More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7381 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7381  permease  100 
 
 		 402 aa  765    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0862221  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2898  major facilitator superfamily MFS_1  86.57 
 
 		 402 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.537958  normal  0.729301 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 401 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  38.44 
 
 		 396 aa  237  4e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  38.48 
 
 		 451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  38.48 
 
 		 451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  38.48 
 
 		 451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  38.48 
 
 		 394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84574 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  38.21 
 
 		 451 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  38.48 
 
 		 412 aa  234  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  38.21 
 
 		 451 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  42.49 
 
 		 403 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  42.49 
 
 		 403 aa  233  6e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  42.49 
 
 		 403 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  42.98 
 
 		 379 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  39.94 
 
 		 395 aa  229  5e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  43.29 
 
 		 399 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3960  major facilitator transporter  42.78 
 
 		 400 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3560  major facilitator transporter  42.49 
 
 		 400 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  42.13 
 
 		 401 aa  225  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2563  major facilitator transporter  42.29 
 
 		 403 aa  223  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3800  major facilitator transporter  39.2 
 
 		 420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131241 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  40.28 
 
 		 397 aa  221  3e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  36.73 
 
 		 408 aa  217  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  39.68 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2319  major facilitator superfamily MFS_1  35.03 
 
 		 396 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0805208  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  36.46 
 
 		 412 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2353  major facilitator transporter  40.22 
 
 		 413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0328  purine ribonucleoside efflux pump NepI  36.77 
 
 		 397 aa  208  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  38.15 
 
 		 402 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1579  major facilitator family transporter  37.87 
 
 		 402 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  36.22 
 
 		 404 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  35.42 
 
 		 398 aa  202  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  37.4 
 
 		 402 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  36.94 
 
 		 407 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  36.6 
 
 		 408 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  39.49 
 
 		 403 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6467  major facilitator transporter  39.49 
 
 		 403 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.070181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2011  major facilitator superfamily MFS_1  37.86 
 
 		 409 aa  199  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  35.38 
 
 		 400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  37.57 
 
 		 404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5629  major facilitator transporter  39.09 
 
 		 404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208414  normal  0.0407096 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1160  major facilitator superfamily MFS_1  36.8 
 
 		 403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000554807  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  37.68 
 
 		 400 aa  197  3e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  37.3 
 
 		 411 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0207  putative transporter transmembrane protein  37.57 
 
 		 408 aa  192  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  35.75 
 
 		 402 aa  190  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 399 aa  188  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 418 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  37.09 
 
 		 415 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  35.96 
 
 		 415 aa  187  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3182  major facilitator transporter  37.93 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2647  major facilitator family transporter  36.6 
 
 		 408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2152  major facilitator transporter  36.6 
 
 		 408 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4887  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 398 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5383  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 398 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2738  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 		 416 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1381  major facilitator transporter  36.12 
 
 		 394 aa  180  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  36.26 
 
 		 410 aa  179  7e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4094  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 422 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0632  major facilitator transporter  35.98 
 
 		 410 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 407 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  34.04 
 
 		 406 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2475  major facilitator transporter  38.93 
 
 		 402 aa  176  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1136  major facilitator superfamily MFS_1  37.33 
 
 		 408 aa  176  8e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6830  major facilitator transporter  35.26 
 
 		 394 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4854  major facilitator superfamily MFS_1  34.54 
 
 		 395 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011677  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1945  major facilitator transporter  34 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  33.07 
 
 		 397 aa  170  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  38.78 
 
 		 402 aa  170  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1788  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 399 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0140849 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4801  major facilitator transporter  35.95 
 
 		 376 aa  170  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  36.09 
 
 		 390 aa  169  9e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0835  major facilitator superfamily MFS_1  34.1 
 
 		 433 aa  166  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35500  Major facilitator superfamily transporter  33.72 
 
 		 376 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  35.34 
 
 		 735 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0782  major facilitator superfamily MFS_1  33.82 
 
 		 384 aa  160  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  34.48 
 
 		 398 aa  158  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0719  major facilitator superfamily MFS_1  33.89 
 
 		 400 aa  153  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3686  carbohydrate transporter, putative  32.74 
 
 		 399 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0427  major facilitator superfamily MFS_1  35.24 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.064985  normal  0.054119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 404 aa  146  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  33.77 
 
 		 410 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  32.18 
 
 		 392 aa  138  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3167  major facilitator transporter  32.44 
 
 		 414 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.508842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5225  sugar efflux transporter  29.28 
 
 		 397 aa  132  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000397206  normal  0.170795 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0839  sugar efflux transporter  28.65 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0868  sugar efflux transporter  27.49 
 
 		 399 aa  131  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.202356  normal  0.905992 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0707  sugar efflux transporter  29.18 
 
 		 394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  28.57 
 
 		 396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  27.58 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2000  sugar efflux transporter  29.55 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5955  sugar efflux transporter  29.16 
 
 		 417 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0541401 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2417  sugar efflux transporter  30.24 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  28.68 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2718  major facilitator superfamily MFS_1  34.99 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00439118  normal  0.195622 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6308  sugar efflux transporter  29.25 
 
 		 394 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260956  normal  0.44314 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0860  major facilitator transporter  33.68 
 
 		 397 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  28.68 
 
 		 415 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>