More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_23550 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_23550  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 416 aa  783    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.655191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3035  major facilitator transporter  47.56 
 
 		 390 aa  275  8e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6824  major facilitator transporter  46.4 
 
 		 398 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4445  major facilitator transporter  43.67 
 
 		 417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.306618 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3692  general substrate transporter  47.09 
 
 		 430 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3563  major facilitator superfamily MFS_1  45.77 
 
 		 394 aa  264  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2612  major facilitator transporter  47.47 
 
 		 407 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3749  major facilitator superfamily MFS_1  44.67 
 
 		 394 aa  261  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.630877  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1978  major facilitator transporter  47.47 
 
 		 407 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2588  major facilitator transporter  47.47 
 
 		 407 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.229839  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35870  major facilitator family transporter  44.1 
 
 		 408 aa  259  5.0000000000000005e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0848172  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5919  major facilitator transporter  47.76 
 
 		 403 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0341  major facilitator family transporter  45.62 
 
 		 403 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1044  major facilitator family transporter  45.62 
 
 		 403 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0885  major facilitator family transporter  45.62 
 
 		 403 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.106194  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0088  major facilitator family transporter  45.62 
 
 		 403 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2475  major facilitator family transporter  45.62 
 
 		 403 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0640  major facilitator family transporter  45.62 
 
 		 403 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286289  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0882  major facilitator family transporter  45.62 
 
 		 403 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158047  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1816  major facilitator transporter  47.94 
 
 		 405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2027  major facilitator transporter  46.48 
 
 		 425 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.145333 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2636  major facilitator transporter  47.9 
 
 		 408 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3068  major facilitator family transporter  45.02 
 
 		 375 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.547079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2926  major facilitator transporter  43.34 
 
 		 401 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0235269  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33690  arabinose efflux permease family protein  42.46 
 
 		 399 aa  241  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17740  MFS transporter  46.06 
 
 		 412 aa  233  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3303  major facilitator transporter  42.65 
 
 		 396 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0709  major facilitator transporter  46.53 
 
 		 399 aa  232  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0373482  normal  0.416775 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24090  arabinose efflux permease family protein  43.54 
 
 		 447 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3138  major facilitator transporter  39.3 
 
 		 400 aa  222  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1998  major facilitator transporter  40.76 
 
 		 396 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.580365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2392  major facilitator family transporter  42.37 
 
 		 400 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0403  major facilitator superfamily MFS_1  43.93 
 
 		 394 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00475007  normal  0.145448 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20320  arabinose efflux permease family protein  34.34 
 
 		 397 aa  197  3e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352301  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34710  major facilitator transporter  43.64 
 
 		 417 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00447265  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3751  major facilitator superfamily MFS_1  35.29 
 
 		 410 aa  194  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2946  major facilitator family transporter  45.59 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0908  major facilitator superfamily MFS_1  31.99 
 
 		 383 aa  176  7e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.260847  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2719  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  34.29 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  34.29 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  34.29 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  34.29 
 
 		 404 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1113  major facilitator superfamily MFS_1  28.91 
 
 		 383 aa  147  3e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000378306  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  33.78 
 
 		 404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  34.29 
 
 		 404 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  33.95 
 
 		 404 aa  146  6e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  34.39 
 
 		 404 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  34.39 
 
 		 415 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 415 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  34.39 
 
 		 404 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  35 
 
 		 400 aa  144  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0932  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 426 aa  144  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  34.41 
 
 		 394 aa  144  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 402 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  34.13 
 
 		 404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 398 aa  138  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5034  major facilitator transporter  35.94 
 
 		 403 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 404 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  33.61 
 
 		 400 aa  136  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  32.9 
 
 		 404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1381  major facilitator transporter  33.97 
 
 		 394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  29.07 
 
 		 396 aa  133  6e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3791  sugar efflux transporter  32.17 
 
 		 389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0663735  decreased coverage  0.000000695018 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  33.13 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  33.43 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0707  sugar efflux transporter  31.87 
 
 		 394 aa  131  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1023  major facilitator superfamily MFS_1  32.75 
 
 		 432 aa  130  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4861  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 402 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  30.46 
 
 		 398 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  34.51 
 
 		 409 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 403 aa  126  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0138  sugar efflux transporter  29.96 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  29.5 
 
 		 402 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5295  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5453  major facilitator transporter  30.98 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4750  major facilitator transporter  30.98 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.70081 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5409  major facilitator transporter  30.98 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  33.14 
 
 		 401 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  31.36 
 
 		 391 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2563  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 403 aa  123  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 379 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 		 411 aa  123  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  31.91 
 
 		 397 aa  122  8e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  32.38 
 
 		 399 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 		 412 aa  122  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1932  sugar efflux transporter  27.98 
 
 		 388 aa  120  3e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17258  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2353  major facilitator transporter  31.72 
 
 		 413 aa  120  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4359  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 387 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  31.25 
 
 		 406 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4007  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 387 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.951834 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 400 aa  120  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  29.6 
 
 		 402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  30.59 
 
 		 391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  30.81 
 
 		 391 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2154  major facilitator family transporter  31.76 
 
 		 400 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>