More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0932 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0932  major facilitator transporter  100 
 
 		 426 aa  804    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1023  major facilitator superfamily MFS_1  70.4 
 
 		 432 aa  490  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35870  major facilitator family transporter  35.28 
 
 		 408 aa  172  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0848172  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6824  major facilitator transporter  36.44 
 
 		 398 aa  170  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4445  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 417 aa  168  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.306618 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17740  MFS transporter  37.22 
 
 		 412 aa  167  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3749  major facilitator superfamily MFS_1  34.31 
 
 		 394 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.630877  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1024  major facilitator superfamily MFS_1  37.18 
 
 		 410 aa  164  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.204165  normal  0.764355 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1816  major facilitator transporter  36.15 
 
 		 405 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2926  major facilitator transporter  34.95 
 
 		 401 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0235269  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3068  major facilitator family transporter  32.98 
 
 		 375 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.547079  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20320  arabinose efflux permease family protein  31.5 
 
 		 397 aa  159  6e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352301  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3563  major facilitator superfamily MFS_1  33.62 
 
 		 394 aa  160  6e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0908  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 		 383 aa  159  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.260847  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3692  general substrate transporter  35.24 
 
 		 430 aa  158  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3035  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 390 aa  158  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33690  arabinose efflux permease family protein  35.56 
 
 		 399 aa  153  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2719  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 399 aa  151  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  31.89 
 
 		 401 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3138  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 400 aa  143  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24090  arabinose efflux permease family protein  34.2 
 
 		 447 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3303  major facilitator transporter  32.76 
 
 		 396 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0403  major facilitator superfamily MFS_1  37.73 
 
 		 394 aa  139  8.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00475007  normal  0.145448 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 404 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 401 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3594  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 393 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.273434  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23550  arabinose efflux permease family protein  32.5 
 
 		 416 aa  137  5e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.655191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 		 407 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2612  major facilitator transporter  33.75 
 
 		 407 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  27.93 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1998  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.580365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  32.11 
 
 		 400 aa  132  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  34.22 
 
 		 402 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0882  major facilitator family transporter  32.71 
 
 		 403 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158047  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1978  major facilitator transporter  34 
 
 		 407 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2588  major facilitator transporter  34 
 
 		 407 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.229839  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0341  major facilitator family transporter  32.44 
 
 		 403 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2475  major facilitator family transporter  32.44 
 
 		 403 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0088  major facilitator family transporter  32.44 
 
 		 403 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0885  major facilitator family transporter  32.44 
 
 		 403 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.106194  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0640  major facilitator family transporter  32.44 
 
 		 403 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286289  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1044  major facilitator family transporter  32.44 
 
 		 403 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2027  major facilitator transporter  35.44 
 
 		 425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.145333 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  34.5 
 
 		 404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2636  major facilitator transporter  35.97 
 
 		 408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0709  major facilitator transporter  38.91 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0373482  normal  0.416775 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 		 402 aa  127  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  33.52 
 
 		 399 aa  126  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0868  sugar efflux transporter  27.72 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.202356  normal  0.905992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 407 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0150  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  31.34 
 
 		 395 aa  125  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0159  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 411 aa  124  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 400 aa  124  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  30.55 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5919  major facilitator transporter  35.44 
 
 		 403 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 403 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6467  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 403 aa  124  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.070181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  31.21 
 
 		 402 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  32.7 
 
 		 412 aa  123  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34710  major facilitator transporter  38.61 
 
 		 417 aa  123  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00447265  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  31.81 
 
 		 406 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10192  integral membrane protein  29.1 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1113  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000378306  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2946  major facilitator family transporter  36.6 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  31.36 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0839  sugar efflux transporter  28.29 
 
 		 399 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 		 403 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3841  sugar efflux transporter  28.39 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820491 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 		 403 aa  121  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3051  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 418 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1945  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 401 aa  120  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2353  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 413 aa  119  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  32.23 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1381  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 394 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0207  putative transporter transmembrane protein  30.43 
 
 		 408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  31.76 
 
 		 403 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 395 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  31.78 
 
 		 400 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2647  major facilitator family transporter  30.53 
 
 		 408 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  29.57 
 
 		 396 aa  116  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  30.61 
 
 		 408 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3960  major facilitator transporter  31.84 
 
 		 400 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  31.56 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2152  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 408 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0632  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3182  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5629  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208414  normal  0.0407096 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2563  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  31.27 
 
 		 410 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>