More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0032 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  84.11 
 
 
451 aa  643    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  84.38 
 
 
412 aa  641    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  100 
 
 
396 aa  771    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  84.11 
 
 
451 aa  643    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  84.38 
 
 
451 aa  644    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  84.38 
 
 
394 aa  642    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  84.38 
 
 
451 aa  644    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  84.38 
 
 
451 aa  644    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  46.32 
 
 
395 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  47.02 
 
 
403 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  47.02 
 
 
403 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2353  major facilitator transporter  45.2 
 
 
413 aa  301  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  46.46 
 
 
399 aa  301  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  47.45 
 
 
403 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2563  major facilitator transporter  48.21 
 
 
403 aa  299  6e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  45.67 
 
 
402 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  45.41 
 
 
408 aa  295  1e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3560  major facilitator transporter  46.18 
 
 
400 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  47.81 
 
 
379 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3960  major facilitator transporter  45.89 
 
 
400 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  42.49 
 
 
401 aa  283  4.0000000000000003e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1160  major facilitator superfamily MFS_1  40.91 
 
 
403 aa  282  7.000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000554807  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3800  major facilitator transporter  42.56 
 
 
420 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131241 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  42.04 
 
 
400 aa  280  4e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  38.28 
 
 
398 aa  270  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  40.31 
 
 
404 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  38.79 
 
 
410 aa  267  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0632  major facilitator transporter  38.52 
 
 
410 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  39.21 
 
 
400 aa  265  8e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1945  major facilitator transporter  39.74 
 
 
401 aa  263  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1579  major facilitator family transporter  42.78 
 
 
402 aa  262  6e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  41.23 
 
 
407 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0207  putative transporter transmembrane protein  39.89 
 
 
408 aa  262  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0835  major facilitator superfamily MFS_1  38.32 
 
 
433 aa  259  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  40.28 
 
 
401 aa  259  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  42.22 
 
 
404 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  37.89 
 
 
402 aa  259  7e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  40.33 
 
 
403 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5629  major facilitator transporter  42.82 
 
 
404 aa  256  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208414  normal  0.0407096 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6467  major facilitator transporter  40.33 
 
 
403 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.070181  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  39.3 
 
 
402 aa  256  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0719  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 
400 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2319  major facilitator superfamily MFS_1  37.43 
 
 
396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0805208  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0328  purine ribonucleoside efflux pump NepI  37.12 
 
 
397 aa  253  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5383  major facilitator transporter  40.28 
 
 
398 aa  252  6e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4887  major facilitator transporter  40.28 
 
 
398 aa  252  6e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0782  major facilitator superfamily MFS_1  39.19 
 
 
384 aa  252  9.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  38.83 
 
 
411 aa  251  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1136  major facilitator superfamily MFS_1  41.44 
 
 
408 aa  248  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4801  major facilitator transporter  40 
 
 
376 aa  243  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35500  Major facilitator superfamily transporter  39.62 
 
 
376 aa  243  5e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6830  major facilitator transporter  40.33 
 
 
394 aa  241  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2738  major facilitator superfamily MFS_1  35.77 
 
 
416 aa  239  8e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2011  major facilitator superfamily MFS_1  37.84 
 
 
409 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2475  major facilitator transporter  37.94 
 
 
402 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46904  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7381  permease  38.27 
 
 
402 aa  222  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0862221  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  37.29 
 
 
397 aa  216  8e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4854  major facilitator superfamily MFS_1  38.27 
 
 
395 aa  209  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011677  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  33.93 
 
 
412 aa  200  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2898  major facilitator superfamily MFS_1  37.07 
 
 
402 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.537958  normal  0.729301 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  32.09 
 
 
418 aa  182  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  32.71 
 
 
408 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 
402 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  33.69 
 
 
402 aa  177  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  31.82 
 
 
399 aa  176  8e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  31.58 
 
 
406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  33.13 
 
 
415 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2152  major facilitator transporter  33.43 
 
 
408 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2647  major facilitator family transporter  33.15 
 
 
408 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3182  major facilitator transporter  32.37 
 
 
413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 
415 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  33.33 
 
 
410 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1381  major facilitator transporter  32.21 
 
 
394 aa  159  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0427  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 
390 aa  159  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.064985  normal  0.054119 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  32.18 
 
 
390 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 
397 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4094  major facilitator superfamily MFS_1  30.27 
 
 
422 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  28.68 
 
 
404 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  29.35 
 
 
392 aa  146  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  29.62 
 
 
407 aa  146  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  30.42 
 
 
398 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  30.84 
 
 
735 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  32.06 
 
 
390 aa  140  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1788  major facilitator transporter  29.5 
 
 
399 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0140849 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  28.27 
 
 
397 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1499  sugar efflux transporter  28.41 
 
 
376 aa  137  5e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671324  normal  0.520287 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0839  sugar efflux transporter  29.08 
 
 
399 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  29.49 
 
 
405 aa  130  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22240  arabinose efflux permease family protein  26.7 
 
 
409 aa  129  6e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0868  sugar efflux transporter  28.49 
 
 
399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.202356  normal  0.905992 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3686  carbohydrate transporter, putative  30.45 
 
 
399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3194  sugar efflux transporter  29.89 
 
 
419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  27.35 
 
 
396 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1932  sugar efflux transporter  27.02 
 
 
388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17258  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1543  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
387 aa  126  8.000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329427  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  31.46 
 
 
402 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  26.36 
 
 
396 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2718  major facilitator superfamily MFS_1  31.49 
 
 
403 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00439118  normal  0.195622 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3791  sugar efflux transporter  27.18 
 
 
389 aa  124  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0663735  decreased coverage  0.000000695018 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3138  major facilitator transporter  27.6 
 
 
400 aa  122  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>