217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4718 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4718  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 419 aa  773    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.520659  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5387  major facilitator superfamily MFS_1  50.38 
 
 		 416 aa  325  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.578903 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4221  major facilitator transporter  53.83 
 
 		 416 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4287  major facilitator superfamily transporter  53.83 
 
 		 416 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0217  major facilitator transporter  53.01 
 
 		 403 aa  314  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  56.28 
 
 		 405 aa  311  1e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4599  major facilitator transporter  53.83 
 
 		 401 aa  309  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0252819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3219  major facilitator superfamily transporter  51.34 
 
 		 395 aa  293  5e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4495  major facilitator superfamily MFS_1  53.42 
 
 		 409 aa  257  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.675529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1580  major facilitator superfamily MFS_1  51.82 
 
 		 404 aa  257  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0196311 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  37.16 
 
 		 415 aa  187  4e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0632  major facilitator transporter  37.4 
 
 		 442 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  35.58 
 
 		 408 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0211  major facilitator superfamily MFS_1  31.42 
 
 		 408 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3399  major facilitator transporter  33.86 
 
 		 417 aa  156  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3237  major facilitator transporter  33.95 
 
 		 425 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8610  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.452747 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0648  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 		 410 aa  147  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0297226 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3887  major facilitator transporter  35.38 
 
 		 389 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4966  major facilitator superfamily transporter transmembrane protein  34.96 
 
 		 415 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6301  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 410 aa  140  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5421  major facilitator superfamily MFS_1  33.61 
 
 		 433 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3134  putative MSF transporter transmembrane protein  34.05 
 
 		 414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1839  major facilitator transporter  32.6 
 
 		 402 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.772479  hitchhiker  0.00932819 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4124  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 402 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.278491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1334  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6069  hypothetical protein  32.45 
 
 		 416 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2420  major facilitator superfamily MFS_1  31.83 
 
 		 411 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.260445 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1050  major facilitator superfamily MFS_1  35.82 
 
 		 391 aa  124  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4892  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 399 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3969  major facilitator transporter  34 
 
 		 432 aa  119  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4051  major facilitator superfamily MFS_1  32.86 
 
 		 426 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1402  major facilitator transporter  32.59 
 
 		 387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  0.736528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7238  major facilitator superfamily MFS_1  38.29 
 
 		 400 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1391  major facilitator transporter  32.34 
 
 		 387 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.941995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3796  major facilitator superfamily MFS_1  40.33 
 
 		 422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3257  major facilitator transporter  34.12 
 
 		 411 aa  110  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2732  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 387 aa  110  6e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.794636  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0467  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 403 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1916  major facilitator transporter  34.1 
 
 		 387 aa  106  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3121  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3196  major facilitator transporter  30 
 
 		 408 aa  103  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881104  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2295  major facilitator superfamily transporter  30.03 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.975797  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4143  major facilitator superfamily transporter  30.21 
 
 		 402 aa  101  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0327  major facilitator transporter  33.7 
 
 		 397 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0517  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 404 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159005  hitchhiker  0.00108561 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2660  integral membrane transport protein  40.23 
 
 		 216 aa  99  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1229  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 404 aa  95.1  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0643  major facilitator transporter  34.1 
 
 		 400 aa  92.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.958132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1517  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 399 aa  92  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305903  normal  0.799491 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2995  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 369 aa  88.2  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 		 437 aa  86.3  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4434  major facilitator transporter  41.29 
 
 		 393 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2181  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4437  major facilitator superfamily MFS_1  23.21 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.483718 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5581  major facilitator superfamily permease  28.57 
 
 		 395 aa  80.5  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.136738 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1342  major facilitator superfamily MFS_1  35.88 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0894856  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1381  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0419667 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2449  major facilitator transporter  34.36 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2518  major facilitator superfamily transporter  35.88 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  hitchhiker  0.00753009 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1064  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  34.76 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1573  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.120591 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 430 aa  72  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  33.13 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  33.13 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0642  major facilitator transporter  30.88 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  28.52 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  28.21 
 
 		 405 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03970  transporter, putative  26.3 
 
 		 539 aa  67.8  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 		 430 aa  67  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 442 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2258  major facilitator superfamily MFS_1  34.36 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3101  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627117 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  32.32 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  26.26 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1344  MFS permease  26.52 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105092  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1547  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 394 aa  62  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.197507 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3192  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 413 aa  60.5  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.1684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5076  major facilitator superfamily permease protein  24.04 
 
 		 512 aa  60.1  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  28.66 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  25.93 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  33.55 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03722  MFS monocarboxylate transporter (Mct), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17360)  27.68 
 
 		 482 aa  57.8  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  34.27 
 
 		 415 aa  57  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  25.71 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0486  oxalate/formate antiporter  25.99 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.65082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>