More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0118 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0118  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
433 aa  828    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.254663  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0251  sugar efflux transporter  40.05 
 
 
406 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5582  sugar efflux transporter  29.49 
 
 
410 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6308  sugar efflux transporter  29.49 
 
 
394 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260956  normal  0.44314 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3194  sugar efflux transporter  29.66 
 
 
419 aa  143  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6513  sugar efflux transporter  28.27 
 
 
451 aa  143  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7038  sugar efflux transporter  28.91 
 
 
394 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.626872 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6103  sugar efflux transporter  28.47 
 
 
400 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.542417  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1316  sugar efflux transporter  28.33 
 
 
400 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5225  sugar efflux transporter  28.18 
 
 
397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000397206  normal  0.170795 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0980  sugar efflux transporter  29.01 
 
 
396 aa  140  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2000  sugar efflux transporter  28.5 
 
 
398 aa  139  7e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1627  sugar efflux transporter  28.88 
 
 
396 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1813  sugar efflux transporter  29.14 
 
 
396 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1694  sugar efflux transporter  29.14 
 
 
396 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0396225  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1648  sugar efflux transporter  29.14 
 
 
396 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1635  sugar efflux transporter  29.09 
 
 
396 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.626484  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2201  sugar efflux transporter  28.4 
 
 
407 aa  136  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.480922  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10750  sugar efflux transporter  29.31 
 
 
396 aa  132  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  33.72 
 
 
390 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  31.44 
 
 
406 aa  130  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  33.72 
 
 
390 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  33.72 
 
 
390 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  33.72 
 
 
390 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  33.72 
 
 
390 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  33.72 
 
 
390 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  27.6 
 
 
396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  33.43 
 
 
390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  33.05 
 
 
397 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  29.92 
 
 
391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3167  major facilitator transporter  27.94 
 
 
414 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.508842  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1932  sugar efflux transporter  25.27 
 
 
388 aa  127  5e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17258  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0208  major facilitator transporter  30.08 
 
 
400 aa  126  6e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10192  integral membrane protein  30.39 
 
 
413 aa  125  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  31.52 
 
 
391 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  33.33 
 
 
390 aa  124  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  29.13 
 
 
391 aa  123  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  31.18 
 
 
392 aa  124  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  29.29 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  29.81 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  29.66 
 
 
400 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  32.78 
 
 
406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  28.87 
 
 
391 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  28.16 
 
 
404 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  29.29 
 
 
391 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  30.34 
 
 
389 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  30.34 
 
 
389 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  30.34 
 
 
389 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  30.77 
 
 
389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2718  major facilitator transporter  30.87 
 
 
409 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.377036  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  31.36 
 
 
391 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0136  sugar efflux transporter  29.64 
 
 
395 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5955  sugar efflux transporter  28.91 
 
 
417 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0541401 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  30.99 
 
 
389 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  31.12 
 
 
391 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2530  major facilitator transporter  30.08 
 
 
408 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  31.51 
 
 
405 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0451  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 
405 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00452122  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2417  sugar efflux transporter  28.39 
 
 
395 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0865  sugar efflux transporter  28.7 
 
 
402 aa  118  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  31.32 
 
 
391 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  30.33 
 
 
408 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  31.78 
 
 
388 aa  117  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  31.32 
 
 
391 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  31.66 
 
 
391 aa  117  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  29.35 
 
 
392 aa  116  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10110  putative transporter  30.48 
 
 
394 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000108859  normal  0.939917 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  30.95 
 
 
416 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  32.07 
 
 
391 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0999  major facilitator family transporter  28.48 
 
 
407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196023  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  30.79 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2322  sugar efflux transporter  27.51 
 
 
393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2073  sugar efflux transporter  28.35 
 
 
399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0958  major facilitator superfamily transporter  31.48 
 
 
399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.596734  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2428  sugar efflux transporter  27.61 
 
 
408 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0595849  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0138  sugar efflux transporter  29.09 
 
 
395 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1849  major facilitator transporter  30.08 
 
 
401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.221742  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2540  major facilitator superfamily protein MFS_1  31.34 
 
 
388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 
404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  30.14 
 
 
390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0037  major facilitator family transporter  27.76 
 
 
404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000189169 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  30.85 
 
 
391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  31.03 
 
 
391 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2390  putative transmembrane efflux transmembrane protein  30.35 
 
 
397 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.503171 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0946  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 
407 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3762  major facilitator transporter  31.41 
 
 
400 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.147545  normal  0.211632 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0945  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 
409 aa  114  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3267  sugar efflux transporter  27.61 
 
 
413 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5211  major facilitator family transporter  27.81 
 
 
404 aa  113  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0707  sugar efflux transporter  27.67 
 
 
394 aa  113  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4894  major facilitator transporter  27.44 
 
 
404 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0908  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 
383 aa  113  9e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.260847  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  32.35 
 
 
393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  28.53 
 
 
388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  30.6 
 
 
391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3597  major facilitator transporter  27.81 
 
 
398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3194  major facilitator family transporter  26.65 
 
 
415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1201  major facilitator transporter  30.92 
 
 
383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.915784  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  29.82 
 
 
388 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>