More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1945 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1945  major facilitator transporter  100 
 
 		 401 aa  784    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  67.77 
 
 		 407 aa  520  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  63.59 
 
 		 411 aa  477  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  62.98 
 
 		 398 aa  476  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  62.44 
 
 		 400 aa  466  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4801  major facilitator transporter  65.04 
 
 		 376 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  61.62 
 
 		 402 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0328  purine ribonucleoside efflux pump NepI  61.58 
 
 		 397 aa  448  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0632  major facilitator transporter  61.07 
 
 		 410 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  61.23 
 
 		 410 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0207  putative transporter transmembrane protein  58.67 
 
 		 408 aa  425  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1160  major facilitator superfamily MFS_1  56.06 
 
 		 403 aa  426  1e-118  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000554807  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  57.6 
 
 		 402 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  57.94 
 
 		 404 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  56.53 
 
 		 404 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5629  major facilitator transporter  59.44 
 
 		 404 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208414  normal  0.0407096 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  60.28 
 
 		 403 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6467  major facilitator transporter  60.28 
 
 		 403 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.070181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2475  major facilitator transporter  59.22 
 
 		 402 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2011  major facilitator superfamily MFS_1  55.1 
 
 		 409 aa  399  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2738  major facilitator superfamily MFS_1  52.39 
 
 		 416 aa  385  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  52.67 
 
 		 402 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1136  major facilitator superfamily MFS_1  57.07 
 
 		 408 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3800  major facilitator transporter  51.94 
 
 		 420 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131241 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2319  major facilitator superfamily MFS_1  48.16 
 
 		 396 aa  329  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0805208  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1579  major facilitator family transporter  53.35 
 
 		 402 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0835  major facilitator superfamily MFS_1  47.58 
 
 		 433 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0782  major facilitator superfamily MFS_1  48.65 
 
 		 384 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6830  major facilitator transporter  48.03 
 
 		 394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0719  major facilitator superfamily MFS_1  45.89 
 
 		 400 aa  301  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  43.68 
 
 		 395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5383  major facilitator transporter  48.81 
 
 		 398 aa  282  9e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4887  major facilitator transporter  48.81 
 
 		 398 aa  282  9e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4854  major facilitator superfamily MFS_1  45.74 
 
 		 395 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011677  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  41.8 
 
 		 401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35500  Major facilitator superfamily transporter  44.74 
 
 		 376 aa  275  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  39.74 
 
 		 396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 403 aa  269  5e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  42.75 
 
 		 408 aa  265  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  43.21 
 
 		 403 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2353  major facilitator transporter  44.29 
 
 		 413 aa  263  3e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2563  major facilitator transporter  42.43 
 
 		 403 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  42.94 
 
 		 403 aa  261  2e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  42.02 
 
 		 379 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3560  major facilitator transporter  42.29 
 
 		 400 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3960  major facilitator transporter  42.02 
 
 		 400 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  38.46 
 
 		 451 aa  256  4e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  38.46 
 
 		 451 aa  256  4e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  38.46 
 
 		 451 aa  256  4e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  38.46 
 
 		 451 aa  256  5e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 		 412 aa  256  5e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  40.59 
 
 		 400 aa  256  5e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  38.46 
 
 		 451 aa  256  5e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  38.46 
 
 		 394 aa  256  5e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  42.47 
 
 		 399 aa  253  6e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  36.96 
 
 		 401 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  37.83 
 
 		 397 aa  215  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 		 412 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  33.06 
 
 		 406 aa  176  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 		 415 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  32.5 
 
 		 415 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  34.05 
 
 		 399 aa  173  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  30.52 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7381  permease  34 
 
 		 402 aa  169  9e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0862221  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1381  major facilitator transporter  34.03 
 
 		 394 aa  168  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  34.45 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 		 390 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  31.15 
 
 		 407 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  31.45 
 
 		 410 aa  159  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 		 735 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 402 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22240  arabinose efflux permease family protein  28.77 
 
 		 409 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  31.05 
 
 		 408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3182  major facilitator transporter  31.86 
 
 		 413 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2898  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 		 402 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.537958  normal  0.729301 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2152  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2647  major facilitator family transporter  31.58 
 
 		 408 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4094  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 		 422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 		 397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  32.03 
 
 		 398 aa  139  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0860  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 397 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 392 aa  130  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0427  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 		 390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.064985  normal  0.054119 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3194  sugar efflux transporter  28.73 
 
 		 419 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0999  major facilitator family transporter  30.74 
 
 		 407 aa  127  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196023  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0932  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 426 aa  127  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2718  major facilitator superfamily MFS_1  30.96 
 
 		 403 aa  126  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00439118  normal  0.195622 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  30.53 
 
 		 405 aa  126  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  31.56 
 
 		 402 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 404 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5582  sugar efflux transporter  26.69 
 
 		 410 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5955  sugar efflux transporter  27 
 
 		 417 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0541401 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6308  sugar efflux transporter  26.4 
 
 		 394 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260956  normal  0.44314 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1023  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 		 432 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1627  sugar efflux transporter  29.26 
 
 		 396 aa  116  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1694  sugar efflux transporter  27.32 
 
 		 396 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0396225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1788  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 399 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0140849 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1813  sugar efflux transporter  27.32 
 
 		 396 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>