More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2027 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2027  major facilitator transporter  100 
 
 		 425 aa  822    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.145333 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3035  major facilitator transporter  58.99 
 
 		 390 aa  371  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35870  major facilitator family transporter  55.45 
 
 		 408 aa  363  3e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0848172  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4445  major facilitator transporter  51.65 
 
 		 417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.306618 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3563  major facilitator superfamily MFS_1  56.04 
 
 		 394 aa  347  2e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3749  major facilitator superfamily MFS_1  55.41 
 
 		 394 aa  347  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.630877  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3692  general substrate transporter  51.5 
 
 		 430 aa  346  6e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1816  major facilitator transporter  57.7 
 
 		 405 aa  344  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17740  MFS transporter  49.88 
 
 		 412 aa  335  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0882  major facilitator family transporter  55.07 
 
 		 403 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158047  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1044  major facilitator family transporter  55.07 
 
 		 403 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3138  major facilitator transporter  49.19 
 
 		 400 aa  332  8e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0341  major facilitator family transporter  55.07 
 
 		 403 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6824  major facilitator transporter  52.88 
 
 		 398 aa  331  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0640  major facilitator family transporter  55.07 
 
 		 403 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286289  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2475  major facilitator family transporter  55.07 
 
 		 403 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0885  major facilitator family transporter  55.07 
 
 		 403 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.106194  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0088  major facilitator family transporter  55.07 
 
 		 403 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3303  major facilitator transporter  50.57 
 
 		 396 aa  329  4e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3068  major facilitator family transporter  50.55 
 
 		 375 aa  328  9e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.547079  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2926  major facilitator transporter  49.07 
 
 		 401 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0235269  normal  0.894143 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5919  major facilitator transporter  52.97 
 
 		 403 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2612  major facilitator transporter  51.76 
 
 		 407 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1978  major facilitator transporter  51.76 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2588  major facilitator transporter  51.76 
 
 		 407 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.229839  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1998  major facilitator transporter  49.43 
 
 		 396 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.580365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2636  major facilitator transporter  53.23 
 
 		 408 aa  296  6e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2392  major facilitator family transporter  50.32 
 
 		 400 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23550  arabinose efflux permease family protein  44.9 
 
 		 416 aa  285  1.0000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.655191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0709  major facilitator transporter  51.77 
 
 		 399 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0373482  normal  0.416775 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33690  arabinose efflux permease family protein  43.72 
 
 		 399 aa  276  6e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3751  major facilitator superfamily MFS_1  41.82 
 
 		 410 aa  271  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.690184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34710  major facilitator transporter  49.12 
 
 		 417 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00447265  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24090  arabinose efflux permease family protein  44.15 
 
 		 447 aa  263  3e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2946  major facilitator family transporter  50.26 
 
 		 390 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0403  major facilitator superfamily MFS_1  46.36 
 
 		 394 aa  250  4e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00475007  normal  0.145448 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20320  arabinose efflux permease family protein  37.5 
 
 		 397 aa  229  5e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.352301  normal  0.179085 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2719  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 		 399 aa  227  3e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0908  major facilitator superfamily MFS_1  32.1 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.260847  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0932  major facilitator transporter  31.98 
 
 		 426 aa  159  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1023  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 		 432 aa  149  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  28.76 
 
 		 451 aa  145  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  28.76 
 
 		 451 aa  145  9e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 		 412 aa  145  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  28.76 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  28.76 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  28.76 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  30.43 
 
 		 394 aa  142  9e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  32.26 
 
 		 406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1113  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 383 aa  138  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000378306  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  29.95 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1024  major facilitator superfamily MFS_1  32.2 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.204165  normal  0.764355 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 		 395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2353  major facilitator transporter  32.5 
 
 		 413 aa  130  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1932  sugar efflux transporter  27.42 
 
 		 388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17258  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  28.94 
 
 		 401 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 404 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 407 aa  123  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  32.25 
 
 		 397 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 		 390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  28.45 
 
 		 396 aa  119  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 		 411 aa  119  9e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  32.57 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 407 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0707  sugar efflux transporter  28.57 
 
 		 394 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3267  sugar efflux transporter  30.37 
 
 		 413 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2428  sugar efflux transporter  30.37 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0595849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  32.83 
 
 		 399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  33.13 
 
 		 400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  25.99 
 
 		 396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0999  major facilitator family transporter  28.83 
 
 		 407 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196023  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5629  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208414  normal  0.0407096 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  26.84 
 
 		 402 aa  114  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 404 aa  114  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  27.91 
 
 		 402 aa  112  9e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  28.94 
 
 		 401 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  29.84 
 
 		 410 aa  110  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3026  major facilitator superfamily transporter  30 
 
 		 411 aa  110  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3594  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 393 aa  109  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.273434  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 398 aa  109  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 390 aa  108  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22240  arabinose efflux permease family protein  29.11 
 
 		 409 aa  109  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7381  permease  31.16 
 
 		 402 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0862221  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1381  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 394 aa  109  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10192  integral membrane protein  28.61 
 
 		 413 aa  109  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3560  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 408 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  28.98 
 
 		 397 aa  107  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3167  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 414 aa  106  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.508842  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3960  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2898  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 		 402 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.537958  normal  0.729301 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3791  sugar efflux transporter  27.51 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0663735  decreased coverage  0.000000695018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>