More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_35870 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_35870  major facilitator family transporter  100 
 
 
408 aa  774    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0848172  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3749  major facilitator superfamily MFS_1  83.46 
 
 
394 aa  565  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.630877  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3035  major facilitator transporter  83.72 
 
 
390 aa  559  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13751  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3563  major facilitator superfamily MFS_1  82.12 
 
 
394 aa  551  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1816  major facilitator transporter  79.31 
 
 
405 aa  537  1e-151  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6824  major facilitator transporter  67.93 
 
 
398 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3692  general substrate transporter  66.17 
 
 
430 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17740  MFS transporter  63.8 
 
 
412 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0341  major facilitator family transporter  62.84 
 
 
403 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1044  major facilitator family transporter  62.84 
 
 
403 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0640  major facilitator family transporter  62.84 
 
 
403 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286289  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4445  major facilitator transporter  59.94 
 
 
417 aa  382  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.306618 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2475  major facilitator family transporter  62.84 
 
 
403 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0882  major facilitator family transporter  63.11 
 
 
403 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158047  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0885  major facilitator family transporter  62.84 
 
 
403 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.106194  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0088  major facilitator family transporter  62.84 
 
 
403 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3068  major facilitator family transporter  60.6 
 
 
375 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.547079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2926  major facilitator transporter  57.77 
 
 
401 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0235269  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3138  major facilitator transporter  55.25 
 
 
400 aa  355  6.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5919  major facilitator transporter  61.24 
 
 
403 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2027  major facilitator transporter  55.17 
 
 
425 aa  347  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.145333 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2612  major facilitator transporter  59.49 
 
 
407 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1978  major facilitator transporter  59.49 
 
 
407 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2588  major facilitator transporter  59.49 
 
 
407 aa  342  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.229839  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2636  major facilitator transporter  61.03 
 
 
408 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3303  major facilitator transporter  54.03 
 
 
396 aa  328  9e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1998  major facilitator transporter  54.31 
 
 
396 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.580365  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0709  major facilitator transporter  59.21 
 
 
399 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0373482  normal  0.416775 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33690  arabinose efflux permease family protein  51.7 
 
 
399 aa  317  3e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0403  major facilitator superfamily MFS_1  57.57 
 
 
394 aa  299  6e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00475007  normal  0.145448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2392  major facilitator family transporter  54.98 
 
 
400 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110299  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3751  major facilitator superfamily MFS_1  46 
 
 
410 aa  291  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2946  major facilitator family transporter  57.14 
 
 
390 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23550  arabinose efflux permease family protein  43.31 
 
 
416 aa  282  1e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.655191  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34710  major facilitator transporter  54.86 
 
 
417 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00447265  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20320  arabinose efflux permease family protein  40.16 
 
 
397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352301  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24090  arabinose efflux permease family protein  48.03 
 
 
447 aa  250  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2719  major facilitator superfamily MFS_1  41.58 
 
 
399 aa  246  4.9999999999999997e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0908  major facilitator superfamily MFS_1  34.72 
 
 
383 aa  195  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.260847  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0932  major facilitator transporter  33.84 
 
 
426 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1113  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 
383 aa  156  6e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000378306  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1023  major facilitator superfamily MFS_1  32.99 
 
 
432 aa  155  9e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  33.72 
 
 
406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  29.13 
 
 
396 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  31.46 
 
 
404 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 
412 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  33.91 
 
 
390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1024  major facilitator superfamily MFS_1  33.99 
 
 
410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.204165  normal  0.764355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  32.01 
 
 
407 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3841  sugar efflux transporter  28.97 
 
 
398 aa  136  9e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000820491 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  29.72 
 
 
404 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  31.89 
 
 
395 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  31.64 
 
 
411 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2738  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 
416 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  30.4 
 
 
418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  30.48 
 
 
410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1932  sugar efflux transporter  28.73 
 
 
388 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17258  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  29.28 
 
 
401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  27.01 
 
 
398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0632  major facilitator transporter  30.2 
 
 
410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  32.91 
 
 
391 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2353  major facilitator transporter  32.21 
 
 
413 aa  127  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 
402 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  29.46 
 
 
408 aa  127  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3167  major facilitator transporter  30.05 
 
 
414 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.508842  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  26.11 
 
 
451 aa  126  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  26.11 
 
 
451 aa  126  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  26.11 
 
 
451 aa  126  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  25.82 
 
 
451 aa  126  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 
412 aa  126  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  25.82 
 
 
451 aa  126  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  26.11 
 
 
394 aa  126  9e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  28.05 
 
 
396 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 
390 aa  125  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  31.08 
 
 
402 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  30.25 
 
 
402 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  32.63 
 
 
391 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 
407 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  28.68 
 
 
402 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1499  sugar efflux transporter  27.73 
 
 
376 aa  124  4e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671324  normal  0.520287 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  32.76 
 
 
400 aa  123  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0999  major facilitator family transporter  29.63 
 
 
407 aa  122  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196023  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  30.91 
 
 
399 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2201  sugar efflux transporter  29.75 
 
 
407 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480922  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0328  purine ribonucleoside efflux pump NepI  27.93 
 
 
397 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  30.84 
 
 
405 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  30.95 
 
 
399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  31.55 
 
 
391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  32.36 
 
 
391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  31.85 
 
 
416 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  32.36 
 
 
397 aa  121  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  29.89 
 
 
394 aa  121  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  29.76 
 
 
404 aa  120  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10750  sugar efflux transporter  27.56 
 
 
396 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6308  sugar efflux transporter  29.65 
 
 
394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260956  normal  0.44314 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2475  major facilitator transporter  31.23 
 
 
402 aa  120  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46904  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  28.53 
 
 
404 aa  120  6e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  32.1 
 
 
391 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  28.46 
 
 
415 aa  119  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  28.46 
 
 
404 aa  119  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>