More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2719 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2719  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 399 aa  759    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20320  arabinose efflux permease family protein  52.03 
 
 		 397 aa  392  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352301  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33690  arabinose efflux permease family protein  48.99 
 
 		 399 aa  328  7e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4445  major facilitator transporter  42.22 
 
 		 417 aa  259  8e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.306618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3035  major facilitator transporter  43.24 
 
 		 390 aa  255  9e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35870  major facilitator family transporter  43.71 
 
 		 408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0848172  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0341  major facilitator family transporter  43.44 
 
 		 403 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0088  major facilitator family transporter  43.44 
 
 		 403 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0640  major facilitator family transporter  43.44 
 
 		 403 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286289  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3138  major facilitator transporter  40.33 
 
 		 400 aa  247  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2475  major facilitator family transporter  43.44 
 
 		 403 aa  248  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0885  major facilitator family transporter  43.44 
 
 		 403 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.106194  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1044  major facilitator family transporter  43.44 
 
 		 403 aa  247  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0882  major facilitator family transporter  43.17 
 
 		 403 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158047  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1816  major facilitator transporter  42.35 
 
 		 405 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3068  major facilitator family transporter  41.18 
 
 		 375 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.547079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2926  major facilitator transporter  40.56 
 
 		 401 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0235269  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3751  major facilitator superfamily MFS_1  40.34 
 
 		 410 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6824  major facilitator transporter  41.53 
 
 		 398 aa  233  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3749  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 394 aa  231  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.630877  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3563  major facilitator superfamily MFS_1  40.56 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3692  general substrate transporter  39.03 
 
 		 430 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5919  major facilitator transporter  40.45 
 
 		 403 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2612  major facilitator transporter  42.69 
 
 		 407 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17740  MFS transporter  40.46 
 
 		 412 aa  219  6e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1978  major facilitator transporter  40.98 
 
 		 407 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2588  major facilitator transporter  40.98 
 
 		 407 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.229839  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3303  major facilitator transporter  37.43 
 
 		 396 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1998  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 396 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.580365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0403  major facilitator superfamily MFS_1  41.3 
 
 		 394 aa  215  9e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00475007  normal  0.145448 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0709  major facilitator transporter  41.72 
 
 		 399 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0373482  normal  0.416775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2027  major facilitator transporter  38.53 
 
 		 425 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.145333 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2636  major facilitator transporter  40.87 
 
 		 408 aa  206  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2392  major facilitator family transporter  38.26 
 
 		 400 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2946  major facilitator family transporter  45.05 
 
 		 390 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34710  major facilitator transporter  44.74 
 
 		 417 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00447265  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23550  arabinose efflux permease family protein  33.09 
 
 		 416 aa  180  4.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.655191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24090  arabinose efflux permease family protein  37.38 
 
 		 447 aa  177  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0908  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 		 383 aa  177  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.260847  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1113  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 383 aa  162  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000378306  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0932  major facilitator transporter  31.92 
 
 		 426 aa  157  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1499  sugar efflux transporter  30.77 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671324  normal  0.520287 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1023  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 		 432 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  29.43 
 
 		 402 aa  132  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0839  sugar efflux transporter  27.93 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1932  sugar efflux transporter  27.61 
 
 		 388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17258  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2000  sugar efflux transporter  26.05 
 
 		 398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10192  integral membrane protein  32.13 
 
 		 413 aa  130  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0868  sugar efflux transporter  28.41 
 
 		 399 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.202356  normal  0.905992 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1813  sugar efflux transporter  26.74 
 
 		 396 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1627  sugar efflux transporter  26.46 
 
 		 396 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1694  sugar efflux transporter  26.74 
 
 		 396 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0396225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1648  sugar efflux transporter  26.74 
 
 		 396 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1024  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 		 410 aa  129  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.204165  normal  0.764355 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1635  sugar efflux transporter  26.74 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.626484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  28.18 
 
 		 396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0999  major facilitator family transporter  29.24 
 
 		 407 aa  127  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196023  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 390 aa  126  5e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  29.65 
 
 		 397 aa  126  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  31.64 
 
 		 406 aa  126  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5955  sugar efflux transporter  27.87 
 
 		 417 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0541401 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 404 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  28 
 
 		 405 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2201  sugar efflux transporter  26.4 
 
 		 407 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480922  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3267  sugar efflux transporter  28 
 
 		 413 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2428  sugar efflux transporter  27.69 
 
 		 408 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0595849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2417  sugar efflux transporter  28.12 
 
 		 395 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10750  sugar efflux transporter  28.93 
 
 		 396 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3841  sugar efflux transporter  27.32 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820491 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  26.22 
 
 		 394 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  27.69 
 
 		 399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2289  transporter, putative  25.82 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00964555  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6513  sugar efflux transporter  25.9 
 
 		 451 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5225  sugar efflux transporter  26.57 
 
 		 397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000397206  normal  0.170795 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1316  sugar efflux transporter  26.22 
 
 		 400 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6103  sugar efflux transporter  26.27 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.542417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5582  sugar efflux transporter  24.8 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6308  sugar efflux transporter  25.42 
 
 		 394 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260956  normal  0.44314 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  29.95 
 
 		 412 aa  110  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  30.06 
 
 		 403 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2142  sugar efflux transporter  27.17 
 
 		 396 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 397 aa  109  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1642  sugar efflux transporter  26.61 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 401 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1677  sugar efflux transporter  26.61 
 
 		 396 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  30.7 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01485  sugar efflux transporter  26.61 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.709181  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2118  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00060856  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3194  sugar efflux transporter  26.46 
 
 		 419 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01496  hypothetical protein  26.61 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.679855  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1730  sugar efflux transporter  26.61 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.828812  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2130  sugar efflux transporter  26.61 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1610  sugar efflux transporter  26.61 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>