More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1543 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1543  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 387 aa  725    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  39.66 
 
 		 406 aa  213  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  39.18 
 
 		 402 aa  213  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  40.91 
 
 		 390 aa  199  7e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  35.14 
 
 		 404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  37.67 
 
 		 407 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  36.88 
 
 		 397 aa  195  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  35.23 
 
 		 399 aa  182  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 401 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  39.26 
 
 		 403 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  38.96 
 
 		 403 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  40.33 
 
 		 735 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  33.85 
 
 		 412 aa  176  5e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  36.68 
 
 		 398 aa  176  7e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  34.3 
 
 		 415 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  38.03 
 
 		 392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  37.36 
 
 		 410 aa  172  6.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  38.53 
 
 		 403 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  38.03 
 
 		 402 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 415 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  37.54 
 
 		 399 aa  166  8e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 379 aa  166  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22240  arabinose efflux permease family protein  34.99 
 
 		 409 aa  164  3e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  31.59 
 
 		 396 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3960  major facilitator transporter  38.53 
 
 		 400 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0839  sugar efflux transporter  32.3 
 
 		 399 aa  162  7e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.359878 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3560  major facilitator transporter  38.23 
 
 		 400 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2563  major facilitator transporter  37.61 
 
 		 403 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 404 aa  161  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0868  sugar efflux transporter  30.73 
 
 		 399 aa  160  4e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.202356  normal  0.905992 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  32.01 
 
 		 408 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0427  major facilitator superfamily MFS_1  39.35 
 
 		 390 aa  159  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.064985  normal  0.054119 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  34.34 
 
 		 418 aa  159  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 401 aa  159  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  34.88 
 
 		 400 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1499  sugar efflux transporter  30.65 
 
 		 376 aa  157  3e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671324  normal  0.520287 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2647  major facilitator family transporter  32.19 
 
 		 408 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4094  major facilitator superfamily MFS_1  33.05 
 
 		 422 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2152  major facilitator transporter  32.19 
 
 		 408 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 411 aa  153  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3594  major facilitator transporter  34.63 
 
 		 393 aa  153  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.273434  normal  0.575034 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1381  major facilitator transporter  35.42 
 
 		 394 aa  152  8e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  32.64 
 
 		 398 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3182  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 413 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1788  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0140849 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3194  sugar efflux transporter  31.18 
 
 		 419 aa  151  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  32.82 
 
 		 397 aa  150  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5225  sugar efflux transporter  31.84 
 
 		 397 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000397206  normal  0.170795 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2000  sugar efflux transporter  32.02 
 
 		 398 aa  150  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  34.97 
 
 		 391 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  30.88 
 
 		 390 aa  150  5e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2428  sugar efflux transporter  31.93 
 
 		 408 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0595849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1627  sugar efflux transporter  32.66 
 
 		 396 aa  149  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1694  sugar efflux transporter  32.66 
 
 		 396 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0396225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1648  sugar efflux transporter  32.66 
 
 		 396 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1813  sugar efflux transporter  32.66 
 
 		 396 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3267  sugar efflux transporter  32.04 
 
 		 413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0999  major facilitator family transporter  30.97 
 
 		 407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196023  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  35.96 
 
 		 397 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2718  major facilitator superfamily MFS_1  36.09 
 
 		 403 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00439118  normal  0.195622 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4066  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1635  sugar efflux transporter  32.66 
 
 		 396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.626484  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  34.39 
 
 		 391 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0860  major facilitator transporter  35.86 
 
 		 397 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  30.98 
 
 		 396 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  33.53 
 
 		 399 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 		 412 aa  146  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0328  purine ribonucleoside efflux pump NepI  32.9 
 
 		 397 aa  146  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2201  sugar efflux transporter  30.54 
 
 		 407 aa  146  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480922  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  29.35 
 
 		 451 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  29.35 
 
 		 451 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  29.35 
 
 		 451 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5224  major facilitator family transporter  29.44 
 
 		 404 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  34.45 
 
 		 395 aa  145  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  34.85 
 
 		 404 aa  145  9e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27130  sugar efflux transporter  30.97 
 
 		 405 aa  145  9e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.605914  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  29.86 
 
 		 394 aa  145  9e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84574 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  29.35 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  29.95 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1201  major facilitator transporter  34 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.915784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  29.35 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1932  sugar efflux transporter  30.68 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17258  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  35.9 
 
 		 391 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4932  major facilitator family transporter  29.19 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4773  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4793  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5955  sugar efflux transporter  30.52 
 
 		 417 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0541401 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  33.52 
 
 		 408 aa  145  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5309  major facilitator family transporter  29.19 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 400 aa  145  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5175  major facilitator family transporter  29.19 
 
 		 404 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00541123 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 415 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  32.51 
 
 		 404 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  36.86 
 
 		 378 aa  144  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2417  sugar efflux transporter  32.26 
 
 		 395 aa  143  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  31.59 
 
 		 410 aa  143  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  30.77 
 
 		 394 aa  142  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0632  major facilitator transporter  31.32 
 
 		 410 aa  142  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  31.67 
 
 		 402 aa  142  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10750  sugar efflux transporter  30.71 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>