More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_20320 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_20320  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 397 aa  754    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352301  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2719  major facilitator superfamily MFS_1  52.03 
 
 		 399 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33690  arabinose efflux permease family protein  47.51 
 
 		 399 aa  315  9e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4445  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 417 aa  256  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.306618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3035  major facilitator transporter  42.81 
 
 		 390 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2926  major facilitator transporter  41.8 
 
 		 401 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0235269  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3068  major facilitator family transporter  42.11 
 
 		 375 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.547079  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17740  MFS transporter  44 
 
 		 412 aa  240  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3138  major facilitator transporter  39.12 
 
 		 400 aa  239  6.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1816  major facilitator transporter  43.4 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3692  general substrate transporter  39.48 
 
 		 430 aa  236  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35870  major facilitator family transporter  41.14 
 
 		 408 aa  236  7e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0848172  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3303  major facilitator transporter  40.42 
 
 		 396 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1998  major facilitator transporter  39.66 
 
 		 396 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.580365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0882  major facilitator family transporter  43.44 
 
 		 403 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158047  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1044  major facilitator family transporter  43.12 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0885  major facilitator family transporter  43.12 
 
 		 403 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.106194  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0341  major facilitator family transporter  43.12 
 
 		 403 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0088  major facilitator family transporter  43.12 
 
 		 403 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2612  major facilitator transporter  42.35 
 
 		 407 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0640  major facilitator family transporter  43.12 
 
 		 403 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286289  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2475  major facilitator family transporter  43.12 
 
 		 403 aa  230  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1978  major facilitator transporter  42.35 
 
 		 407 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2588  major facilitator transporter  42.35 
 
 		 407 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.229839  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5919  major facilitator transporter  42.81 
 
 		 403 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3563  major facilitator superfamily MFS_1  39.38 
 
 		 394 aa  220  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0709  major facilitator transporter  42.51 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0373482  normal  0.416775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2392  major facilitator family transporter  40.32 
 
 		 400 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6824  major facilitator transporter  39.13 
 
 		 398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3749  major facilitator superfamily MFS_1  38.44 
 
 		 394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.630877  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2636  major facilitator transporter  41.51 
 
 		 408 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34710  major facilitator transporter  45.68 
 
 		 417 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00447265  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2946  major facilitator family transporter  45.65 
 
 		 390 aa  202  8e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0403  major facilitator superfamily MFS_1  39.88 
 
 		 394 aa  199  7e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00475007  normal  0.145448 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3751  major facilitator superfamily MFS_1  37.17 
 
 		 410 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2027  major facilitator transporter  38.51 
 
 		 425 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.145333 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23550  arabinose efflux permease family protein  33.83 
 
 		 416 aa  183  4.0000000000000006e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.655191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24090  arabinose efflux permease family protein  35.52 
 
 		 447 aa  168  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0932  major facilitator transporter  32.75 
 
 		 426 aa  157  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0908  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.260847  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1113  major facilitator superfamily MFS_1  29.36 
 
 		 383 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000378306  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1023  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 		 432 aa  121  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1499  sugar efflux transporter  28.65 
 
 		 376 aa  119  7.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671324  normal  0.520287 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  28.97 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  32.5 
 
 		 402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3841  sugar efflux transporter  29.8 
 
 		 398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820491 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1024  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.204165  normal  0.764355 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2254  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 390 aa  113  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.364288  normal  0.844618 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  27.37 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0999  major facilitator family transporter  30.96 
 
 		 407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196023  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10750  sugar efflux transporter  27.53 
 
 		 396 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1932  sugar efflux transporter  27.35 
 
 		 388 aa  110  5e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17258  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0839  sugar efflux transporter  26.74 
 
 		 399 aa  109  9.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  28.3 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 406 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3267  sugar efflux transporter  29.32 
 
 		 413 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2201  sugar efflux transporter  29.33 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480922  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  27.19 
 
 		 390 aa  107  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  22.93 
 
 		 396 aa  106  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 401 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2428  sugar efflux transporter  28.79 
 
 		 408 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0595849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0868  sugar efflux transporter  27.35 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.202356  normal  0.905992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 404 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  29.83 
 
 		 401 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10192  integral membrane protein  27.06 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 		 403 aa  104  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  27.38 
 
 		 394 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1201  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 383 aa  103  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.915784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 		 403 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 391 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01764  MFS transporter  30.07 
 
 		 403 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315697  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5955  sugar efflux transporter  26.72 
 
 		 417 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0541401 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2000  sugar efflux transporter  26.05 
 
 		 398 aa  100  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 391 aa  100  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 395 aa  100  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 391 aa  100  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  29.74 
 
 		 416 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5225  sugar efflux transporter  26.65 
 
 		 397 aa  100  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000397206  normal  0.170795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  28.88 
 
 		 406 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 379 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 400 aa  98.2  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  28.49 
 
 		 388 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 388 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 391 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  30.27 
 
 		 400 aa  98.2  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1694  sugar efflux transporter  25.42 
 
 		 396 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0396225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1813  sugar efflux transporter  25.42 
 
 		 396 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1648  sugar efflux transporter  25.42 
 
 		 396 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1627  sugar efflux transporter  25.42 
 
 		 396 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 403 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  28.01 
 
 		 392 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  33.2 
 
 		 396 aa  97.1  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2417  sugar efflux transporter  24.1 
 
 		 395 aa  96.7  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 402 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1635  sugar efflux transporter  25.42 
 
 		 396 aa  96.7  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.626484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 404 aa  96.3  9e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>