87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0517 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  100 
 
 		 404 aa  733    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  63.84 
 
 		 426 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  68.75 
 
 		 391 aa  436  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  61.82 
 
 		 387 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  63.61 
 
 		 387 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  63.61 
 
 		 387 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  68.66 
 
 		 387 aa  393  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  68.39 
 
 		 386 aa  385  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  63.33 
 
 		 408 aa  375  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  44.97 
 
 		 404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  46.56 
 
 		 389 aa  282  7.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  45.61 
 
 		 369 aa  276  5e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  49.05 
 
 		 399 aa  257  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 411 aa  256  6e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  45.8 
 
 		 397 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  41.03 
 
 		 390 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  45.92 
 
 		 395 aa  227  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  43.75 
 
 		 393 aa  220  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  41.06 
 
 		 402 aa  216  8e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  40.21 
 
 		 402 aa  213  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 397 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  40.27 
 
 		 402 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  37.54 
 
 		 410 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 400 aa  170  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  36.78 
 
 		 410 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  40.06 
 
 		 397 aa  164  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  35.25 
 
 		 416 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  40.33 
 
 		 400 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  35.16 
 
 		 399 aa  157  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  33.97 
 
 		 417 aa  154  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  34.95 
 
 		 425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  33.58 
 
 		 411 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  35.34 
 
 		 399 aa  142  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  34.14 
 
 		 408 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  36.16 
 
 		 416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  36.16 
 
 		 416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  32.14 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  33.43 
 
 		 408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  32.28 
 
 		 396 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 400 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  35.59 
 
 		 397 aa  130  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  32.23 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  35.62 
 
 		 401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 432 aa  124  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  34.05 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  31.04 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  33.52 
 
 		 403 aa  120  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  32.96 
 
 		 414 aa  119  7e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  37.26 
 
 		 404 aa  116  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  33.05 
 
 		 395 aa  110  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 408 aa  109  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  31.4 
 
 		 442 aa  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  35.77 
 
 		 419 aa  106  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 		 405 aa  102  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1547  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 394 aa  101  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 416 aa  100  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  30.87 
 
 		 415 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  29.66 
 
 		 414 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 403 aa  90.5  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 		 415 aa  86.7  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  31.01 
 
 		 433 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6024  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252453  normal  0.0648485 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  36.09 
 
 		 409 aa  79.7  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2258  major facilitator superfamily MFS_1  40.52 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  30.6 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  30.62 
 
 		 216 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  31.4 
 
 		 433 aa  53.9  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3503  major facilitator transporter  27.31 
 
 		 436 aa  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993279  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  28.15 
 
 		 410 aa  46.6  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  33.54 
 
 		 405 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 427 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 409 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 486 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  27.15 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2363  putative MFS permease  26.94 
 
 		 414 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3320  hypothetical protein  45.57 
 
 		 151 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0117954  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 405 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  27.05 
 
 		 425 aa  43.5  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0305  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 422 aa  43.5  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5287  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 405 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0508736  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 403 aa  43.5  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 411 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1793  hypothetical protein  21.8 
 
 		 184 aa  43.1  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>