More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2588 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1978  major facilitator transporter  100 
 
 		 407 aa  762    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2588  major facilitator transporter  100 
 
 		 407 aa  762    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.229839  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2612  major facilitator transporter  98.03 
 
 		 407 aa  749    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2636  major facilitator transporter  93.37 
 
 		 408 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5919  major facilitator transporter  88.21 
 
 		 403 aa  592  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0709  major facilitator transporter  82.8 
 
 		 399 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0373482  normal  0.416775 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1044  major facilitator family transporter  71.89 
 
 		 403 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0882  major facilitator family transporter  72.16 
 
 		 403 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158047  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0341  major facilitator family transporter  71.62 
 
 		 403 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0885  major facilitator family transporter  71.62 
 
 		 403 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.106194  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0088  major facilitator family transporter  71.62 
 
 		 403 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0640  major facilitator family transporter  71.62 
 
 		 403 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286289  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2475  major facilitator family transporter  71.62 
 
 		 403 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3035  major facilitator transporter  62.83 
 
 		 390 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3749  major facilitator superfamily MFS_1  59.34 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.630877  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35870  major facilitator family transporter  60.21 
 
 		 408 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0848172  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3563  major facilitator superfamily MFS_1  60.05 
 
 		 394 aa  359  4e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6824  major facilitator transporter  57.38 
 
 		 398 aa  346  4e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1816  major facilitator transporter  59.18 
 
 		 405 aa  345  6e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3692  general substrate transporter  57.22 
 
 		 430 aa  344  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4445  major facilitator transporter  53.91 
 
 		 417 aa  345  1e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.306618 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3068  major facilitator family transporter  54.79 
 
 		 375 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.547079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2926  major facilitator transporter  53.97 
 
 		 401 aa  323  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0235269  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17740  MFS transporter  53.81 
 
 		 412 aa  316  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3303  major facilitator transporter  49.5 
 
 		 396 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33690  arabinose efflux permease family protein  50 
 
 		 399 aa  301  1e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1998  major facilitator transporter  50 
 
 		 396 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.580365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2027  major facilitator transporter  50.99 
 
 		 425 aa  290  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.145333 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3138  major facilitator transporter  47.84 
 
 		 400 aa  289  5.0000000000000004e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23550  arabinose efflux permease family protein  47.19 
 
 		 416 aa  289  6e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.655191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2392  major facilitator family transporter  48.14 
 
 		 400 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2946  major facilitator family transporter  57.67 
 
 		 390 aa  274  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0403  major facilitator superfamily MFS_1  52.26 
 
 		 394 aa  274  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00475007  normal  0.145448 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34710  major facilitator transporter  57.41 
 
 		 417 aa  272  9e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00447265  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3751  major facilitator superfamily MFS_1  43.96 
 
 		 410 aa  264  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20320  arabinose efflux permease family protein  40.87 
 
 		 397 aa  262  6.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352301  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24090  arabinose efflux permease family protein  45.84 
 
 		 447 aa  256  5e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2719  major facilitator superfamily MFS_1  41.86 
 
 		 399 aa  243  3.9999999999999997e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0908  major facilitator superfamily MFS_1  32.53 
 
 		 383 aa  184  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.260847  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0932  major facilitator transporter  34 
 
 		 426 aa  150  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1024  major facilitator superfamily MFS_1  37.71 
 
 		 410 aa  139  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.204165  normal  0.764355 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1113  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 		 383 aa  139  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000378306  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  36.24 
 
 		 390 aa  139  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  34.63 
 
 		 406 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1023  major facilitator superfamily MFS_1  33.8 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 404 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  30.68 
 
 		 396 aa  133  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19440  arabinose efflux permease family protein  32.62 
 
 		 421 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.864683  normal  0.0256457 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 		 411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  30.06 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5156  major facilitator family transporter  30.22 
 
 		 414 aa  119  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1932  sugar efflux transporter  28.4 
 
 		 388 aa  119  9e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4727  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1267  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  33.06 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5128  major facilitator family transporter  30.22 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  29.02 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  29.29 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  29.29 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5260  major facilitator family transporter  29.95 
 
 		 414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00289219  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  29.29 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  29.02 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4885  major facilitator family transporter  29.95 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00139132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4742  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 394 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00912769  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  32.69 
 
 		 399 aa  117  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  29.59 
 
 		 394 aa  117  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2475  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 402 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 401 aa  116  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  30.81 
 
 		 402 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0085  major facilitator family transporter  28.53 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  28.01 
 
 		 394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  29.78 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  36.49 
 
 		 406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  32.79 
 
 		 389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5167  major facilitator family transporter  30.05 
 
 		 390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  29.65 
 
 		 398 aa  114  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0839  sugar efflux transporter  29.13 
 
 		 399 aa  114  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5160  major facilitator family transporter  28.25 
 
 		 390 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4844  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 431 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  29.48 
 
 		 399 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6308  sugar efflux transporter  28.89 
 
 		 394 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260956  normal  0.44314 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1499  sugar efflux transporter  27.13 
 
 		 376 aa  113  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671324  normal  0.520287 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  32.48 
 
 		 403 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6467  major facilitator transporter  32.48 
 
 		 403 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.070181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  31.91 
 
 		 402 aa  112  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2479  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 395 aa  112  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000498746  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2528  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 395 aa  112  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00311461  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 		 407 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  30.68 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  32.66 
 
 		 389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3841  sugar efflux transporter  27.49 
 
 		 398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820491 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10192  integral membrane protein  32.99 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  29.06 
 
 		 395 aa  111  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>