More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3068 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3068  major facilitator family transporter  100 
 
 		 375 aa  714    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.547079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2926  major facilitator transporter  90.13 
 
 		 401 aa  615  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0235269  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17740  MFS transporter  64.36 
 
 		 412 aa  411  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4445  major facilitator transporter  57.6 
 
 		 417 aa  402  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.306618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3035  major facilitator transporter  59.08 
 
 		 390 aa  366  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3563  major facilitator superfamily MFS_1  58.27 
 
 		 394 aa  364  1e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3303  major facilitator transporter  58.06 
 
 		 396 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1816  major facilitator transporter  60.81 
 
 		 405 aa  361  9e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3749  major facilitator superfamily MFS_1  58.27 
 
 		 394 aa  361  9e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.630877  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35870  major facilitator family transporter  59.67 
 
 		 408 aa  356  3.9999999999999996e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0848172  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3692  general substrate transporter  54.1 
 
 		 430 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2392  major facilitator family transporter  57.22 
 
 		 400 aa  339  5e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6824  major facilitator transporter  53.68 
 
 		 398 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1998  major facilitator transporter  56.45 
 
 		 396 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.580365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0882  major facilitator family transporter  55.89 
 
 		 403 aa  329  4e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158047  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0341  major facilitator family transporter  55.62 
 
 		 403 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1044  major facilitator family transporter  55.62 
 
 		 403 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0640  major facilitator family transporter  55.62 
 
 		 403 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286289  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2475  major facilitator family transporter  55.62 
 
 		 403 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0885  major facilitator family transporter  55.62 
 
 		 403 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.106194  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0088  major facilitator family transporter  55.62 
 
 		 403 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3138  major facilitator transporter  52.19 
 
 		 400 aa  318  9e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33690  arabinose efflux permease family protein  50.14 
 
 		 399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34710  major facilitator transporter  61.56 
 
 		 417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00447265  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2946  major facilitator family transporter  61.56 
 
 		 390 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2027  major facilitator transporter  50.55 
 
 		 425 aa  299  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.145333 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5919  major facilitator transporter  55.07 
 
 		 403 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1978  major facilitator transporter  54.79 
 
 		 407 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2588  major facilitator transporter  54.79 
 
 		 407 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.229839  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2612  major facilitator transporter  54.52 
 
 		 407 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2636  major facilitator transporter  54.79 
 
 		 408 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3751  major facilitator superfamily MFS_1  45.01 
 
 		 410 aa  277  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0709  major facilitator transporter  51.89 
 
 		 399 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0373482  normal  0.416775 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0403  major facilitator superfamily MFS_1  52.17 
 
 		 394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00475007  normal  0.145448 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20320  arabinose efflux permease family protein  40.55 
 
 		 397 aa  256  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352301  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23550  arabinose efflux permease family protein  43.82 
 
 		 416 aa  249  4e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.655191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2719  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 399 aa  236  6e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24090  arabinose efflux permease family protein  43.96 
 
 		 447 aa  216  4e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0908  major facilitator superfamily MFS_1  31.66 
 
 		 383 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.260847  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0932  major facilitator transporter  32.98 
 
 		 426 aa  166  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  34.21 
 
 		 407 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1023  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 		 432 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1024  major facilitator superfamily MFS_1  35.35 
 
 		 410 aa  139  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.204165  normal  0.764355 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1113  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 383 aa  139  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000378306  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 404 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  33.8 
 
 		 406 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 		 412 aa  132  9e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  31.29 
 
 		 451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  31.07 
 
 		 394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  31.29 
 
 		 451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  31.29 
 
 		 451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  30.99 
 
 		 451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  30.99 
 
 		 451 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  35.22 
 
 		 390 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  33.63 
 
 		 405 aa  125  9e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  29.26 
 
 		 396 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 390 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1569  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 		 408 aa  123  4e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.405148  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  34.2 
 
 		 409 aa  123  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3167  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 414 aa  123  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.508842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 392 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 388 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  34.02 
 
 		 735 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  32.16 
 
 		 400 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  31.23 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 388 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  31.85 
 
 		 391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  26.7 
 
 		 394 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  31.25 
 
 		 400 aa  117  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 404 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  29.24 
 
 		 396 aa  116  7.999999999999999e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1627  sugar efflux transporter  26.14 
 
 		 396 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1813  sugar efflux transporter  26.14 
 
 		 396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1694  sugar efflux transporter  26.14 
 
 		 396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0396225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  29.78 
 
 		 391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  28.57 
 
 		 405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6308  sugar efflux transporter  26.84 
 
 		 394 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260956  normal  0.44314 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1648  sugar efflux transporter  26.14 
 
 		 396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  28.3 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  29.51 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06496  hypothetical protein  27.35 
 
 		 395 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  29.78 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1635  sugar efflux transporter  26.14 
 
 		 396 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.626484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1201  major facilitator transporter  32.18 
 
 		 383 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.915784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  29.78 
 
 		 391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0872  putative transport transmembrane protein  34.21 
 
 		 425 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.661394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 391 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5225  sugar efflux transporter  25.57 
 
 		 397 aa  113  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000397206  normal  0.170795 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 391 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  29.78 
 
 		 391 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  33.14 
 
 		 406 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 408 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5955  sugar efflux transporter  28.25 
 
 		 417 aa  112  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0541401 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>