More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0403 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0403  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 394 aa  726    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00475007  normal  0.145448 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35870  major facilitator family transporter  56.76 
 
 		 408 aa  325  9e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0848172  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3749  major facilitator superfamily MFS_1  57.27 
 
 		 394 aa  315  9.999999999999999e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.630877  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3692  general substrate transporter  54.93 
 
 		 430 aa  310  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3035  major facilitator transporter  55.92 
 
 		 390 aa  310  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3563  major facilitator superfamily MFS_1  55.92 
 
 		 394 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1816  major facilitator transporter  55.39 
 
 		 405 aa  301  9e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2926  major facilitator transporter  53.4 
 
 		 401 aa  295  9e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0235269  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3068  major facilitator family transporter  52.47 
 
 		 375 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.547079  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6824  major facilitator transporter  54.27 
 
 		 398 aa  285  7e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4445  major facilitator transporter  50.14 
 
 		 417 aa  285  7e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.306618 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17740  MFS transporter  55.25 
 
 		 412 aa  282  9e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3138  major facilitator transporter  44.86 
 
 		 400 aa  279  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5919  major facilitator transporter  53.42 
 
 		 403 aa  276  5e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0341  major facilitator family transporter  51.56 
 
 		 403 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2612  major facilitator transporter  52.3 
 
 		 407 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0640  major facilitator family transporter  51.56 
 
 		 403 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286289  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2475  major facilitator family transporter  51.56 
 
 		 403 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0088  major facilitator family transporter  51.56 
 
 		 403 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0885  major facilitator family transporter  51.56 
 
 		 403 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.106194  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1044  major facilitator family transporter  51.56 
 
 		 403 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0882  major facilitator family transporter  51.56 
 
 		 403 aa  272  6e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158047  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0709  major facilitator transporter  53.7 
 
 		 399 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0373482  normal  0.416775 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1978  major facilitator transporter  52.08 
 
 		 407 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2588  major facilitator transporter  52.08 
 
 		 407 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.229839  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3303  major facilitator transporter  48.82 
 
 		 396 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1998  major facilitator transporter  49.12 
 
 		 396 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.580365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33690  arabinose efflux permease family protein  46.36 
 
 		 399 aa  263  3e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3751  major facilitator superfamily MFS_1  45.09 
 
 		 410 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2636  major facilitator transporter  52.6 
 
 		 408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2027  major facilitator transporter  46.3 
 
 		 425 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.145333 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24090  arabinose efflux permease family protein  48.26 
 
 		 447 aa  242  7e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2392  major facilitator family transporter  47.76 
 
 		 400 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23550  arabinose efflux permease family protein  42.93 
 
 		 416 aa  231  2e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.655191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2719  major facilitator superfamily MFS_1  41.36 
 
 		 399 aa  229  7e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34710  major facilitator transporter  53.72 
 
 		 417 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00447265  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20320  arabinose efflux permease family protein  40.05 
 
 		 397 aa  216  5e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352301  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2946  major facilitator family transporter  53.64 
 
 		 390 aa  216  8e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0908  major facilitator superfamily MFS_1  32.81 
 
 		 383 aa  193  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.260847  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1113  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 		 383 aa  166  5e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000378306  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  37.64 
 
 		 407 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0932  major facilitator transporter  36.51 
 
 		 426 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  34.36 
 
 		 406 aa  146  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5225  sugar efflux transporter  30.53 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000397206  normal  0.170795 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1024  major facilitator superfamily MFS_1  36.93 
 
 		 410 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.204165  normal  0.764355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  32.14 
 
 		 405 aa  141  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1932  sugar efflux transporter  29.25 
 
 		 388 aa  140  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17258  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 404 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  29.41 
 
 		 396 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  30.03 
 
 		 396 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6308  sugar efflux transporter  29.2 
 
 		 394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260956  normal  0.44314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2201  sugar efflux transporter  30.19 
 
 		 407 aa  136  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480922  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  32.05 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5582  sugar efflux transporter  29.2 
 
 		 410 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3841  sugar efflux transporter  28.49 
 
 		 398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820491 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10750  sugar efflux transporter  29.58 
 
 		 396 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0999  major facilitator family transporter  31.76 
 
 		 407 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196023  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  33.62 
 
 		 400 aa  132  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  37.07 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3267  sugar efflux transporter  30.18 
 
 		 413 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  28.17 
 
 		 394 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  30.03 
 
 		 401 aa  129  9.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  32.16 
 
 		 395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 401 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  30.09 
 
 		 399 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2428  sugar efflux transporter  31.12 
 
 		 408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0595849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2000  sugar efflux transporter  30.47 
 
 		 398 aa  127  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0810814 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 		 412 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  27.93 
 
 		 451 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  27.93 
 
 		 451 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  27.93 
 
 		 451 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  27.93 
 
 		 451 aa  127  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  27.93 
 
 		 451 aa  127  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  34.44 
 
 		 403 aa  126  6e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  27.97 
 
 		 394 aa  126  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1023  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 		 432 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  34.17 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1201  major facilitator transporter  34 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.915784  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4727  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.1267  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4742  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 394 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00912769  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2353  major facilitator transporter  32.46 
 
 		 413 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5128  major facilitator family transporter  28.41 
 
 		 390 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5156  major facilitator family transporter  28.69 
 
 		 414 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3791  sugar efflux transporter  29.84 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0663735  decreased coverage  0.000000695018 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4885  major facilitator family transporter  28.13 
 
 		 390 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00139132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5260  major facilitator family transporter  28.41 
 
 		 414 aa  123  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00289219  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  29.4 
 
 		 404 aa  123  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  29.76 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1499  sugar efflux transporter  29.19 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671324  normal  0.520287 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1627  sugar efflux transporter  28.03 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0839  sugar efflux transporter  29.75 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1813  sugar efflux transporter  28.03 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1694  sugar efflux transporter  28.03 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0396225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1648  sugar efflux transporter  28.03 
 
 		 396 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 		 735 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0085  major facilitator family transporter  28.13 
 
 		 390 aa  121  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 403 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>