More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_33690 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_33690  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 399 aa  745    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20320  arabinose efflux permease family protein  47.51 
 
 		 397 aa  335  5.999999999999999e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352301  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2719  major facilitator superfamily MFS_1  48.99 
 
 		 399 aa  328  8e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2926  major facilitator transporter  52.31 
 
 		 401 aa  323  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0235269  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3068  major facilitator family transporter  52.31 
 
 		 375 aa  319  5e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.547079  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4445  major facilitator transporter  47.49 
 
 		 417 aa  313  3.9999999999999997e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.306618 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35870  major facilitator family transporter  52.38 
 
 		 408 aa  310  2.9999999999999997e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0848172  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0341  major facilitator family transporter  49.5 
 
 		 403 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0088  major facilitator family transporter  49.5 
 
 		 403 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0885  major facilitator family transporter  49.5 
 
 		 403 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.106194  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0640  major facilitator family transporter  49.5 
 
 		 403 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286289  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2475  major facilitator family transporter  49.5 
 
 		 403 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1044  major facilitator family transporter  49.5 
 
 		 403 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0882  major facilitator family transporter  49.5 
 
 		 403 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158047  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6824  major facilitator transporter  49.73 
 
 		 398 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3035  major facilitator transporter  51.19 
 
 		 390 aa  303  4.0000000000000003e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3749  major facilitator superfamily MFS_1  48.7 
 
 		 394 aa  298  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.630877  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17740  MFS transporter  51.9 
 
 		 412 aa  296  5e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3692  general substrate transporter  45.45 
 
 		 430 aa  291  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3563  major facilitator superfamily MFS_1  48.65 
 
 		 394 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3303  major facilitator transporter  46.98 
 
 		 396 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5919  major facilitator transporter  49.87 
 
 		 403 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1816  major facilitator transporter  51.04 
 
 		 405 aa  278  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1998  major facilitator transporter  46.72 
 
 		 396 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.580365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2612  major facilitator transporter  50 
 
 		 407 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1978  major facilitator transporter  50.26 
 
 		 407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2588  major facilitator transporter  50.26 
 
 		 407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.229839  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3138  major facilitator transporter  45.21 
 
 		 400 aa  270  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0709  major facilitator transporter  48.61 
 
 		 399 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0373482  normal  0.416775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2027  major facilitator transporter  43.72 
 
 		 425 aa  259  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.145333 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2636  major facilitator transporter  49.23 
 
 		 408 aa  259  7e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2392  major facilitator family transporter  47.59 
 
 		 400 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3751  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 410 aa  252  7e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0403  major facilitator superfamily MFS_1  47.32 
 
 		 394 aa  251  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00475007  normal  0.145448 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23550  arabinose efflux permease family protein  41.96 
 
 		 416 aa  249  4e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.655191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2946  major facilitator family transporter  49.48 
 
 		 390 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34710  major facilitator transporter  48.59 
 
 		 417 aa  230  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00447265  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24090  arabinose efflux permease family protein  43.78 
 
 		 447 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0908  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 		 383 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.260847  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0932  major facilitator transporter  35.56 
 
 		 426 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1113  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 		 383 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000378306  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1024  major facilitator superfamily MFS_1  36.54 
 
 		 410 aa  136  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.204165  normal  0.764355 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1023  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 		 432 aa  136  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  38.2 
 
 		 405 aa  133  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 404 aa  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 402 aa  133  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 		 412 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  32.54 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  32.01 
 
 		 402 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3267  sugar efflux transporter  32.83 
 
 		 413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10110  putative transporter  36.45 
 
 		 394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000108859  normal  0.939917 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  32.17 
 
 		 388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2428  sugar efflux transporter  32.52 
 
 		 408 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0595849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  31.02 
 
 		 396 aa  126  7e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  30.85 
 
 		 401 aa  126  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  34.85 
 
 		 409 aa  126  8.000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.62 
 
 		 388 aa  125  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10192  integral membrane protein  31.76 
 
 		 413 aa  125  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 403 aa  123  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  28.4 
 
 		 390 aa  122  8e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 388 aa  122  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 		 403 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1499  sugar efflux transporter  29.41 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671324  normal  0.520287 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1569  major facilitator superfamily MFS_1  36.26 
 
 		 408 aa  121  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.405148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  33.88 
 
 		 390 aa  121  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 392 aa  121  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  28.28 
 
 		 451 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  28.28 
 
 		 451 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0999  major facilitator family transporter  31.56 
 
 		 407 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196023  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01764  MFS transporter  35.9 
 
 		 403 aa  120  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315697  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  31.39 
 
 		 407 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 		 397 aa  120  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  28.28 
 
 		 451 aa  120  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  35.62 
 
 		 400 aa  120  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  28.28 
 
 		 451 aa  120  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  28.28 
 
 		 451 aa  120  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 		 412 aa  119  7e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  27.73 
 
 		 394 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 416 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10750  sugar efflux transporter  30.75 
 
 		 396 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1764  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.426973  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  32.39 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  35.82 
 
 		 406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  33.69 
 
 		 391 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 391 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3841  sugar efflux transporter  27.55 
 
 		 398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820491 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  29.06 
 
 		 405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  33.69 
 
 		 391 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  33.16 
 
 		 400 aa  116  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 401 aa  116  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  33.52 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1840  major facilitator transporter  34.23 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  29.46 
 
 		 406 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  33.52 
 
 		 390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1201  major facilitator transporter  31.66 
 
 		 383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.915784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0668  MFS transporter  29.36 
 
 		 387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  33.52 
 
 		 390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  33.52 
 
 		 390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>