More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3182 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3182  major facilitator transporter  100 
 
 		 413 aa  801    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2647  major facilitator family transporter  97.55 
 
 		 408 aa  751    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2152  major facilitator transporter  97.06 
 
 		 408 aa  747    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  89.8 
 
 		 408 aa  707    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  41.58 
 
 		 418 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  41.41 
 
 		 412 aa  264  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  40.61 
 
 		 415 aa  255  9e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4094  major facilitator superfamily MFS_1  41.98 
 
 		 422 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  39.68 
 
 		 399 aa  250  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  40.77 
 
 		 401 aa  249  5e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  40.34 
 
 		 415 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  41.26 
 
 		 407 aa  239  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1381  major facilitator transporter  41.05 
 
 		 394 aa  231  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  40.42 
 
 		 401 aa  230  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  37.6 
 
 		 406 aa  226  4e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  38.54 
 
 		 402 aa  222  8e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  38.4 
 
 		 402 aa  216  5e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  40.95 
 
 		 735 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  42.82 
 
 		 390 aa  211  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 404 aa  209  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  37.73 
 
 		 397 aa  207  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  35.32 
 
 		 392 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  37.17 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  37.28 
 
 		 397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  38.76 
 
 		 398 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  37.01 
 
 		 403 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0860  major facilitator transporter  39.89 
 
 		 397 aa  199  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1788  major facilitator transporter  40.65 
 
 		 399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0140849 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  36.72 
 
 		 403 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  37.61 
 
 		 379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3686  carbohydrate transporter, putative  39.14 
 
 		 399 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  36.72 
 
 		 403 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  35.24 
 
 		 399 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2563  major facilitator transporter  37.01 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  34.15 
 
 		 398 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7381  permease  37.11 
 
 		 402 aa  195  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0862221  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3560  major facilitator transporter  36.42 
 
 		 400 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  37.08 
 
 		 404 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3960  major facilitator transporter  37.01 
 
 		 400 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  35.89 
 
 		 402 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5629  major facilitator transporter  38.55 
 
 		 404 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208414  normal  0.0407096 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  36.17 
 
 		 410 aa  188  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2353  major facilitator transporter  36.64 
 
 		 413 aa  188  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 402 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 400 aa  186  7e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 404 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  32.37 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  33.9 
 
 		 451 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  33.9 
 
 		 412 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  33.9 
 
 		 451 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  33.9 
 
 		 451 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  33.9 
 
 		 451 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  33.9 
 
 		 451 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  33.9 
 
 		 394 aa  182  6e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0328  purine ribonucleoside efflux pump NepI  33.76 
 
 		 397 aa  181  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0427  major facilitator superfamily MFS_1  35.87 
 
 		 390 aa  179  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.064985  normal  0.054119 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  33.7 
 
 		 410 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0632  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 410 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 		 407 aa  176  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  34.05 
 
 		 408 aa  175  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2898  major facilitator superfamily MFS_1  36.91 
 
 		 402 aa  173  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.537958  normal  0.729301 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2011  major facilitator superfamily MFS_1  32.64 
 
 		 409 aa  173  5.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  34.34 
 
 		 411 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2738  major facilitator superfamily MFS_1  31.5 
 
 		 416 aa  169  8e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  35.49 
 
 		 403 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6467  major facilitator transporter  35.49 
 
 		 403 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.070181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3800  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131241 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2718  major facilitator superfamily MFS_1  37.87 
 
 		 403 aa  160  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00439118  normal  0.195622 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2319  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 396 aa  160  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0805208  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2000  sugar efflux transporter  29.8 
 
 		 398 aa  159  7e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0207  putative transporter transmembrane protein  32.42 
 
 		 408 aa  158  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1160  major facilitator superfamily MFS_1  28.69 
 
 		 403 aa  156  6e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000554807  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5383  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 398 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4887  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 398 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1945  major facilitator transporter  31.86 
 
 		 401 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0839  sugar efflux transporter  32.79 
 
 		 399 aa  154  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1627  sugar efflux transporter  29.22 
 
 		 396 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1635  sugar efflux transporter  29.22 
 
 		 396 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.626484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1694  sugar efflux transporter  29.22 
 
 		 396 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0396225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1648  sugar efflux transporter  29.22 
 
 		 396 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1813  sugar efflux transporter  29.22 
 
 		 396 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  29.47 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  29.74 
 
 		 404 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35500  Major facilitator superfamily transporter  34.24 
 
 		 376 aa  150  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4854  major facilitator superfamily MFS_1  31.96 
 
 		 395 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011677  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2475  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 402 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  29.47 
 
 		 404 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  29.47 
 
 		 415 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  29.57 
 
 		 404 aa  150  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4801  major facilitator transporter  33.63 
 
 		 376 aa  149  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  28.46 
 
 		 404 aa  149  9e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 404 aa  149  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  28.46 
 
 		 404 aa  149  9e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  28.46 
 
 		 404 aa  149  9e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  30.14 
 
 		 396 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0835  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 		 433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  28.46 
 
 		 404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>