More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0207 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0207  putative transporter transmembrane protein  100 
 
 		 408 aa  774    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  70.96 
 
 		 404 aa  480  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5629  major facilitator transporter  68.07 
 
 		 404 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208414  normal  0.0407096 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  64.83 
 
 		 407 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  69.71 
 
 		 403 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6467  major facilitator transporter  69.71 
 
 		 403 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.070181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  62.92 
 
 		 400 aa  456  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  60.51 
 
 		 398 aa  454  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1945  major facilitator transporter  58.12 
 
 		 401 aa  432  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2475  major facilitator transporter  66.84 
 
 		 402 aa  429  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2738  major facilitator superfamily MFS_1  60.2 
 
 		 416 aa  429  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  60 
 
 		 402 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  60.95 
 
 		 411 aa  426  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0632  major facilitator transporter  62.36 
 
 		 410 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  62.08 
 
 		 410 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0328  purine ribonucleoside efflux pump NepI  56.96 
 
 		 397 aa  418  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4801  major facilitator transporter  61.02 
 
 		 376 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2011  major facilitator superfamily MFS_1  59.31 
 
 		 409 aa  408  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1136  major facilitator superfamily MFS_1  63.09 
 
 		 408 aa  408  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  56.46 
 
 		 402 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1160  major facilitator superfamily MFS_1  51.73 
 
 		 403 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000554807  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  56.08 
 
 		 404 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  53.97 
 
 		 402 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3800  major facilitator transporter  55.91 
 
 		 420 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131241 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1579  major facilitator family transporter  57.38 
 
 		 402 aa  346  5e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2319  major facilitator superfamily MFS_1  48.46 
 
 		 396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0805208  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  46.48 
 
 		 395 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2353  major facilitator transporter  46.7 
 
 		 413 aa  292  9e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4854  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 395 aa  288  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011677  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  47.63 
 
 		 403 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  47.08 
 
 		 403 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6830  major facilitator transporter  45.6 
 
 		 394 aa  281  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  41.49 
 
 		 401 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  46.8 
 
 		 403 aa  279  6e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0835  major facilitator superfamily MFS_1  44.76 
 
 		 433 aa  278  9e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0719  major facilitator superfamily MFS_1  45.86 
 
 		 400 aa  277  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  42.42 
 
 		 408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2563  major facilitator transporter  46.89 
 
 		 403 aa  272  6e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  47.78 
 
 		 399 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5383  major facilitator transporter  47.52 
 
 		 398 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4887  major facilitator transporter  47.52 
 
 		 398 aa  272  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  39.38 
 
 		 396 aa  270  2e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  47.03 
 
 		 379 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3560  major facilitator transporter  47.08 
 
 		 400 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0782  major facilitator superfamily MFS_1  46.2 
 
 		 384 aa  271  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3960  major facilitator transporter  47.08 
 
 		 400 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  39.78 
 
 		 451 aa  257  2e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  39.13 
 
 		 412 aa  257  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  39.78 
 
 		 451 aa  257  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  39.78 
 
 		 451 aa  258  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  39.78 
 
 		 451 aa  258  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  39.78 
 
 		 451 aa  258  2e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  39.78 
 
 		 394 aa  257  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35500  Major facilitator superfamily transporter  46.07 
 
 		 376 aa  250  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  40 
 
 		 400 aa  239  5e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  37.57 
 
 		 401 aa  224  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  40.62 
 
 		 397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7381  permease  37.53 
 
 		 402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0862221  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  32.11 
 
 		 418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 412 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  32 
 
 		 408 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 415 aa  176  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  35.61 
 
 		 402 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  35.61 
 
 		 399 aa  173  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1381  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 394 aa  173  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  33.96 
 
 		 410 aa  170  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  33.97 
 
 		 406 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2898  major facilitator superfamily MFS_1  35.37 
 
 		 402 aa  163  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.537958  normal  0.729301 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  33.63 
 
 		 415 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 407 aa  159  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 		 402 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 392 aa  157  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3182  major facilitator transporter  32.42 
 
 		 413 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  34.48 
 
 		 390 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 		 397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2647  major facilitator family transporter  31.87 
 
 		 408 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2152  major facilitator transporter  31.86 
 
 		 408 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 		 398 aa  147  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  34.38 
 
 		 735 aa  143  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4094  major facilitator superfamily MFS_1  33.81 
 
 		 422 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3194  sugar efflux transporter  35.38 
 
 		 419 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 397 aa  134  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1694  sugar efflux transporter  33.08 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0396225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1648  sugar efflux transporter  33.08 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1813  sugar efflux transporter  33.08 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1627  sugar efflux transporter  33.08 
 
 		 396 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1635  sugar efflux transporter  33.08 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.626484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0427  major facilitator superfamily MFS_1  33.04 
 
 		 390 aa  130  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.064985  normal  0.054119 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 404 aa  130  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5955  sugar efflux transporter  34.24 
 
 		 417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0541401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0932  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 426 aa  126  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2718  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00439118  normal  0.195622 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0839  sugar efflux transporter  30.57 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  28.01 
 
 		 404 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  29.4 
 
 		 396 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2000  sugar efflux transporter  32.69 
 
 		 398 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3594  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 393 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.273434  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  31.29 
 
 		 399 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  32.05 
 
 		 402 aa  124  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>