More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6830 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6830  major facilitator transporter  100 
 
 		 394 aa  761    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0835  major facilitator superfamily MFS_1  64.14 
 
 		 433 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0719  major facilitator superfamily MFS_1  62.66 
 
 		 400 aa  432  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0782  major facilitator superfamily MFS_1  64.5 
 
 		 384 aa  432  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35500  Major facilitator superfamily transporter  59.73 
 
 		 376 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5383  major facilitator transporter  56.73 
 
 		 398 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4887  major facilitator transporter  56.73 
 
 		 398 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  47.37 
 
 		 404 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  48.94 
 
 		 402 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1945  major facilitator transporter  46.44 
 
 		 401 aa  315  7e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  46.52 
 
 		 402 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3800  major facilitator transporter  47.07 
 
 		 420 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131241 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1160  major facilitator superfamily MFS_1  45.98 
 
 		 403 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000554807  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  47.22 
 
 		 407 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5629  major facilitator transporter  47.19 
 
 		 404 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208414  normal  0.0407096 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  46.83 
 
 		 404 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0632  major facilitator transporter  46.24 
 
 		 410 aa  297  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  43.12 
 
 		 398 aa  297  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  46.24 
 
 		 410 aa  296  5e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  45.28 
 
 		 400 aa  292  6e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  45.63 
 
 		 403 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6467  major facilitator transporter  45.63 
 
 		 403 aa  292  8e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.070181  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0207  putative transporter transmembrane protein  45.6 
 
 		 408 aa  291  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2011  major facilitator superfamily MFS_1  48.34 
 
 		 409 aa  290  3e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1136  major facilitator superfamily MFS_1  46.77 
 
 		 408 aa  288  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  41.71 
 
 		 411 aa  285  7e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  44.57 
 
 		 402 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  45.35 
 
 		 401 aa  283  5.000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1579  major facilitator family transporter  47.14 
 
 		 402 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2475  major facilitator transporter  48.64 
 
 		 402 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2738  major facilitator superfamily MFS_1  42.44 
 
 		 416 aa  280  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4801  major facilitator transporter  44.9 
 
 		 376 aa  279  7e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0328  purine ribonucleoside efflux pump NepI  41.97 
 
 		 397 aa  278  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  43.23 
 
 		 395 aa  276  4e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  44.74 
 
 		 403 aa  269  8e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  43.58 
 
 		 403 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  43.36 
 
 		 403 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  45 
 
 		 379 aa  262  6e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  38.93 
 
 		 394 aa  261  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84574 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  38.61 
 
 		 451 aa  260  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  38.87 
 
 		 412 aa  261  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  38.87 
 
 		 451 aa  261  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  38.61 
 
 		 451 aa  260  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  38.87 
 
 		 451 aa  261  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  38.87 
 
 		 451 aa  261  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2319  major facilitator superfamily MFS_1  43.1 
 
 		 396 aa  259  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0805208  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2353  major facilitator transporter  44.21 
 
 		 413 aa  259  6e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2563  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 403 aa  258  9e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 399 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  38.9 
 
 		 396 aa  257  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3560  major facilitator transporter  44.23 
 
 		 400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3960  major facilitator transporter  43.94 
 
 		 400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  37.99 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  40.72 
 
 		 408 aa  238  2e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  37.36 
 
 		 401 aa  228  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4854  major facilitator superfamily MFS_1  40.84 
 
 		 395 aa  213  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011677  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  35.62 
 
 		 412 aa  204  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  37.12 
 
 		 397 aa  192  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  34.15 
 
 		 418 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  36.81 
 
 		 415 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 415 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7381  permease  35.26 
 
 		 402 aa  180  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0862221  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  32.95 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1381  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  30.26 
 
 		 399 aa  159  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  33.9 
 
 		 402 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4094  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 422 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  34.44 
 
 		 410 aa  156  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2898  major facilitator superfamily MFS_1  35.04 
 
 		 402 aa  155  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.537958  normal  0.729301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  31.3 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 408 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 		 397 aa  147  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  30.94 
 
 		 407 aa  145  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2647  major facilitator family transporter  32.06 
 
 		 408 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2152  major facilitator transporter  32.06 
 
 		 408 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  32.77 
 
 		 390 aa  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3182  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 413 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 398 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  32.29 
 
 		 735 aa  140  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1788  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 399 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0140849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0860  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  26.61 
 
 		 394 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6308  sugar efflux transporter  27.12 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260956  normal  0.44314 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5582  sugar efflux transporter  26.54 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22240  arabinose efflux permease family protein  28.06 
 
 		 409 aa  124  4e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  26.09 
 
 		 396 aa  122  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5955  sugar efflux transporter  27.35 
 
 		 417 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0541401 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  30.23 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5225  sugar efflux transporter  25.47 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000397206  normal  0.170795 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 404 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6103  sugar efflux transporter  26.95 
 
 		 400 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.542417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1316  sugar efflux transporter  26.95 
 
 		 400 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6513  sugar efflux transporter  26.95 
 
 		 451 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0427  major facilitator superfamily MFS_1  32.33 
 
 		 390 aa  117  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.064985  normal  0.054119 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 392 aa  117  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1543  major facilitator superfamily MFS_1  30.47 
 
 		 387 aa  116  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3686  carbohydrate transporter, putative  30.26 
 
 		 399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  33.71 
 
 		 405 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 391 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>