More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4902 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 735 aa  1428    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  60.98 
 
 		 407 aa  393  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  46.67 
 
 		 406 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  45.74 
 
 		 412 aa  279  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  47.66 
 
 		 402 aa  274  5.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  49.6 
 
 		 390 aa  273  7e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  47.31 
 
 		 402 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  39.58 
 
 		 418 aa  243  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  40 
 
 		 399 aa  237  7e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  41.09 
 
 		 408 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  43.28 
 
 		 410 aa  230  7e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  39.43 
 
 		 398 aa  227  7e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2647  major facilitator family transporter  40.67 
 
 		 408 aa  226  9e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3182  major facilitator transporter  40.48 
 
 		 413 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2152  major facilitator transporter  40.67 
 
 		 408 aa  226  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  40.46 
 
 		 415 aa  226  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  39.65 
 
 		 415 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4094  major facilitator superfamily MFS_1  37.89 
 
 		 422 aa  220  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0860  major facilitator transporter  44.36 
 
 		 397 aa  220  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  38.01 
 
 		 401 aa  219  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 		 397 aa  219  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1381  major facilitator transporter  40.93 
 
 		 394 aa  216  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  36.24 
 
 		 404 aa  215  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  39.18 
 
 		 392 aa  214  5.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0427  major facilitator superfamily MFS_1  44.12 
 
 		 390 aa  214  5.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.064985  normal  0.054119 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 		 397 aa  199  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  38.03 
 
 		 395 aa  194  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1788  major facilitator transporter  37.95 
 
 		 399 aa  194  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0140849 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  33.13 
 
 		 401 aa  191  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2353  major facilitator transporter  38.65 
 
 		 413 aa  190  9e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  35.39 
 
 		 400 aa  184  8.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1543  major facilitator superfamily MFS_1  40.21 
 
 		 387 aa  183  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329427  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  36 
 
 		 403 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2563  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 403 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  34.63 
 
 		 411 aa  181  4.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  35.52 
 
 		 399 aa  178  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  30.16 
 
 		 451 aa  178  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  30.16 
 
 		 451 aa  178  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  35.82 
 
 		 379 aa  178  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  30.16 
 
 		 451 aa  178  4e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  30.16 
 
 		 451 aa  178  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  30.16 
 
 		 451 aa  178  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7381  permease  36.68 
 
 		 402 aa  177  7e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0862221  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3560  major facilitator transporter  35.53 
 
 		 400 aa  177  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 		 412 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 404 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  32.66 
 
 		 402 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  32.28 
 
 		 408 aa  175  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 400 aa  175  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3960  major facilitator transporter  35.53 
 
 		 400 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2718  major facilitator superfamily MFS_1  40.79 
 
 		 403 aa  175  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00439118  normal  0.195622 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  35.03 
 
 		 403 aa  174  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3686  carbohydrate transporter, putative  35.64 
 
 		 399 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  30.65 
 
 		 394 aa  174  5.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  35.03 
 
 		 403 aa  174  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 397 aa  174  6.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  36.26 
 
 		 403 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6467  major facilitator transporter  36.26 
 
 		 403 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.070181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  33.7 
 
 		 402 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  34.47 
 
 		 407 aa  172  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1945  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 401 aa  172  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2898  major facilitator superfamily MFS_1  36.66 
 
 		 402 aa  171  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.537958  normal  0.729301 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 402 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5629  major facilitator transporter  35.18 
 
 		 404 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208414  normal  0.0407096 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2475  major facilitator transporter  36.29 
 
 		 402 aa  167  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22240  arabinose efflux permease family protein  35.45 
 
 		 409 aa  167  5.9999999999999996e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  35.46 
 
 		 404 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0632  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 410 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  32.76 
 
 		 410 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 404 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2319  major facilitator superfamily MFS_1  32.58 
 
 		 396 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0805208  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  29.49 
 
 		 396 aa  164  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2738  major facilitator superfamily MFS_1  33.05 
 
 		 416 aa  164  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1136  major facilitator superfamily MFS_1  36.01 
 
 		 408 aa  161  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4801  major facilitator transporter  33.15 
 
 		 376 aa  160  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 398 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0328  purine ribonucleoside efflux pump NepI  31.06 
 
 		 397 aa  159  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0207  putative transporter transmembrane protein  34.38 
 
 		 408 aa  157  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4887  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 398 aa  156  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5383  major facilitator transporter  30.96 
 
 		 398 aa  156  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1160  major facilitator superfamily MFS_1  29.27 
 
 		 403 aa  155  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000554807  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3800  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 420 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131241 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  32.04 
 
 		 404 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  31.43 
 
 		 404 aa  154  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35500  Major facilitator superfamily transporter  31.09 
 
 		 376 aa  154  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  31.43 
 
 		 404 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  31.43 
 
 		 404 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  31.43 
 
 		 404 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  31.43 
 
 		 404 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 404 aa  152  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2011  major facilitator superfamily MFS_1  34.65 
 
 		 409 aa  151  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  31.52 
 
 		 404 aa  150  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5207  major facilitator family transporter  31.77 
 
 		 394 aa  150  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0835  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 433 aa  150  8e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3424  major facilitator family transporter  31.07 
 
 		 404 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  31.17 
 
 		 415 aa  148  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 415 aa  148  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  32.21 
 
 		 404 aa  147  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0782  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 		 384 aa  147  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3447  major facilitator family transporter  31.17 
 
 		 404 aa  147  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>