More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_0882 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0341  major facilitator family transporter  99.26 
 
 
403 aa  745    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0885  major facilitator family transporter  99.26 
 
 
403 aa  745    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.106194  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1044  major facilitator family transporter  99.5 
 
 
403 aa  747    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0882  major facilitator family transporter  100 
 
 
403 aa  751    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158047  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0088  major facilitator family transporter  99.26 
 
 
403 aa  745    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0640  major facilitator family transporter  99.26 
 
 
403 aa  745    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286289  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2475  major facilitator family transporter  99.26 
 
 
403 aa  745    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5919  major facilitator transporter  71.46 
 
 
403 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2612  major facilitator transporter  69.44 
 
 
407 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1978  major facilitator transporter  69.68 
 
 
407 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2588  major facilitator transporter  69.68 
 
 
407 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.229839  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2636  major facilitator transporter  72.48 
 
 
408 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0709  major facilitator transporter  69.58 
 
 
399 aa  421  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0373482  normal  0.416775 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3035  major facilitator transporter  65 
 
 
390 aa  403  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13751  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35870  major facilitator family transporter  63.42 
 
 
408 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0848172  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3749  major facilitator superfamily MFS_1  61.68 
 
 
394 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.630877  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6824  major facilitator transporter  60.75 
 
 
398 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3563  major facilitator superfamily MFS_1  60.33 
 
 
394 aa  373  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3692  general substrate transporter  56.25 
 
 
430 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1816  major facilitator transporter  61.05 
 
 
405 aa  354  1e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4445  major facilitator transporter  52.34 
 
 
417 aa  347  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.306618 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3068  major facilitator family transporter  55.89 
 
 
375 aa  343  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.547079  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17740  MFS transporter  59.13 
 
 
412 aa  342  7e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2926  major facilitator transporter  53.42 
 
 
401 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0235269  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33690  arabinose efflux permease family protein  50 
 
 
399 aa  319  6e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3303  major facilitator transporter  52.56 
 
 
396 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2027  major facilitator transporter  54.66 
 
 
425 aa  312  4.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.145333 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1998  major facilitator transporter  50.65 
 
 
396 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.580365  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3138  major facilitator transporter  50 
 
 
400 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2392  major facilitator family transporter  52.9 
 
 
400 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110299  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0403  major facilitator superfamily MFS_1  52.91 
 
 
394 aa  278  9e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00475007  normal  0.145448 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23550  arabinose efflux permease family protein  45.48 
 
 
416 aa  278  2e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.655191  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34710  major facilitator transporter  56.75 
 
 
417 aa  272  9e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00447265  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2946  major facilitator family transporter  56.08 
 
 
390 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3751  major facilitator superfamily MFS_1  45.48 
 
 
410 aa  269  5e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2719  major facilitator superfamily MFS_1  42.45 
 
 
399 aa  256  6e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20320  arabinose efflux permease family protein  41.37 
 
 
397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352301  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24090  arabinose efflux permease family protein  47.29 
 
 
447 aa  242  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0908  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 
383 aa  172  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.260847  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0932  major facilitator transporter  33.43 
 
 
426 aa  148  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1113  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 
383 aa  144  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000378306  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1023  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 
432 aa  139  7.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  32 
 
 
394 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  32.79 
 
 
402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5225  sugar efflux transporter  30.73 
 
 
397 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000397206  normal  0.170795 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6308  sugar efflux transporter  30.91 
 
 
394 aa  133  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260956  normal  0.44314 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1024  major facilitator superfamily MFS_1  35.65 
 
 
410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.204165  normal  0.764355 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5582  sugar efflux transporter  29.57 
 
 
410 aa  130  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  29.67 
 
 
412 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  30.36 
 
 
396 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  29.67 
 
 
451 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  29.67 
 
 
451 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  29.67 
 
 
451 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  29.38 
 
 
451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  29.06 
 
 
396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  29.67 
 
 
394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  29.38 
 
 
451 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1932  sugar efflux transporter  29.91 
 
 
388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  29.32 
 
 
402 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  32.25 
 
 
404 aa  126  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10750  sugar efflux transporter  28.53 
 
 
396 aa  126  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5955  sugar efflux transporter  29.82 
 
 
417 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0541401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  33.78 
 
 
406 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2201  sugar efflux transporter  29.75 
 
 
407 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480922  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0707  sugar efflux transporter  28.32 
 
 
394 aa  124  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  29.41 
 
 
402 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3267  sugar efflux transporter  30.34 
 
 
413 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  31.17 
 
 
399 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  33.42 
 
 
396 aa  122  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2428  sugar efflux transporter  30.34 
 
 
408 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0595849  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4885  major facilitator family transporter  28.46 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00139132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4727  major facilitator transporter  28.46 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1267  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5128  major facilitator family transporter  28.46 
 
 
390 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5260  major facilitator family transporter  28.46 
 
 
414 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00289219  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5156  major facilitator family transporter  28.46 
 
 
414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  27.86 
 
 
396 aa  120  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19440  arabinose efflux permease family protein  31.86 
 
 
421 aa  120  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.864683  normal  0.0256457 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1316  sugar efflux transporter  30.65 
 
 
400 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 
390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6513  sugar efflux transporter  30.65 
 
 
451 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6103  sugar efflux transporter  30.65 
 
 
400 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.542417  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 
411 aa  119  9e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  36.54 
 
 
399 aa  119  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  32.16 
 
 
400 aa  119  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4742  major facilitator transporter  29.57 
 
 
394 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00912769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0085  major facilitator family transporter  27.94 
 
 
390 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3167  major facilitator transporter  31.62 
 
 
414 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.508842  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  34.47 
 
 
390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5160  major facilitator family transporter  27.94 
 
 
390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0632  major facilitator transporter  28.92 
 
 
410 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  28.99 
 
 
418 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 
410 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3841  sugar efflux transporter  27.05 
 
 
398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820491 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1499  sugar efflux transporter  26.72 
 
 
376 aa  116  5e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671324  normal  0.520287 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0999  major facilitator family transporter  29.01 
 
 
407 aa  117  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196023  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0839  sugar efflux transporter  28.61 
 
 
399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  34.1 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  31.94 
 
 
405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  32.38 
 
 
399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 
407 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>