.2 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0908  major facilitator superfamily MFS_1  32.7 
 
 
383 aa  182  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.260847  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0932  major facilitator transporter  35.41 
 
 
426 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1113  major facilitator superfamily MFS_1  29.69 
 
 
383 aa  145  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000378306  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1024  major facilitator superfamily MFS_1  37.39 
 
 
410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.204165  normal  0.764355 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1023  major facilitator superfamily MFS_1  34.06 
 
 
432 aa  137  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  31.9 
 
 
396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  36.76 
 
 
390 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  30.22 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  32.5 
 
 
404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  29 
 
 
390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6308  sugar efflux transporter  30.25 
 
 
394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260956  normal  0.44314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  32.37 
 
 
406 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5225  sugar efflux transporter  28.76 
 
 
397 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000397206  normal  0.170795 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5582  sugar efflux transporter  29.41 
 
 
410 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  31.88 
 
 
418 aa  123  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  31.54 
 
 
395 aa  123  7e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  31.07 
 
 
451 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  30.77 
 
 
451 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 
412 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  31.07 
 
 
451 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  32.62 
 
 
402 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  28.57 
 
 
394 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  30.77 
 
 
451 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  31.07 
 
 
451 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  31.98 
 
 
401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19440  arabinose efflux permease family protein  33.04 
 
 
421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.864683  normal  0.0256457 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  31.07 
 
 
394 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  33.06 
 
 
405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  30.32 
 
 
399 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3841  sugar efflux transporter  28.53 
 
 
398 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820491 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  32.09 
 
 
397 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 
402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  32.94 
 
 
410 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  30.86 
 
 
401 aa  119  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5955  sugar efflux transporter  28.45 
 
 
417 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0541401 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  30.81 
 
 
404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3267  sugar efflux transporter  29.23 
 
 
413 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  29.55 
 
 
398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1932  sugar efflux transporter  28.82 
 
 
388 aa  117  5e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17258  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2428  sugar efflux transporter  28.91 
 
 
408 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0595849  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  31.36 
 
 
402 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  29.73 
 
 
410 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2475  major facilitator transporter  28.53 
 
 
402 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46904  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2201  sugar efflux transporter  28.92 
 
 
407 aa  116  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480922  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 
411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5156  major facilitator family transporter  26.82 
 
 
414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1499  sugar efflux transporter  28.78 
 
 
376 aa  114  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671324  normal  0.520287 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5260  major facilitator family transporter  26.56 
 
 
414 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00289219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0632  major facilitator transporter  29.46 
 
 
410 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4885  major facilitator family transporter  26.56 
 
 
390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00139132  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1788  major facilitator transporter  30.4 
 
 
399 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0140849 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0085  major facilitator family transporter  27.08 
 
 
390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  29.25 
 
 
396 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6513  sugar efflux transporter  29.13 
 
 
451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4727  major facilitator transporter  26.56 
 
 
390 aa  113  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1267  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2353  major facilitator transporter  32.92 
 
 
413 aa  113  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5128  major facilitator family transporter  26.56 
 
 
390 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  28.41 
 
 
408 aa  113  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1316  sugar efflux transporter  29.13 
 
 
400 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4742  major facilitator transporter  26.82 
 
 
394 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00912769  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6103  sugar efflux transporter  29.13 
 
 
400 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.542417  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  29.16 
 
 
403 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>