More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5599 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  100 
 
 		 409 aa  801    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  39.06 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  35.58 
 
 		 402 aa  209  9e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0875  major facilitator transporter  34.28 
 
 		 403 aa  204  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3196  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 414 aa  182  8.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0711  major facilitator transporter  30.89 
 
 		 410 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6118  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 409 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 397 aa  172  6.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6406  major facilitator transporter  33.6 
 
 		 409 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4891  major facilitator transporter  36.46 
 
 		 409 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.390253  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3273  major facilitator transporter  36.46 
 
 		 409 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0542458 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6916  major facilitator transporter  36.46 
 
 		 409 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  28.49 
 
 		 423 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  27.95 
 
 		 423 aa  139  7.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  28.49 
 
 		 423 aa  139  7.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 388 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  29.44 
 
 		 421 aa  126  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 404 aa  119  7e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 414 aa  103  7e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3637  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 405 aa  102  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.476152  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 404 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  27.68 
 
 		 373 aa  93.2  7e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3739  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 403 aa  92.4  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0679  major facilitator transporter  42.14 
 
 		 357 aa  92  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.853953  normal  0.143761 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 408 aa  86.7  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4231  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 		 388 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2090  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.106737  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3646  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 410 aa  77  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  0.71441 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  24.19 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  26.67 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2576  major facilitator superfamily MFS_1  29.56 
 
 		 420 aa  72.8  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.309715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  32.64 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  23.67 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 443 aa  66.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2079  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.816032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  25.07 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 		 383 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0113  major facilitator superfamily permease  29.11 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000201698  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  30.23 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2358  major facilitator superfamily MFS_1  29.52 
 
 		 439 aa  63.2  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1899  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  23.16 
 
 		 384 aa  60.8  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  23.03 
 
 		 399 aa  60.5  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2392  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1802  permease; multidrug resistance protein  25.35 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  28.99 
 
 		 426 aa  59.7  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 421 aa  59.7  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1920  major facilitator superfamily permease  25.09 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000507154  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1706  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.20478  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  26 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3292  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  25.45 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  30.43 
 
 		 526 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2085  putative multidrug resistance protein  25.07 
 
 		 432 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000147189  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  27.39 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  28.34 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2523  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  25.87 
 
 		 461 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.108392 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  23.23 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2445  putative multidrug resistance protein  27.51 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1819  multidrug resistance protein  25.07 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.310045  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 		 414 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2023  putative multidrug resistance protein  25.07 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.52874e-46 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 405 aa  57  0.0000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3339  putative multidrug resistance protein  25.07 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000037408 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  30.51 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  23.03 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3218  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 385 aa  56.6  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5860  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 447 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2371  major facilitator superfamily MFS_1  22.98 
 
 		 425 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4843  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 442 aa  56.2  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000178164  normal  0.0122394 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  26.74 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  28.92 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0010  multidrug-efflux transporter  25.16 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0391  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.6 
 
 		 530 aa  55.8  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.979828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2471  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 466 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2519  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 466 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.787285  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  26.74 
 
 		 411 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  23.5 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6693  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43281  MFS family transporter: sugar  27.96 
 
 		 488 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.210537  normal  0.0304903 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  31.21 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0505  major facilitator transporter  40.54 
 
 		 449 aa  55.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 850 aa  55.1  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>