More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_17740 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_17740  MFS transporter  100 
 
 
412 aa  773    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4445  major facilitator transporter  60.98 
 
 
417 aa  439  9.999999999999999e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.306618 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3068  major facilitator family transporter  64.36 
 
 
375 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.547079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2926  major facilitator transporter  61.87 
 
 
401 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0235269  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3303  major facilitator transporter  62.37 
 
 
396 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3035  major facilitator transporter  65.12 
 
 
390 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13751  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35870  major facilitator family transporter  65.8 
 
 
408 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0848172  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3749  major facilitator superfamily MFS_1  61.06 
 
 
394 aa  393  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.630877  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3692  general substrate transporter  58.96 
 
 
430 aa  393  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1816  major facilitator transporter  64.77 
 
 
405 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3563  major facilitator superfamily MFS_1  63.41 
 
 
394 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1998  major facilitator transporter  61.99 
 
 
396 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.580365  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2392  major facilitator family transporter  62.5 
 
 
400 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110299  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6824  major facilitator transporter  58.04 
 
 
398 aa  350  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0341  major facilitator family transporter  59.4 
 
 
403 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0088  major facilitator family transporter  59.4 
 
 
403 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0885  major facilitator family transporter  59.4 
 
 
403 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.106194  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0640  major facilitator family transporter  59.4 
 
 
403 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286289  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2475  major facilitator family transporter  59.4 
 
 
403 aa  342  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1044  major facilitator family transporter  59.13 
 
 
403 aa  339  5e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0882  major facilitator family transporter  59.13 
 
 
403 aa  339  5e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158047  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34710  major facilitator transporter  66.06 
 
 
417 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00447265  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2946  major facilitator family transporter  66.15 
 
 
390 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3138  major facilitator transporter  51.9 
 
 
400 aa  330  3e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5919  major facilitator transporter  55.7 
 
 
403 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33690  arabinose efflux permease family protein  51.9 
 
 
399 aa  320  3e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2612  major facilitator transporter  53.81 
 
 
407 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2027  major facilitator transporter  51.88 
 
 
425 aa  316  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.145333 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2636  major facilitator transporter  55.53 
 
 
408 aa  315  7e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1978  major facilitator transporter  53.81 
 
 
407 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2588  major facilitator transporter  53.81 
 
 
407 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.229839  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0709  major facilitator transporter  56.14 
 
 
399 aa  292  8e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0373482  normal  0.416775 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20320  arabinose efflux permease family protein  42.57 
 
 
397 aa  280  3e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352301  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3751  major facilitator superfamily MFS_1  45.21 
 
 
410 aa  280  4e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0403  major facilitator superfamily MFS_1  54.26 
 
 
394 aa  278  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00475007  normal  0.145448 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23550  arabinose efflux permease family protein  44.03 
 
 
416 aa  255  1.0000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.655191  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2719  major facilitator superfamily MFS_1  40.77 
 
 
399 aa  233  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24090  arabinose efflux permease family protein  43.18 
 
 
447 aa  229  8e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0932  major facilitator transporter  37.22 
 
 
426 aa  189  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0908  major facilitator superfamily MFS_1  34.71 
 
 
383 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.260847  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1023  major facilitator superfamily MFS_1  37.57 
 
 
432 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1113  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 
383 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000378306  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  30.22 
 
 
404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 
402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  32.28 
 
 
406 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1024  major facilitator superfamily MFS_1  36.52 
 
 
410 aa  124  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.204165  normal  0.764355 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  32.65 
 
 
410 aa  121  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  27.79 
 
 
396 aa  119  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 
390 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  30.29 
 
 
401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  29.16 
 
 
412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  34.64 
 
 
416 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  31.59 
 
 
407 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  34.63 
 
 
391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  34.85 
 
 
391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  31.03 
 
 
399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  34.26 
 
 
388 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  32.64 
 
 
403 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  34.48 
 
 
391 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 
405 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10192  integral membrane protein  28 
 
 
413 aa  113  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  32.99 
 
 
391 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  31.32 
 
 
418 aa  112  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  29.09 
 
 
402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  33.43 
 
 
388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  34.58 
 
 
391 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  32.99 
 
 
392 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  27.52 
 
 
396 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  33.43 
 
 
390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  33.43 
 
 
390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  33.43 
 
 
390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  33.43 
 
 
390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  33.43 
 
 
390 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 
407 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  29.53 
 
 
404 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3167  major facilitator transporter  30.97 
 
 
414 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.508842  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  34.08 
 
 
390 aa  110  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1790  major facilitator transporter  36.4 
 
 
388 aa  110  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0297909 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  33.88 
 
 
392 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  33.43 
 
 
390 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2475  major facilitator transporter  30.95 
 
 
402 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46904  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  29.46 
 
 
404 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  30.94 
 
 
402 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01627  putative transport protein (MFS family)  36.23 
 
 
389 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1983  major facilitator superfamily MFS_1  36.23 
 
 
389 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  33.14 
 
 
391 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1972  major facilitator transporter  36.23 
 
 
389 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1541  major facilitator transporter  36.23 
 
 
389 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.114044 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01617  hypothetical protein  36.23 
 
 
389 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1736  major facilitator transporter  36.23 
 
 
389 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000269291  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1870  major facilitator transporter  36.23 
 
 
389 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971933  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2369  transporter, major facilitator family  34.14 
 
 
389 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000585363  normal  0.236969 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  33.15 
 
 
390 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  29.21 
 
 
400 aa  108  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  29.41 
 
 
405 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10110  putative transporter  36.07 
 
 
394 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000108859  normal  0.939917 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  32.86 
 
 
391 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  28.15 
 
 
402 aa  106  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  32.95 
 
 
390 aa  106  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  34.27 
 
 
388 aa  106  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>