More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2946 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2946  major facilitator family transporter  100 
 
 		 390 aa  722    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34710  major facilitator transporter  98.44 
 
 		 417 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00447265  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3068  major facilitator family transporter  61.56 
 
 		 375 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.547079  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17740  MFS transporter  65.42 
 
 		 412 aa  393  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2926  major facilitator transporter  59.84 
 
 		 401 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0235269  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4445  major facilitator transporter  57.14 
 
 		 417 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.306618 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3303  major facilitator transporter  62.69 
 
 		 396 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1998  major facilitator transporter  60.78 
 
 		 396 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.580365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35870  major facilitator family transporter  59.46 
 
 		 408 aa  359  5e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0848172  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3749  major facilitator superfamily MFS_1  56.23 
 
 		 394 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.630877  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3035  major facilitator transporter  60.48 
 
 		 390 aa  357  2.9999999999999997e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1816  major facilitator transporter  61.68 
 
 		 405 aa  354  1e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3563  major facilitator superfamily MFS_1  56.64 
 
 		 394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2392  major facilitator family transporter  61.94 
 
 		 400 aa  346  5e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2612  major facilitator transporter  57.94 
 
 		 407 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3692  general substrate transporter  57.06 
 
 		 430 aa  324  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1978  major facilitator transporter  57.67 
 
 		 407 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2588  major facilitator transporter  57.67 
 
 		 407 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.229839  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1044  major facilitator family transporter  55.89 
 
 		 403 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6824  major facilitator transporter  56.25 
 
 		 398 aa  322  6e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0882  major facilitator family transporter  55.89 
 
 		 403 aa  322  7e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158047  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0341  major facilitator family transporter  55.62 
 
 		 403 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0640  major facilitator family transporter  55.62 
 
 		 403 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286289  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2475  major facilitator family transporter  55.62 
 
 		 403 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0885  major facilitator family transporter  55.62 
 
 		 403 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.106194  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0088  major facilitator family transporter  55.62 
 
 		 403 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5919  major facilitator transporter  57.94 
 
 		 403 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33690  arabinose efflux permease family protein  50.65 
 
 		 399 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2636  major facilitator transporter  57.67 
 
 		 408 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20320  arabinose efflux permease family protein  45.96 
 
 		 397 aa  303  5.000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352301  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0709  major facilitator transporter  56.14 
 
 		 399 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0373482  normal  0.416775 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3138  major facilitator transporter  47.91 
 
 		 400 aa  300  2e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2027  major facilitator transporter  51.95 
 
 		 425 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.145333 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3751  major facilitator superfamily MFS_1  45.11 
 
 		 410 aa  265  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2719  major facilitator superfamily MFS_1  43.23 
 
 		 399 aa  261  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0403  major facilitator superfamily MFS_1  53.57 
 
 		 394 aa  259  7e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00475007  normal  0.145448 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24090  arabinose efflux permease family protein  48.15 
 
 		 447 aa  250  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23550  arabinose efflux permease family protein  43.48 
 
 		 416 aa  247  2e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.655191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0908  major facilitator superfamily MFS_1  35.28 
 
 		 383 aa  199  9e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.260847  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0932  major facilitator transporter  36.6 
 
 		 426 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1023  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 		 432 aa  157  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1113  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 383 aa  156  7e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000378306  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1024  major facilitator superfamily MFS_1  36.92 
 
 		 410 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.204165  normal  0.764355 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5225  sugar efflux transporter  30.77 
 
 		 397 aa  136  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000397206  normal  0.170795 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  30.09 
 
 		 451 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  30.09 
 
 		 412 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  30.09 
 
 		 451 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  30.09 
 
 		 451 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  30.09 
 
 		 451 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  30.09 
 
 		 451 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  30.09 
 
 		 394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  31.6 
 
 		 399 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  30.37 
 
 		 396 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  33.78 
 
 		 406 aa  132  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3267  sugar efflux transporter  31.6 
 
 		 413 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  36.31 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  28.53 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6467  major facilitator transporter  36.31 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.070181  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2428  sugar efflux transporter  31.29 
 
 		 408 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0595849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  35.91 
 
 		 391 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01764  MFS transporter  34.97 
 
 		 403 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315697  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5629  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 404 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208414  normal  0.0407096 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  30.51 
 
 		 405 aa  129  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  36.19 
 
 		 391 aa  130  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 404 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  33.8 
 
 		 388 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 404 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  32.21 
 
 		 402 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 404 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 390 aa  126  6e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 388 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  35.08 
 
 		 391 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 		 403 aa  125  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 		 411 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  32.3 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  32.95 
 
 		 410 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1764  major facilitator superfamily MFS_1  33.63 
 
 		 420 aa  125  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 		 403 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1932  sugar efflux transporter  28 
 
 		 388 aa  124  2e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17258  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10750  sugar efflux transporter  30.37 
 
 		 396 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  29.23 
 
 		 396 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0632  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 410 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  34.48 
 
 		 391 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  31.64 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2453  major facilitator superfamily MFS_1  34.76 
 
 		 414 aa  123  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.21371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6308  sugar efflux transporter  29.38 
 
 		 394 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260956  normal  0.44314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 407 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  36.81 
 
 		 400 aa  122  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1499  sugar efflux transporter  30.03 
 
 		 376 aa  122  8e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671324  normal  0.520287 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  35.08 
 
 		 391 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  33.74 
 
 		 395 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  33.94 
 
 		 416 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  33.9 
 
 		 391 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  32.77 
 
 		 395 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1486  major facilitator superfamily MFS_1  33.14 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000311067 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 408 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  34.6 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  36.02 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>