132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3196 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  100 
 
 
408 aa  778    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  57.28 
 
 
426 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  63.38 
 
 
387 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  61.08 
 
 
391 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  62.47 
 
 
387 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  62.47 
 
 
387 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  63.58 
 
 
387 aa  368  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  60.73 
 
 
386 aa  350  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  60.9 
 
 
404 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  41.44 
 
 
404 aa  288  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  44.35 
 
 
389 aa  265  8e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  45.99 
 
 
399 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  42.65 
 
 
369 aa  256  7e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  40.36 
 
 
411 aa  254  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  41.62 
 
 
390 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  43.68 
 
 
393 aa  236  7e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  42.74 
 
 
395 aa  224  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  42.61 
 
 
397 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  38.86 
 
 
402 aa  216  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  38.46 
 
 
402 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  37.82 
 
 
402 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  37.96 
 
 
410 aa  192  7e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  36.95 
 
 
410 aa  186  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  33.14 
 
 
397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  39.83 
 
 
400 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  39.83 
 
 
397 aa  172  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  36.45 
 
 
416 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  34.92 
 
 
399 aa  157  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  37.39 
 
 
400 aa  152  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  34.13 
 
 
399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  31.54 
 
 
425 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  29.75 
 
 
417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 
411 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 
408 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  32.66 
 
 
414 aa  138  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 
408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  34.32 
 
 
432 aa  137  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  32.59 
 
 
414 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  31.02 
 
 
402 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  29.54 
 
 
416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  29.67 
 
 
400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  32.07 
 
 
442 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  30.36 
 
 
402 aa  130  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  30.03 
 
 
397 aa  129  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 
396 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  30.95 
 
 
408 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  33.33 
 
 
416 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  33.33 
 
 
416 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  31.82 
 
 
369 aa  124  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  33.06 
 
 
401 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  30.08 
 
 
405 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  30.83 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  34.24 
 
 
403 aa  109  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  30.94 
 
 
403 aa  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 
414 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 
415 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  29.44 
 
 
415 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  28.21 
 
 
433 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 
419 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1547  major facilitator transporter  28.38 
 
 
394 aa  98.6  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  31.63 
 
 
404 aa  98.6  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 
422 aa  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  31.39 
 
 
409 aa  77.8  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6024  major facilitator transporter  32.83 
 
 
385 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252453  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  28.27 
 
 
216 aa  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2258  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 
421 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  25.73 
 
 
409 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  26.59 
 
 
486 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  28.34 
 
 
411 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  28.88 
 
 
410 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  27.32 
 
 
434 aa  59.7  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  28.15 
 
 
417 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  27.66 
 
 
414 aa  59.3  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  27.85 
 
 
407 aa  58.9  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  31.28 
 
 
410 aa  56.2  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  27.47 
 
 
425 aa  56.6  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  28.5 
 
 
408 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  26.94 
 
 
409 aa  55.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  28.34 
 
 
411 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  28.34 
 
 
411 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  25.2 
 
 
400 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  24.72 
 
 
430 aa  53.5  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4386  major facilitator transporter  28.95 
 
 
405 aa  53.1  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185131  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  24.72 
 
 
442 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  23.98 
 
 
402 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 
405 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3546  major facilitator superfamily MFS_1  24.91 
 
 
431 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  23.75 
 
 
437 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2216  major facilitator transporter  28 
 
 
410 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.744121  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1296  major facilitator transporter  26.09 
 
 
435 aa  51.6  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2672  major facilitator transporter  26.18 
 
 
412 aa  50.8  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  25.48 
 
 
528 aa  50.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
405 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  25.55 
 
 
405 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 
433 aa  50.1  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16310  major facilitator superfamily transporter  27.13 
 
 
402 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2093  major facilitator transporter  28.62 
 
 
410 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  22.69 
 
 
436 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1684  major facilitator transporter  24.08 
 
 
406 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  26.81 
 
 
413 aa  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.852259 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>